Japan ist nach der großen Katastrophe zusammengebrochen. Kiruko wird gebeten, einen Jungen namens Maru an einen Ort namens Himmel zu bringen. Derweil leben Kinder hinter den Mauern einer Akademie in einer üppigen Grünanlage. Tokio beginnt nach einer Nachricht, an der Welt um ihn herum zu zweifeln.

Vor fünf Jahren lebten Robin, Haruki und dessen Schwester, die Rennfahrerin Kiriko, glücklich in einem Waisenhaus in Asakusa. Während eines Elektrokart-Rennens versucht etwas Schreckliches, die Veranstaltung zu stören, und Haruki sieht sich mit einer verheerenden Situation konfrontiert.

Tokio wird zu einigen bizarr aussehenden Babys gebracht, und ihm wird klar, wie wenig er von seiner Umgebung versteht. Auf einem Boot, von dem es kein Entkommen gibt, werden Maru und Kiruko Opfer eines schrecklichen Angriffs. Als alles scheitert, ist es an Kiruko, eine neue Strategie zu entwickeln.

Maru und Kiruko kehren nach Tokio zurück und finden ein Viertel voller Zelte vor. Als Maru in eine Spielhalle geht, muss Kiruko Informationen sammeln und hört ein beängstigendes Gerücht. In der Akademie verschlechtert sich Taraos Zustand, und Dr. Sawatari entdeckt einen mysteriösen Fußabdruck.

Nachdem sie die Menschenfresser getötet haben, treffen Maru und Kiruko endlich auf Dr. Usami. Er bittet sie um einen schwierigen Gefallen und führt die beiden in einen Raum, in dem sich ihnen ein grausamer Anblick bietet.

Maru und Kiruko erreichen eine wohlhabende Stadt, in der Gerüchten zufolge das Wiederaufbauamt das Sagen haben soll. Derweil wird die Akademie überraschend angegriffen, und die schutzsuchenden Kinder finden ein Loch in der Wand.