중소기업에서 일하는 회사원 사사키가 애완동물 가게에서 구입한 문조 피짱은, 이세계에서 전생한 현자님이었다. 피짱으로부터 마법의 힘과 이세계로 갈 수 있는 기회에 대해 듣게 된 사사키는, 이세계에 현대 일본의 물건들을 가지고 가 장사를 시작했다. 회사에서 돌아온 다음엔 이세계에서 꿈에만 그리던 슬로 라이프를 만끽!... 할 수 있을 줄 알았지만, 회사에서 돌아오던 길에 이능력자와 조우했는데.

피짱한테서 배운 마법을 이능력이라고 오해한 '내각부 초자연현상 대책국'에 채용된 사사키. 이세계에서의 슬로 라이프를 누리는 것도 잠시. 현대 일본에서 국가 공무원으로서 열심히 뛰어다니는 처지가 되었다. 그런 그의 첫 임무는 이능력자 일제 적발이었는데, 대상은 낮은 랭크의 이능력자일터였지만 나타난 건 근처에서 유명한 랭크 A 이능력자 소녀였는데.

현대 일본에서 이능력 배틀을 마친 사사키는 이세계에서 바캉스를 즐기길 원했다. 하지만 그가 머무는 헤르츠 왕국과 이웃 나라인 오겐 제국과의 전쟁이 일어났고, 뮐러 자작으로부터도 협력할 것을 요청받았다. 왕국을 위해서 발 벗고 나서기로 결심한 사사키는 경제 대국인 룽게 공화국으로 향해 단독으로 병참 문제 해결에 착수했다. 본래라면 될지 어떨지 몰랐던 물자 확보도 어떻게든 기한 안에 해결되고, 사사키는 뮐러 자작을 전장으로 떠나보냈는데.

프렌치의 가게에서 엘자와 함께 식사를 하고 있는 사사키와 피짱. 그런 상황에서 도착한 건, 엘자의 오라버니들의 부고였다. 뮐러 자작에 이어 그 아들들까지 사망하게 되면서 뮐러 자작가의 유일한 상속인은 엘자가 되었는데, 여기에 더해 자작령을 향해 오겐 제국의 대군이 다가오고 있었다. 이에 환생한 후 은거하기로 결심했었던 피짱의 마법이 다시 한번 이세계에 작렬했는데.

미등록 이능력자를 스카우트하기 위해 사사키와 호시자키는 사이타마현에 있는 어떤 고등학교로 향했다. 그들의 상대는 불량한 애들과 엮인 듯한 심약한 남고생이었는데, 호시자키는 대담하게 행동하며 대상과 접촉했다. 그러자 그 자리에 예고도 없이 마법소녀가 나타났는데.

갑작스럽게 벌어진 마법소녀와의 싸움. 사사키 일행을 돕기 위해 나타난 후타리 시즈카는 초자연현상 대책국으로, 이적하고 싶다고 말을 꺼냈다. 어제의 적은 오늘의 동료. 아쿠츠는 우수한 이능력자인 그녀를 대책국의 일원으로, 받아들이기로 결정했다. 그리고 후타리 시즈카의 직무 교육은 사사키가 담당하게 되었는데.

뮐러 백작과 사사키에게 마르크가 불경죄로 붙잡혔다는 소식이 전해졌다. 그들은 마르크를 구하기 위해 동분서주했고, 이에 필요한 자금을 모으기 위해 사사키와 피짱은 이세계에서 일본으로 금을 반입하는 작업을 진행했는데.

마르크의 처형이 결정되었다. 이에 뮐러 백작과 사사키는 협상을 위해 디트리히 백작을 찾아갔고, 디트리히 백작은 마르크를 풀어주는 대신 사사키가 취급하는 상품을 자신하고만 거래할 것을 요구했다. 어떻게든 처형까지 한 달의 유예를 받은 뮐러 백작과 사사키는 마르크를 구해내기 위해 움직였는데.

마르크의 신병을 둘러싸고 디트리히 백작, 하만 점장과 협상을 벌이는 사사키. 뮐러 가문과는 앙숙 관계로, 백작으로부터 무리한 요구가 튀어나온다. 하지만 사전에 대책을 세워둔 사사키에게는 통하지 않는다. 결국 그가 헤르츠 왕국의 미래에 대해 역설하자 ...

후타리 시즈카가 묵고 있는 호텔로 불려간 사사키. 방에 들어서자 여기저기 피가 튀고, 실내는 엉망진창이었다. 후타리 시즈카를 노리고 있던 것은 그녀가 원래 소속되어 있던 조직의 일원으로 오타쿠풍의 복장을 한 남자였다. 아슬아슬하게 후타리 시즈카를 구출한 사사키 일행은 정면 승부를 펼친다.

적대 조직과의 교전을 끝내고 한숨 돌릴 틈도 없이, 호시자키 씨로부터 마법소녀가 사무국에 나타났다는 연락을 받은 사사키. 현장으로 가보니 매지컬 핑크와 매지컬 옐로우의 모습이 있었고, 무시무시한 분위기에 휩싸여 있었다. 마법소녀가 쳐놓은 장벽을 뚫기 위해 사사키는 한 가지 방법을 강구하기로 한다.