Rupert Thorne contrata a un asesino a sueldo que ha sido manipulado hormonalmente, lo que le confiere una fuerza sobrehumana debido a una droga llamada «Venom» que se inyecta en todo su cuerpo. Este mercenario llamado Bane tomará como misión destrozar a Batman.

Edward Nigma regresa totalmente reformado, convirtiéndose en el jefe de operaciones de la compañía de juguetes Wacko Toys. Sin embargo, de vez en cuando deja mensajes subliminales con acertijos, que Batman y Robin logran resolver. Uno de estos acertijos conducirá a Batman a su perdición.

Varias excelebridades comienzan a ser secuestradas. Casualmente todos pertenecieron a un viejo show llamado «Muñequita». La responsable de todo es la protagonista del espectáculo quien busca venganza.

El relojero regresa con la única intención de dañar al alcalde Hill. Ahora cuenta con un poderoso aparato que controla el tiempo e incluso lo congela.

Harley Quinn es liberada de Arkham. Ya libre, hace cosas bizarras y secuestra a Verónica Vreeland, por lo cual vuelve a ser apresada.

Tres cómicos famosos desaparecen misteriosamente. Mientras tanto, aparecen tres nuevos villanos. Batman y Robin investigan estos casos, lo que los llevará a descubrir que todo era un plan del Joker.

Robin y Batgirl intentan descubrir los planes de Roland Dagget, quien ha logrado evadir a la policía en varias ocasiones. Sin embargo, hay alguien más que intenta atraparlo: Catwoman. Wayne está en París y Batman no puede ayudar.

Lyle Bolton, un guardia de Arkham, es despedido por torturar a más de un villano, lo cual lo lleva a convertirse en Lock Up y a secuestrar a funcionarios importantes. Batman y Robin deben encontrar la guarida de Lock Up y vencerlo.

Victor Fries/Sr. Frío es secuestrado por un multimillonario llamado Walker, que está tratando de congelar el mundo y recrearlo de acuerdo a su propio diseño.