Fuko Izumo, détenant le pouvoir de « malchance », porte malheur aux gens qui la touchent. Un homme doté du pouvoir de « ressuscitation » au corps immortel surgit devant Fuko alors qu'elle tente de se suicider. L'immortel se réjouit d'avoir rencontré quelqu'un capable de lui offrir une véritable mort. Il enlève Fuko et recherche les conditions parfaites pour relâcher sa malchance lorsque l'Organisation de contrôle des phénomènes non identifiés, aussi appelée « Union », se met à les pourchasser!

Un grand coup de malchance frappe lorsque Fuko embrasse Andy, qui fait des avances à Fuko en espérant que sa malchance va empirer en augmentant les contacts physiques! Pour éviter une agression, Fuko explique que plus elle aime quelqu'un, plus la malchance est importante. Andy déclare alors qu'il va s'arranger pour qu'elle soit amoureuse de lui... et qu'il ne la laissera pas mourir avant que cela se produise. Pendant ce temps, les chasseurs de l'Union se rapprochent d'Andy et de Fuko!

Dans trois jours, un membre de l'Union va se déplacer pour une enquête en Russie. Andy et Fuko se dirigent vers le lac Baïkal après avoir appris qu'ils pourraient intégrer l'Union s'ils parviennent à tuer cette personne. Après une poursuite de l'Union, le duo arrive au lac Baïkal, mais se sépare dès l'arrivée, car Andy doit faire des courses. Fuko rencontre une fille portant une tenue rappelant un uniforme d'écolière japonaise. Elle aime l'aquarelle et insiste pour que Fuko peigne avec elle...

La fille qui peignait avec Fuko au lac Baïkal est Gena, la Négatrice qui a capturé Andy autrefois! Andy veut se venger et essaie de découvrir quelle est la nature de ses pouvoirs. Ainsi, il réalise que Gena est un type de Négateur qui transforme les formes des objets. Gena croit que Fuko lui a volé Andy, pour qui elle éprouve des sentiments depuis longtemps, et explose de jalousie envers Fuko. Pendant les attaques de Gena, Fuko remarque quelque chose...

Andy et Fuko rencontrent des membres de l'Union à la table ronde, où Apocalypse distribue de nouvelles quêtes. Apocalypse est le premier « Artéfact » trouvé sur Terre qui oblige les membres de l'Union à accomplir des tâches déraisonnables. Fuko pose la question aux membres du groupe, qui croient qu'il est naturel de suivre de telles quêtes. Elle suggère du changement, mais le leader Juiz est en désaccord.

Andy et ses amis sont aux États-Unis pour capturer Spoil. Après avoir examiné un cadavre en décomposition associé à Spoil, ils découvrent qu'il provient de Longing. En étudiant les rapports d'agents qui se sont rendus à Longing, il ne fait aucun doute que Spoil et les zombies qu'il a créés se trouvaient à cet endroit. Dès son arrivée, Andy trouve un zombie qui ne s'est pas encore entièrement transformé. Il essaie d'interroger ce zombie pour connaître les allées et venues de Spoil...

Les résidents de Longing se sont transformés en zombies grâce à Spoil. Fuko apprend ce qui s'est passé par les enfants cachés dans un abri souterrain et comment ils ont pu éviter d'être transformés en zombies. Pendant ce temps, Andy se bat à la surface avec les autres zombies contre Spoil. Quand un zombie touche accidentellement Fuko, cela déclenche un coup de malchance. Andy se rend compte que les pouvoirs de Fuko fonctionnent aussi sur les zombies...

Les transitions de Spoil vers la phase 2, décomposer ce qui s'approche et activer un laser de décomposition pour ce qui s'éloigne. Shen commence sa contre-attaque avec son artéfact et sa capacité de négation. Même si Spoil est incapable de répliquer, la bataille est dans une impasse, car Spoil ne peut pas être atteint directement. Pour ce type de UMA, la capture est complète lorsque le "noyau" extrait du corps crée un besoin de savoir comment supprimer la capacité de Spoil complètement.

Victor, l'homme qui autrefois remporta d'innombrables victoires sur les champs de bataille est l'autre visage d'Andy qui apparaît quand on retire la Carte de son front. Bien que Spoil a été capturé, Andy est toujours Victor. Les membres de l'Union le défient de revenir à son propre soi. Cependant, avec des pouvoirs dépassant ceux d’Andy et une personnalité agressive, Victor se tient devant les membres de l’Union comme un adversaire difficile à battre. Fuko passe à l'action pour ramener Andy!

Apocalypse lit les résultats des quêtes devant les membres de l'Union. Après l'échec de la sixième quête, Apocalypse ajoute la Galaxie UMA comme pénalité. Les membres de l'Union se dirigent vers la surface et l'altération du monde commence sous leurs yeux. Cette fois, la Règle crée des extraterrestres qui ont voyagé par delà les galaxies pour envahir la Terre.

Le Négateur Unrepair a été localisé près des enchères au marché noir, donc Andy et sa bande s'y rendent. Les Négateurs, les UMA et les Artéfacts qui ont échappé au contrôle de l'Union circulent dans ce marché. Andy et Fuko infiltrent le marché en tant que couple marié. En écoutant les conversations autour d’eux traitant les Négateurs et les UMA comme des marchandises, Fuko demande à Andy si rejoindre l’Union ou être vendus est préférable pour les Négateurs.

The Union and the Negator Hunters have infiltrated the black market auction venue for a new Negator. Andy and Fuko hurry towards the auction item storage, to stop the Negator Hunters who seek revenge against the world.

While Tatiana fights members of the Negator Hunters, she receives a report that Fuko was wounded by Unrepair. Tatiana unleashes her powers in order to save Fuko!

A huge explosion occurs from within the luxury liner sends Andy and company up into the air. They find Rip and company among the rubble. If they let Rip get away, Fuko will die. A roller-coaster ride of a battle ensues.

Fuko and Andy head over to right outside Chikara’s school in order to hear his reply about joining the Union. Rip, who was supposedly dead, suddenly shows up as a young boy. Chikara over hears their conversation...

Apocalypse reads out the quests that have the 100th penalty on the line. However, Billy suddenly declares that it’s impossible for the Union to kill God, and tries to take off with the Roundtable...

To regain the Roundtable, the Union commences an operation with Andy and Fuko as central members. Andy chops his head off while being kissed by Fuko. His head turns into a Parts Bullet and goes into Burn's stomach.

The Union regains control of Apocalypse, but the Roundtable has been seized. Juiz starts telling the members how this world is in a Loop of destruction and reconstruction by the hands of God, and that the Union is an organization she created to thwart such actions.

The possibility has risen that Fuko’s bible in life “To You, From Me” was a manga drawn with an Artifact. Andy and Fuko are tasked with checking the status of the raw manuscripts and gaining intel about Anno Un.

Andy and Fuko await for Anno Un on a bench in Stanley Park. Before they know it, Anno is reading Fuko’s manga and declares that they know what the pair is looking for...

Andy's memories become a book thanks to Autumn's claw that Anno Un materialized. Using the Artifact Soul Caliber, Anno Un plucks out Fuko's soul to send her inside Andy's book. The journey to learn about Andy begins.

Fuko arrives at Victor's memories but is killed by him shortly. Time flies by and Fuko moves on to the final chapter. While Fuko searches Shinjuku for Andy, Victor's blades are unleashed!

Now that Autumn is stronger, individual attacks are of no use. Anno Un asks Andy and the gang to buy some time to draw the most powerful Artifact necessary in capturing Autumn...