Sydney und Vaughn sind gerade dabei, eine Bombe zu entschärfen. Völlig unvermutet werden sie dabei aus dem Hinterhalt angegriffen. Währenddessen festigen Sark und Lauren ihre Zusammenarbeit, um die Macht in „The Covenant“ zu übernehmen. Sloane verrät dagegen ein dunkles Geheimnis an Dr. Barnett.

Vaughn netuší, že jeho manželka Lauren zrazuje CIA a dodává informace Dohodě. Lauren je ambiciózní, touží po moci, má poměr se Sarkem a společně s ním i vraždí, ale navenek funguje jako schopná agentka a manželka. Vaughn se trápí, protože v skrytu duše stále miluje Sydney.

CIA zachytila zprávu, že filipínská teroristická organizace vyvinula nesmírně účinnou, tzv. plazmovou bombu a jeden kus poslala své pobočce v Evropě. CIA se snaží bombu za každou cenu zachytit, než se dostane do rukou teroristů nebo nepřátelských tajných služeb. Akcí je pověřena Sydney s Vaughnem. Po celou dobu je o krok před nimi konkurenční tým, Sark s Lauren. Obě dvojice se nakonec střetnou na nákladní lodi v Lisabonu.

한 테러 조직이 폭탄을 손에 넣고 유럽으로 수송 중이다.

Dixon informa a los agentes que desde Langley están muy preocupados porque la Coalición se les adelanta con demasiada frecuencia y sospechan que pueda existir un topo en la Fuerza de Operaciones Conjuntas así que asigna a Jack que abra una investigación interna para descubrirlo.

Sydney y Vaughn viajan a Canadá donde tienen que extraer información relativa a la Coalición de un servidor. Sin embargo, Sark y Lauren se les adelantan y no sólo impiden que Marshall recupere la información sino que además introducen un virus en los sistemas de la CIA.

Syd y Vaughn huyen del edificio persiguiendo a los intrusos de la Coalición que, aunque ellos no lo saben, son Sark y Lauren. A pesar de pisarles los talones en una persecución de coches en el garaje, finalmente logran escapar y cuando están a salvo, ambos agentes se besan apasionadamente celebrando su victoria. La misión de la CIA es un desastre y ni siquiera Marshall cree que podrá extraer la parte de la información que le ha llegado.

En Zúrich, la doctora Barnett acepta una invitación de Sloane a cenar en un restaurante, con la excusa de tener allí una sesión pero ni el uno ni el otro parecen demasiado profesionales en su trato a pesar de una falsa reticencia por parte de Barnett. Ella le pregunta por su obsesión con Rambaldi y Sloane le cuenta la historia de la máquina que ponía "Paz" pero a la doctora le cuesta creer que Sloane no encontrara nada más y él se siente ofendido por lo que sugiere Barnett. Además, Sloane le dice que no revelará su secreto y se crea tanta tensión que la psiquiatra se levanta ofendida y se marcha.

Las cosas no están tan mal. Marshall ha logrado obtener la localización de la bomba en un barco atracado en Lisboa y Dixon envía a Vaughn y a Sydney a recuperarla pero, naturalmente, la otra pareja de espías formada por Lauren y Sark ya están por allí y reciben a los agentes de la CIA con disparos, aunque logran ponerse a salvo.

En Zúrich, Sloane sigue a Barnett y se disculpa con ella en el vestidor del restaurante. El agente le confiesa su secreto: desde hace más de veinte años vive con el remordimiento de haber traicionado a su amigo Jack Bristow al tener una aventura con Irina. Barnett le pregunta si es él el padre de Sydney a lo que Sloane no responde.

En el barco, Sydney encuentra la bomba y Vaughn encuentra a uno de los agentes rivales: se trata de Lauren pero como va con la cabeza cubierta, no la reconoce. Cuando le dice que se quite la capucha, Sark le grita desde abajo, apuntando a Sydney a la cabeza, que tire el arma ya que "si quiere a su compañera, lo hará". Vaughn lo hace y es golpeado por Lauren, que huye. Syd y Vaughn logran coger a Sark que en vez de escapar, activa la bomba y se la lanza a los dos. Gracias Marshall, sin embargo, Vaughn puede desactivar el artefacto explosivo.

La CIA a intercepté une transmission indiquant qu'un groupe de terroristes serait en possession d'une charge à plasma, une bombe qui pourrait causer beaucoup de dommages. Afin de localiser et intercepter la bombe, Sydney et Vaughn doivent accéder aux ordinateurs d'un bâtiment d'entreposage digital à Vancouver ... Jack est chargé de coordonner une enquête pour découvrir s'il y a une taupe au sein de la CIA ...

ווהן וסידני יוצאים בעקבות מטען פלסמה שנמכר לטרוריסטים. סארק ולורן גם יוצאים בעקבות המטען ותוך כדי כך מתחיל להתפתח ביניהם רומן. סלואן חושף בפני ד"ר ברנט סוד שעשוי לזעזע את סידני וג'ק.

Sydney en Vaughn worden door onbekende belagers in de val gelokt als ze een plasmabom proberen te onderscheppen. Lauren en Sark bestendigen hun nieuwe partnerschap, Sloane onthult een duister geheim aan dr. Barnett en Marshall gaat gebukt onder de spanningen van zijn recente vaderschap.

Dixon tájékoztatása szerint a Fénylő Kard nevű terrorszervezet plazmatöltethez jutott. Sydney és Vaughn feladata, hogy mindenképp szerezze vissza az óriási pusztításra alkalmas töltetet. Akciójuk során símaszkos alakok támadnak rájuk. - Egyikük Lauren, Vaughn felesége. Ám Lauren, még mielőtt Vaughn előtt lelepleződne, Sark segítségével egérutat nyer. Így Vaughn továbbra sem sejti, hogy neje kettős életet él. Csak annyit tud, hogy valaki kiadja a titkos információikat.

While trying to retrieve a bomb, Sydney and Vaughn are ambushed by unidentified assailants. Meanwhile, Lauren and Sark continue to solidify their new partnership, Sloane divulges a dark secret to Dr. Barnett and Marshall shows the strains of new fatherhood.

Mentre cercano di recuperare una bomba al plasma, Sydney e Vaughn scoprono di avere altri due pericolosi rivali, che altri non sono che Lauren e Sark. Sloane rivela un segreto al dottor Barnett: ha avuto una relazione con Irina Derevko. Marshall comincia a fare il papà a tempo pieno del neonato Mitchell.