Batman è sulle tracce di una misteriosa svaligiatrice vestita da gatto e contemporaneamente Bruce Wayne conosce l'animalista Selina Kyle; la donna è interessata a trasformare un terreno desertico in una riserva protetta, mentre una multinazionale vuole costruirci un centro turistico.

Un enorme pipistrello deruba alcune aziende farmaceutiche: il sindaco Hill accetta la proposta di Bullock, cioè di rintracciare e catturare il responsabile, da molti ritenuto Batman. Il vero uomo pipistrello però indaga su alcuni peli, appartenenti probabilmente ad un pipistrello, e scopre come lo zoologo del Gotham City Zoo, Kirk Langstrom abbia sperimentato su di sé un siero per migliorare le capacità dell'uomo con quelle dei chirotteri. Batman lo ferma, e gli inietta un antidoto.

La GothCorp continua a subire furti: il responsabile è l'ex scienziato Victor Fries, che desidera vendicarsi di Ferris Boyle, che anni prima aveva interrotto un esperimento di criogenia con il quale avrebbe potuto salvare la moglie Nora. Quando il criminale irrompe in una festa di beneficenza per eliminare Boyle, Batman interviene.

Bruce Wayne viene incastrato per il tentato omicidio di Lucius Fox; in realtà il colpevole è Matt Hagen, attore con il volto devastato ma tornato alla ribalta grazie alla crema "Rinnovarsi", in grado di regalargli nuove sembianze. Hagen è però ormai dipendente da quella crema, prodotta delle industrie del criminale Roland Daggett, che lo ricatta per i suoi loschi traffici, costringendolo ad assumere le fattezze di altre persone, come appunto Wayne.

Ormai ritenuto inutile, gli sgherri di Daggett cercano di eliminarlo facendogli ingerire una grande quantità di quella crema, ma inaspettatamente Hagen si trasforma in un essere d'argilla in grado di mutare forma. Assetato di vendetta, Hagen si fa chiamare con il nome di "Uomo d'argilla" e cerca di assassinare Daggett a uno show televisivo di cui è ospite. Batman interviene, e fra i due si scatena un combattimento che termina con l'apparente morte di Hagen, a causa di una scarica elettrica, prima rivelando ai poliziotti il suo potere di cambiare forma e quindi mostrandi che Bruce era innocente. Tuttavia, in seguito, Batman scopre che l'argilla di cui l'ex attore era composta è immune all'elettricità, difatti Hagen è ancora vivo e ha solo inscenato la sua morte.

Per il controllo del crimine in città, Rupert Thorne fa saltare in aria il rivale Arnold Stromwell, ma Batman lo salva e gli chiede di cambiare vita, mostrandogli anche il figlio, ricoverato in una clinica per tossicomani. Braccati da Thorne, Stromwell si ravvede veramente solo quando parla con il fratello, un prete che da piccolo gli salvò la vita.

Il piano è in realtà è solo una copertura per utilizzare l'area per dare dimostrazione della potenza di virus rubato all'esercito dall'organizzazione terroristica Red Claw. Batman e Catwoman uniscono le loro forze per cercare di fermarla.

Il procuratore distrettuale Harvey Dent collassa per avvelenamento e Batman sospetta dalla fidanzata, Pamela Isley. Scopre allora che dietro tutto vi è la donna, e cerca un antidoto per Harvey.

Un misterioso e folle criminale che si fa chiamare Spauracchio sta prendendo di mira l'Università di Gotham. Indagando, Batman scopre che l'ex professore Jonathan Crane, cacciato dall'ateneo, sta cercando di vendicarsi.

Durante un comizio, il sindaco Hill paragona Batman al Joker: quest'ultimo, offeso, decide di vendicarsi, recandosi alla festa di compleanno di Jordan, figlio del politico. Travestito dall'animatore "Gecko il Clown", il criminale tenta di eliminare gli invitati, ma l'attentato è sventato grazie a Bruce Wayne. Dopo aver litigato con il padre però Jordan scappa di casa, chiedendo a Gecko di diventarne apprendista. Batman li segue, e quando cade in trappola, il piccolo comprende le intenzioni del Joker e lo libera. Batman neutralizza poi il Joker, e Jordan fa ritorno da Hill.

Batman's friend, Dr. Leslie Thompkins, is taken prisoner by a ruthless land developer after she uncovers his devious plans.

Un'azione di polizia coinvolge gli agenti Wilkes, Montoya e il detective Bullock. Ognuno di loro fornisce però una differente ricostruzione dei fatti.

When a maniacally punctilious man faces financial ruin because of attorney Hamilton Hill, he transforms into the devious Clock King and swears revenge on Hill, now the mayor of Gotham.

Il Joker diffonde per le strade gas esilarante e con i suoi uomini inizia a svaligiare la città. Quando anche Alfred viene contagiato, Batman rintraccia il criminale e sventa il suo piano.

Alfred and his friend, Maggie Paige, visit a health spa that is actually run by the nefarious Poison Ivy.

In piena campagna per la rielezione, il procuratore distrettuale Harvey Dent inizia a manifestare una feroce rabbia repressa, quasi nascondesse una seconda personalità. Il boss criminale Rupert Thorne, le cui attività illegali sono nel mirino della giustizia, viene a conoscenza di questa situazione, e decide di ricattarlo.

Un'esplosione in una raffineria devasta il volto del procuratore, che si trasforma in criminale, colpendo duramente gli affari di Thorne. La fidanzata Grace viene usata per arrivare a lui, e quando Thorne ha in pugno Dent, l'intervento di Batman ribalta la situazione, e l'Uomo Pipstrello riesce ad impedire che Dent uccida il boss.

The Scarecrow uses a fear chemical triggered by adrenaline on Gotham's greatest athletes, then bets against them to reap the winnings.

Batman sventa una rapina del Pinguino, intenzionato ad impossessarsi di un Uovo di Fabergé; sfortunatamente l'eroe rimane vittima di un gas, e resta fuori combattimento. Viene così soccorso da Sherman, giovane che vorrebbe diventare detective. Il ragazzino nasconde batman nel seminterrato di casa sua e lo difende dal criminale ed i suoi uomini.

Batman suspects that an imprisoned Detective Bullock may be innocent after he is arrested for murder. The real murderer turns out to be Killer Croc, who framed Bullock to get revenge.

Molti facoltosi cittadini sono ormai succubi di Nostromos, veggente che in realtà vuole truffarli. Bruce Wayne finge di unirsi alla sua "fratellanza" solo per smascherarlo e fermarlo.

Per indagare sulla scomparsa di alcuni uomini, Batman si traveste da senzatetto, ma viene rapito e perde la memoria. Si risveglia in un campo di prigionia, dove sono sequestrati gli uomini scomparsi, ora trattati come schiavi in una miniera d'oro illegale. Quando riacquista la memoria e viene raggiunto da Alfred, l'eroe salva la situazione.

The Mad Hatter puts the city of Gotham under his control in an attempt to impress a woman, Alice, with whom he is in love.

Batman investigates a theft of bearer bonds intended for the starving people of a poor country.

Bruce Wayne wakes up to find that his parents are not dead, he is not Batman, and he's engaged to Selina Kyle!

Batman nota una serie di furti compiuti da ragazzini. Seguendoli, scopre che sono tenuti in una sorta di prigionia nel sottosuolo della città, ingannati e diretti da un pazzo che si fa chiamare "Re delle Fogne", che Batman si appresta a neutralizzare per ridare ai bambini la libertà.

When Wayne Enterprises is robbed by a mysterious figure known as the Ninja, Batman and Robin discover that the Ninja is an old nemesis of Bruce Wayne.

Dr. Hugo Strange's invention, a machine that reads people's thoughts, leads him to discover that Bruce is Batman.

When a genetic engineer produces a man-cat hybrid, he kidnaps Selina Kyle to provide his creation with a mate.

Batman must thwart the Scarecrow's plan to poison Gotham's water supply with a chemical that induces hallucinations.

Un criminale che si firma "il Folle Dinamitardo" ricatta la città provocando esplosioni; il suo modus operandi ricorda lo stesso di un antagonista di un episodio della vecchia serie televisiva Il Fantasma Grigio, di cui Bruce Wayne era appassionato da piccolo. Batman rintraccia il vecchio interprete, Simon Trent, ora attore ridotto così male che vende spesso al robivecchi i suoi ricordi, e gli chiede di aiutarlo. Dietro a tutto questo infatti vi è quel robivecchi, e la sua cattura regala nuova e meritata fama a Trent.

Selina Kyle uncovers a plot to infect stray animals with a deadly disease that will be transmitted to the human population.

On the anniversary of the death of Bruce's parents, Batman expresses doubts about whether or not he should continue his one-man war against crime.

While hiding from the police, Batman's deadliest enemies exchange stories about their mutual nemesis--Batman.

Professor Milo tries to use an old friend of Bruce Wayne's, Anthony Romulus, to destroy him after Milo injects Romulus with a serum that changes him into a wolf.

When a man-sized bat ransacks Gotham harbor, Batman suspects that Dr. Kirk Langstrom is drinking his Man-Bat formula again.

La sera della vigilia di Natale il Joker scappa da Arkham, e trasmette uno speciale televisivo nel quale tiene in ostaggio Gordon, Summer Gleeson e Harvey Bullock: tocca quindi a Batman e Robin salvarli prima della mezzanotte.

Karl Rossum, owner of Cyberton Labs has been replacing important authority figures with robot look-alikes. Batman invites a young woman to dinner, not knowing that she is a robot as well.

Batman escapes from being attacked by his own Batcomputer, which was sabatoged by HARDAC. He now seeks to get back Gordon, Hill and Bullock, who have all been replaced with robots.

When Edward Nygma's greedy boss unjustly fires genius him, Nygma seeks revenge in a new guise--as the Riddler!

When a billionaire builds a casino called the Joker's Wild, the Joker breaks out of Arkham Asylum to destroy it.

A confused robot that believes he is Batman causes problems for the real Dark Knight.

Batman investigates a notorious global crime cartel, The Society of Shadows, which has begun to operate in Gotham City.

To prove that he has a superior mind, the Riddler lures Batman into a contest inside a virtual reality computer game.

The Joker becomes enraged when the Gotham copyright office rejects his demand for a copyright for his grinning Joker fish.

Harley Quinn has broken off with the Joker and teams up with Poison Ivy. Together they wreck havoc on Gotham and now Joker wants a piece of the action.

While engaged in a high-speed chase, the Penguin's gang escapes and the Batmobile is virtually demolished.

Sidney Debris, a small-time mobster, earns the hatred of all of Batman's enemies when he claims to have accidentally killed Batman during a brawl.

When glamorous female magician Zatanna is framed for a robbery during her act, Batman comes to her defense.

After learning the name of an extortion ringleader, Batman mysteriously refuses to let Robin continue the investigation with him.

Veronica Vreeland, a socialite desperate to create a novel party, makes the mistake of inviting the Penguin as her guest of honor.

Despite Batman's orders not to, Robin pursues Tony Zucco, the criminal who was responsible for the death of Robin's parents.

Bruce Wayne is temporarily blinded when the Penguin steals a new police helicopter with weaponry developed by WayneTech.

Bruce Wayne and Alfred travel to Japan to help Bruce's old martial arts teacher, Sensei Yoru.

Il divorziato Lloyd "Eddie" Ventrix, ad un passo dal perdere la figlia Kimberly, ruba una tuta speciale che gli consenta l'invisibilità e ruba gioielli che poi regala a Kimberly, la quale crede ad un "amico immaginario", Mojo. A Batman il duro compito di rintracciare l'inafferrabile criminale.

When Robin is mysteriously abducted, Batman's search leads him to meet Ra's Al Ghul, leader of The Society of Shadows, whose daughter, Talia, has also been kidnapped.

Batman discovers Ra's Al Ghul's plan to flood Earth with chemicals and return it to a lush, green planet--which will destroy all life that now exists!

Batman investigates a series of baffling crimes and discovers that the crime czar is a wooden dummy, manipulated by a mild-mannered man called the Ventriloquist.

Believing he's the reincarnation of Zeus, a mad shipping magnate mounts a stolen electron cannon atop his penthouse to shoot 'lightning bolts' at the 'wicked mortals' below.