Un periodista ecologista, hijo de un ciudadano judío de Gubbio, se presenta como candidato a alcalde de la ciudad. El hombre recibe cartas amenazantes y, antes de las elecciones, es encontrado muerto. Los Carabinieri iniciaron sus investigaciones a partir de las intimidaciones que sufrió el joven, de lo que se dio a entender que la ciudad no debía tener un alcalde de esa religión.

El amigo obispo de Don Matteo, ahora cardenal, llama al sacerdote a la biblioteca de una basílica de la Ciudad del Vaticano para descubrir qué se esconde detrás del asesinato de un erudito. Mientras tanto, una trabajadora social trae a Gubbio a una niña de siete años llamada Camilla, nacida en Bolivia de un misionero laico italiano. La pequeña dice ser hija de Don Matteo.

Vanni, el padre de Nerino, casi ha cumplido su condena y está a punto de salir de prisión. Había sido detenido cuatro años antes por un robo a mano armada. Al capitán Anceschi y su superior les gustaría que Vanni se infiltrara en la pandilla de la que formaba parte. Sin embargo, el hombre no tiene intención de colaborar con los Carabinieri: sabe que ser delator significa arriesgar su vida. Pero la idea de redimirse le hace cambiar de opinión.

El capitán Anceschi y Natalina van de compras al mismo supermercado. De repente, un extraño cubierto con un pasamontañas amenaza al cajero con una pistola y le exige el dinero. El ladrón, desconcertado por los gritos de Natalina, dispara a Anceschi, lo hiere gravemente y huye. La vida del capitán está en peligro, además tiene un tipo de sangre muy raro que ninguno de sus otros amigos tiene.

El Ayuntamiento de Gubbio organiza un concurso de baile. La favorita es Loris, una bailarina de fama regional que, la noche del concurso, después de tomar una copa, se siente mal, cae al suelo y muere. Al parecer envenenado. El chico salió con Evelina, la única hija de un conocido farmacéutico de Gubbio, que se oponía firmemente a la relación entre ambos.

La hija del mariscal Cecchini corre el riesgo de perder un ojo en un accidente. Gracias a un médico, Cecchini cuenta con una financiera para cubrir los costos de la operación en una clínica privada ubicada en los Estados Unidos de América. El mariscal se da cuenta demasiado tarde de que ha acabado siendo víctima de una estafa legalizada.

El único refugio para personas sin hogar de la ciudad ha sido cerrado debido a la presión de un pequeño partido político extremista. Inmediatamente después, el terrible descubrimiento: un vagabundo murió dentro de la iglesia. La víctima murió por intoxicación por estricnina. Resulta que el indigente había bebido el vino robado de la sacristía, el mismo que habría utilizado Don Matteo durante la celebración eucarística. Las sospechas recaen sobre el líder del partido.

Tras un intercambio accidental de maletas entre una joven modelo y Natalina, los Carabinieri encuentran el cuerpo de la mujer, que se llama Sabrina, en el interior de su apartamento. En el cuerpo hay signos de forcejeo y el médico legista confirma que se trató de un homicidio. La niña tenía una boutique de alta costura en Miami, por lo que viajaba a menudo entre Italia y América. El principal sospechoso es el exnovio de la víctima.

En la ciudad se lleva a cabo una feria gastronómica y enológica en la que también participa un grupo escolar acompañado por el profesor Ridolfi. Entre ellos se encuentra Emilia, una estudiante que viene de Inglaterra. La niña le dice a Don Matteo que siente una profunda admiración por el profesor, pero que no se lleva nada bien con la nueva promoción del instituto. Poco después, en el piso superior del edificio donde se desarrolla la exposición, alguien viola a la estudiante.

La alcaldesa Laura Respighi quiere que Gubbio sea sede de los campeonatos de patinaje. Por tanto, el pabellón de deportes está reservado para dos parejas que deberán competir. Chiara Sereni, una de las deportistas, empieza a entrenar, pero se cae y resulta gravemente herida. Alguien saboteó el sistema de calefacción, provocando que el hielo se adelgazara demasiado.

Don Matteo conduce el programa "Dite la tua" en Radio On The Road. A su lado está Paco, un joven DJ que profesa la importancia de la rebeldía y el inconformismo. El niño descubrió y lanzó Crysis, un grupo musical muy apreciado por los adolescentes. La noche del concierto de la banda, Paco está frente a la consola de su programa cuando se escucha un disparo.

Simeoni, colaborador de la justicia, sale de prisión porque ha obtenido la semilibertad. Dos delincuentes lo matan atropellándolo con el mismo Alfa Romeo que impidió al capitán Anceschi salir de vacaciones. El criminal es el mismo que había matado años antes al padre del capitán: éste, de hecho, se había negado a pagar un soborno. La coincidencia hace sospechar al coronel De Andreis e inicia una investigación confidencial.

El lunes por la mañana, una profesora sale del aula para llamar a Lucía y a Assuntina, que han ido al baño, pero no las encuentra. La maestra pregunta a los conserjes si alguien ha visto a las dos niñas y ellos responden que no. Después de una serie de búsquedas rápidas, queda claro que han sido secuestrados. Los padres de ambas niñas están conmocionados, también porque una de las parejas se encuentra en Gubbio con una identidad falsa.

En Gubbio tiene lugar la celebración del trigésimo aniversario de la muerte del Conde Baggini de Garboli; empresario capaz y honesto. Después del alcalde, toma la palabra Edoardo, hijo del conde. Sin embargo, a los asistentes les parece extraño que Annalisa, la hermana de Edoardo, aún no haya llegado. Alguien armado con una pistola entró en la villa familiar y mató a la condesa mientras se preparaba.

En la rectoría de Don Matteo se celebra una cena en honor de Giulia Baldeschi, conocida cantante de ópera. Al final de la velada de gala, Giulia se pone en camino en su coche para regresar a Roma, pero sufre un grave accidente y acaba en coma. Las pruebas muestran que alguien puso una dosis masiva de somnífero en el jugo de naranja que el cantante había bebido antes de irse.

Un hombre es atacado y herido en su casa, ante la mirada de su esposa. El incidente se relata como si se tratara de un robo que salió mal, pero las cosas no fueron exactamente así. Mientras los Carabinieri investigan el caso, otra familia denuncia la desaparición de su hijo de ocho años: Bruno. Dependerá de Don Matteo conectar los dos eventos.

En un elegante hotel de Gubbio se prepara un concurso de pasteleros. El organizador, el industrial Bonanno, decide en el último momento sustituir a la madrina del evento, que es también su ex novia, por el nuevo amor. Mientras tanto en la sala alguien grita que el evento está amañado. Bonanno prueba el pastel de su favorito y se siente mal, la misma suerte corre el pastelero. El primero muere y el segundo entra en coma.

El dueño de una de las diez bodegas más importantes de Italia es asesinado en su bodega. Los cargos recaen sobre un amigo de la infancia de la víctima, cuya madre había sido despedida por el empresario.

Linda dirige junto con su novio "Casa Domani", una asociación que se ocupa de niños disléxicos. El negocio corre el riesgo de cerrar: un constructor se ha hecho cargo del mismo para iniciar un nuevo proyecto empresarial. Una mañana el hombre se encuentra con Linda para decirle que tendrá que desalojar el edificio, pero la joven no tiene intención de hacerlo. Esa misma noche el empresario fue asesinado a martillazos.

Goofy, ansioso por encontrar a su alma gemela, recurre a la agencia matrimonial "Lonely Hearts". Mientras tanto, los Carabinieri de Gubbio intentan descubrir la identidad de un ladrón profesional apodado "Pimpernel", que atrae a hombres solitarios invitándolos a cenar a su casa y luego les roba. Rossana trabaja como camarera para un hombre recién separado y una mañana, cuando acude a él para ocuparse del servicio, lo encuentra muerto.

Una epidemia de brucelosis hace estragos en Gubbio. Muere un padre de tres hijos con una enfermedad cardíaca y el alcalde también corre peligro. El Capitán Anceschi, ante el sentimiento que tiene desde hace algún tiempo, declara su amor a la mujer, a pesar de encontrarse en un estado de semiinconsciencia. Depende de Don Matteo infundir coraje.

Una mujer, presa del pánico, deja a su hijo recién nacido en manos de Don Matteo y le ruega que lo cuide. Mientras tanto, un profesor universitario denuncia la desaparición de su esposa. En el lago se encuentra el cuerpo de una mujer rubia de unos treinta años: poco después resulta ser el de Elena, la esposa del profesor.

Sor Amelia es una misionera que ha regresado a Gubbio para resolver un problema burocrático relacionado con un centro de acogida para personas mayores. El dueño del terreno ha fallecido y su hijo quiere cerrar el instituto. La hija del hermano de Sor Amelia encuentra el documento que acredita la transferencia del antiguo propietario a las monjas. La hermana Amelia está feliz e inmediatamente quiere ir a los Carabinieri, pero alguien le dispara tres veces.