Der Journalist Daniele Fano kandidiert für das Amt des Bürgermeisters in Gubbio. Eines Morgens wird Daniele ermordet in seinem Wagen aufgefunden. Da politische Motive nicht ausgeschlossen werden können, wird Danieles Nachfolgerin Laura Respighi unter Polizeischutz gestellt, was Capitano Anceschi das eine oder andere Mal zur Verzweiflung bringt.

In der Bibliothek des Vatikans wird Professor Leonardo Abbiati ermordet aufgefunden. Seine Eminenz bittet seinen Freund Don Matteo, in den Vatikan zu kommen, da er von dessen vielen erfolgreichen Ermittlungen gehört hat. Don Matteo aber besteht darauf, dass er die Fälle immer nur mit Hilfe der Polizei gelöst hat und so fordert der Vatikan offiziell die Amtshilfe von Capitano Anceschi und Maresciallo Cecchini an. Um im Vatikan nicht für Unruhe zu sorgen, ermitteln die beiden verdeckt als Missionarsschüler.

Nerinos Vater Vanni Bertolacci wird aus dem Gefängnis entlassen. Um allen und vor allem sich selbst zu beweisen, dass er sich geändert hat, hat er sich von Capitano Anceschi überreden lassen, sich wieder in die Bande seines ehemaligen Komplizen Gaspare Tiburzi einzuschleusen, um diesen endlich zu überführen. Da aber alles geheim bleiben muss, keimt in Nerino der Verdacht auf, dass sein Vater wirklich wieder zu der Bande gehört. Don Matteo ist es schließlich, der die Situation und auch die Gefahr, in der Vanni sich befindet, erkennt.

In Gubbio wird ein Supermarkt überfallen. Capitano Anceschi ist als Kunde vor Ort und wird angeschossen. Eine Blutspende von Elena Lorenzi rettet ihm das Leben. Während er sich im Pfarrhaus erholt, möchte er sich bei seiner Lebensretterin bedanken, findet diese aber tot in der Wohnung vor. Cecchini soll den Tod untersuchen, hat dafür aber keine Zeit, weil er mit dem Supermarktüberfall voll ausgelastet ist. So ist es dieses Mal Anceschi selbst, der Don Matteo um Hilfe bittet.

Der Tango-Tänzer Loris Guazza wird bei einer Probe vergiftet. Der Apotheker Ettore De Magistris wird verhaftet, weil er Loris hasste. Don Matteo hat Bedenken.

Im Krankenhaus von Gubbio stürzt der Arzt Gregorio Corrini mehrere Stockwerke in die Tiefe. Don Matteo, der gerade die kranke Natalina besucht, ist sofort zur Stelle. Sterbend flüstert Corrini Don Matteo ein paar rätselhafte letzte Worte ins Ohr. Da der Täter im Krankenhaus vermutet wird, wird Cecchini als Pfleger eingeschleust. Gemeinsam mit Don Matteo kommt er dem Geheimnis langsam auf die Spur.

Cecchinis Tochter hat sich die Augen verätzt und braucht eine teure Operation. Cecchini besorgt sich einen Kredit und entdeckt erst danach die klein gedruckte Klausel 23, mit der er auch eine teure Lebensversicherung abgeschlossen hat.

In der Kirche Don Matteos wird ein Obdachloser vergiftet aufgefunden. Doch der Obdachlose war nur ein Zufallsopfer, denn das Gift war in dem Kelch, der normalerweise für das Abendmahl verwendet wird. Der Giftanschlag galt Don Matteo! Ein paar Fingerabdrücke in der Kirche führen Cecchini und Anceschi zum ehemaligen Häftling Cristoforo Camerota, der Dank Don Matteo fünf Jahre im Gefängnis saß, doch dieser bestreitet den Giftanschlag. Und dann wird auch noch auf Don Matteo geschossen...

Auf ihrer Rückreise aus Pompeii vertauscht Natalina ihre Reisetasche mit der einer Frau namens Sabrina Giacci. Am nächsten Tag wird Sabrina ermordet aufgefunden.

Auf einer nahegelegenen Burg findet ein Mittelalterfest statt. Während die Besucher die Veranstaltung genießen, ereignet sich auf dem Turm der Burg ein dramatischer Zwischenfall. Die Schülerin Emilia Gardiani wird vergewaltigt. Der von den Eltern des Mädchens alarmierte Don Matteo überzeugt Emilia den Vorfall anzuzeigen. Obwohl Emilia keine Angaben zum Täter macht, nehmen Capitano Anceschi und Maresciallo Cecchini die Ermittlungen auf.

In Gubbio findet ein großer Eistanz-Wettbewerb statt. Beim Training eines favorisierten Paares kommt es zu einem folgenschweren Unfall. Die Tänzerin Chiara stürzt und verletzt sich schwer. Don Matteo, der mit der kleinen Camilla das Training beobachtet, eilt sofort zu Hilfe und stellt fest, dass der Unfall herbeigeführt wurde...

Gubbio ist im Musikfieber. Die örtliche Band "Crysis" steht vor ihrem großen Durchbruch. Don Matteo, der eine Talkshow im Radio moderiert, darf für diese Show ein Interview mit der Band führen. Zur Seite steht ihm dabei DJ Paco, der beim Radiosender der Star ist und auch als Entdecker und Songschreiber der Band gilt. Als Paco abends allein die Spätsendung moderiert, geschieht das Unglaubliche: Es erklingt ein Schuss und man hört Paco zusammensacken.

Antonio Simeoni, der Mörder von Capitano Anceschis Vater, wird ermordet. Der Verdacht fällt ausgerechnet auf den Capitano selbst.

Lucia, die Tochter des Ehepaares Matteucci wird gemeinsam mit der jüngeren Tochter von Maresciallo Cecchini aus der Schule entführt. Der Grund für die Entführung ist schnell klar, denn Lucias Vater ist der Kronzeuge in einem wichtigen Prozess, weswegen er und seine Familie unter falschen Namen in Gubbio leben. Nun soll er mit der Tochter als Druckmittel zum Schweigen gebracht werden. Es beginnt eine fieberhafte Suche nach den beiden entführten Mädchen, bei der natürlich auch Don Matteo mit von der Partie ist.

Die Gräfin Ottavia Baggini Dè Calboli wird erschossen aufgefunden. Der erste Verdacht fällt auf Glauco Spezzani, den ehemaligen Gärtner der Bagginis, der die Leiche auch gefunden hat. Er wirkt aber mehr traurig als hasserfüllt, weswegen Don Matteo nicht an seine Schuld glaubt. Bei der Testamentseröffnung der Gräfin gibt es dann eine Überraschung...

Die berühmte Opernsängerin Giulia Baldeschi ist zu Gast in Gubbio und Don Matteo gibt für sie einen kleinen Empfang. Als sie sich am Abend allein auf den Rückweg nach Rom macht, kommt sie von der Fahrbahn ab und verunglückt. Es stellt sich heraus, dass jemand Giulia Beruhigungstropfen verabreicht hat. Der Unfall wurde also mutwillig herbeigeführt. Die Polizei hat schnell einen Verdacht und Don Matteo nimmt eigene Ermittlungen auf.

Sergio und Lucia Arnaldi tauchen bei Don Matteo auf, da ihr Sohn weggelaufen ist. Während Don Matteos Suche erfolglos ist, findet Camilla einen Jungen, der sich versteckt.

Bei einem großen Backwettbewerb soll der beste Konditor gekürt werden. Don Matteo, Capitano Anceschi und die Bürgermeisterin haben die Ehre, mit in der Jury zu sitzen. Vorsitzender der Jury ist Anselmo Bonnano, der auch Hauptsponsor des Wettbewerbs ist. Aus dem erhofften Vergnügen wird allerdings nichts, da Anselmo schon nach Probieren der ersten Torte vergiftet zusammenbricht. Nun gilt es zunächst zu klären, wer das eigentliche Ziel des Anschlags gewesen ist.

Das Kinderbetreuungszentrum "Casa Domani" ist in seiner Existenz bedroht. Es fehlt das Geld, um einen Kredit zurückzuzahlen. Der Bauunternehmer Zanca, an den das Grundstück fallen würde, ist zu keinerlei Kompromissen bereit, denn er hat schon Pläne für eine neue Nutzung. Als der Unternehmer ermordet aufgefunden wird, geraten die Betreiber des Kinderbetreuungszentrums natürlich sofort ins Visier der Ermittler, doch dann gibt es eine weitere Leiche und der Fall wird immer seltsamer.

Die Polizei findet die Leiche von Antonini Rinaldi. Der Tatort sieht ganz nach einem Verbrechen einer bekannten Diebin aus, die als Visitenkarte immer ein mit Lippenstift geschriebenes Kreuz auf einem Spiegel hinterlässt. Da aber bisher keines ihrer Opfer ermordet wurde, fällt der Verdacht zunächst auf Rinaldis Ex-Frau Giovanna, die sich hilfesuchend an Don Matteo wendet. Cecchini und Anceschi gehen derweil einem Hinweis nach, der sie in die Heiratsvermittlung "Cuori Solitari" führt, bei der auch das Opfer Kunde war.

Als Bauer Quinto Belli gerade auf dem Polizeirevier ist, um den Diebstahl von 14 jungen Kühen anzuzeigen, erreicht Capitano Anceschi die Mitteilung, dass mehrere Personen aufgrund verseuchter Milchprodukte ins Krankenhaus eingeliefert wurden. Während Maresciallo Cecchini sich um den Viehdiebstahl kümmert, fährt der Capitano ins Krankenhaus und muss mit Erschrecken feststellen, dass auch die Bürgermeisterin unter den Kranken ist.

Eines Abends kommt eine unbekannte, verängstigte Frau zu Don Matteo zur Beichte. Als sie die Kirche wieder verlässt bleibt ein Säugling in einem Schuhkarton zurück...

Die Ordensschwester Amelia, die früher lange Zeit in Gubbio gewirkt hat, ist zurückgekehrt, um zu verhindern, dass ein Stück Land verkauft wird, das seinerzeit nur unter der Bedingung den Besitzer gewechselt hat, dass eine darauf bestehende Einrichtung erhalten bleibt. Der neue Besitzer bestreitet nun allerdings diese Klausel. Trotzdem kämpft Amelia um die Einrichtung und wird dabei nicht nur von Don Matteo, sondern auch von ihrer Nichte unterstützt. Diese findet schließlich auch das alles beweisende Dokument, doch gerade als sie es Amelia übergeben möchte, wird die Nonne mit drei Schüssen niedergestreckt.