Pour retrouver l'insaisissable criminel surnommé «Le Hollandais «, Peter Burke, agent au FBI, décide de faire équipe avec le prisonnier Neal Caffrey, un escroc au talent hors pair...

Peter est en prison, accusé à tort du meurtre du sénateur Pratt. Le vrai coupable, le père de Neal, est en fuite. Déterminé à innocenter son coéquipier, Neal passe un marché avec Curtis Hagen, un escroc qu'il a lui-même fait incarcérer pour trafic d'oeuvres d'art. En échange de la libération de Peter, Neal doit voler un trésor. Mais, quand Peter est enfin libre, Curtis continue son chantage sur Neal...

Alors que Peter s'habitue à son nouveau poste au sein du FBI, Curtis Hagen ordonne à Neal de commettre un vol pour lui. Neal doit dérober le chapitre 13 du Codex de Mosconi, un livre qu'il est interdit d'ouvrir et qui est gardé sous haute surveillance dans un musée...

Neal et Peter sont chargés d'une affaire peu commune pour le musée d'Histoire naturelle : le squelette d'un Tyrannosaurus Rex ainsi que son œuf ont été volés. Par ailleurs, Peter découvre que Neal entretient une relation avec Rebecca mais qu'il lui cache sa véritable identité…

Bien que conscient que la trahison de Neal a joué un rôle dans sa sortie de prison, Peter n'arrive pas à lui pardonner et songe à accepter un nouveau poste à Washington. Curtis Hagen kidnappe Rebecca et fait pression sur Neal et Mozzie pour qu'ils décryptent le message caché du Codex qui mènerait à un mystérieux trésor...

Après avoir découvert que Rebecca lui a menti, Neal dévoile toute la vérité sur le Codex à Peter, apaisant ainsi les tensions entre eux. Tous deux découvrent que les assassins de Curtis Hagen et de Siegel sont une seule et même personne... Déterminé à arrêter Rebecca, Peter lui tend un piège en se servant de Neal comme appât...