Загадкова подія, яку назвали «Злиттям», охоплює всесвіт. Ніндзя-початківець разом із кмітливою інженеркою шукають свій шлях у новому й незнайомому світі.

Ерін і Сора розкривають у собі нові здібності, завдяки яким вони можуть протистояти мисливцям на драконів. Чи навчить їх Зелений ніндзя користуватися цим даром?

У день тренування Ерін і Сора тікають із монастиря, щоб відвідати карнавал та перевірити свої здібності, розкривши лиху змову.

Дирижабль «Баунті» повертається без капітана. Ерін, Сора та Ллойд намагаються дізнатися, що трапилося з Каєм. Це пастка… чи щось гірше?

Щоб урятувати Хмарне Царство, ніндзі повинні разом відправити жахливого монстра з мацаками туди, звідки він з’явився, а також швидко зупинити злиттєтрус.

Ніндзі зустрічають рівносильного суперника — Фотака, високотехнологічного звіра, якого неможливо знищити. Сора вважає, що лише подорож до Імперіуму допоможе його перемогти.

В Імперіумі Ерін навчає команду молодих борців зі злочинністю. Сора протистоїть лиходію зі свого минулого. Ллойд звільняє з в’язниці майстра стихії.

Щоб витягнути драконів з Імперіуму, ніндзям доведеться наполегливо працювати, швидко думати та знайти рішення! Якщо монстри не випередять їх.

Зламавши систему Імперіуму, Сора намагається знайти Раю. Нія та Кай досліджують загадковий прохід. Ллойд очолює бій проти армії технозвірів.

Ніндзі не здаються! Нія, Кай і Зейн стають новою надією в битві проти Імперіуму, а Ллойд розкриває таємницю, поховану глибоко під містом.

To stop the MergeQuakes from getting worse, the Ninja travel to the Temple of the Dragon Cores to learn more about something called "The Coalescence."

When the Ninja split up to find the three Dragon Cores, Arin and Lloyd take the airship but soon need help from a village of peaceful algae farmers.

Mr. Frohicky and Zane head to the Crossroads to locate a Wyconium coil. Elsewhere, Wyldfyre's pranks complicate her and Kai's Dragon Core quest.

Nya's Seeker Stones lead her and Sora to something they weren't searching for. As Zane's Assistant Keeper, Mr. Frohicky can't do anything right.

Sora and Nya search for the Dragon Core with a magical compass. Arin and Lloyd get put to the test in Mother Garden. Wyldfyre and Kai play keep-away.

In the Land of Lost Things, Nya runs into an old pal while Sora looks for an alternate power source to ward off a junkyard monster called "The Hoarder."

Lloyd and Arin arrive in the Administration, where they learn the Dragon Core will be demolished if they don't act fast — and file the correct paperwork.

While the Ninja try to figure out a way to bypass Imperium's energy barrier, Empress Beatrix tests a deadly weapon powered by stolen Dragon Cores.

Empress Beatrix's rampage pushes the MergeQuakes dangerously close to the tipping point, unless the Ninja can work together — and save the world.