Irina befindet sich in Stuttgart, um Informationen aus einer genetischen Datenbank zu bekommen. Sydney und Vaughn sind ihr dicht auf den Fersen. Es kommt zu einem Zwischenfall, bei dem Sark aus nächster Nähe auf Vaughn schießt. Kurz darauf stellt sich Irina den beiden Agenten und rettet ihnen damit das Leben.

Jack informa a Sydney del escape de su madre y esta acude a la celda de Irina donde encuentra sus pendientes. A pesar del odio que siente hacia esa mujer, como le reconoce a Dixon, decide guardar los pendientes. Para empeorar las cosas, la CIA declara abiertamente que Vaughn se encuentra bajo investigación oficial.

Kendall y Jack tienen una agria discusión cuando la CIA asciende a Jack a director del Centro de Operaciones Conjuntas. Su nueva misión es la localización y captura de Irina y Sloane. Para ello, usarán un localizador que Jack inyectó secretamente en Irina y cuya activación tendrá lugar en 12 horas.

De nuevo en libertad, Irina y Sloane viajan en un avión privado donde están realizando sus planes. Aunque Sloane trata de sacar a relucir cuestiones personales, Irina le advierte de que no hable de su amor por Sydney delante de ella. El avión se dirige a la Toscana italiana, donde Sloane quiere fijar su residencia junto a Emily.

Vaughn ha sido degradado y restringido en sus tareas, aunque sigue formando parte de Operaciones Conjuntas. Le aconseja a Vaughn que pida un traslado puesto que no cree saludable para ella que su misión actual sea perseguir a su madre para apresarla. Sydney le asegura que está más que preparada incluso para dispar a Irina si fuese necesario.

En Stuttgart, donde Irina y Sark viajan para acceder a una serie de datos genéricos, se activa el trazador y Sark detecta presencia de la CIA por lo que deciden abandonar el edificio. Sark y Vaughn se enfrentan en un tiroteo y Vaughn es alcanzado, aunque afortunadamente viste un chaleco antibalas. Irina se hace perseguir por Sydney y Vaughn, con la única intención de sacarles del edificio y salvarles de la explosión del mismo. La CIA cree que la obtención de la base genética tiene como objetivo el desarrollo de armas dirigidas específicamente a ciertos sujetos.

En la Toscana, Sloane hace llamar a Emily y esta queda boquiabierta al ver a Irina, a la que creía muerta desde hace años. Emily está confusa y muy enfadada con su marido, al que acusa de seguir jugando con la verdad pero Sloane dice que todo lo hace por ella, que con lo que está descubriendo podrá salvarla del cáncer para siempre. Poco después, Emily acude al consulado estadounidense en la Toscana y a través de él contacta con Sydney. Emily ofrece entregar a su marido si a cambio no es condenado a la pena de muerte. La CIA acepta el trato. Lo que Emily no sabe es que Sloane ha ofrecido a Irina la venta de todos sus artefactos Rambaldi y que está dispuesto a abandonar su vida por su mujer. Acuerdan un encuentro en su casa.

El asalto a la villa es inminente, toda la CIA, incluyendo Sydney, Vaughn y Dixon, están en posición para atrapar a Sloane. Sin embargo, Emily se arrepiente de lo hecho y en la intimidad, con su marido, se desabrocha la camisa mostrando el micrófono oculto. Sloane decide escapar, ofreciendo a Emily que huya con él, y el matrimonio junto a Irina huyen a través de un conducto subterráneo, aunque Sydney les pisa los talones. Sydney cumple su amenaza y dispara a su madre en el brazo cuando esta escapa a través de una escalera, aunque Irina es capaz de huir de la CIA. Dixon, mientras, apunta con un rifle a Emily y Sloane y cuando tiene a Sloane en el punto de mira dispara, aunque acierta en Emily. Irina tira de Sloane que no quiere separarse de su mujer y ambos huyen en un helicóptero.

Tanto la CIA como Sloane están destrozados por el resultado del asalto, especialmente Sydney. De vuelta en su casa, ella y Vaughn están en el dormitorio cuando los pendientes de Irina comienzan a emitir un sonido rítmico que ambos reconocen como morse. El mensaje dice "La verdad lleva tiempo".

Sydney faces off with her mother, while Emily must decide whether to side with her husband or betray him.

Jack informa Sydney del tradimento di Irina. Sloane in Toscana si ricongiunge con la moglie Emily. Jack riceve ordini da Kendall di ritrovare Irina, la quale è a Stuttgart insieme a Sark. Will ha scoperto cosa contengono i dati che ha esaminato: si tratta del DNA di milioni di cittadini. Syd è sulle tracce della madre Irina.

CIA zoufale pátrá po zrádkyni Irině Derevkové. Stopy je zavedou do Stuttgertu a blíže též Sarkovi a Sloanovi. Irina se Sloanem chtějí získat výsledky výzkumu lidského genomu. Mohli by si vyrobit geneticky cílený virus. Události však přinutí Sloana, aby se všeho vzdal a zůstal s Emily. A Sydney dostane zprávu vysílanou Irininými náušnicemi, že pravda chce svůj čas.

ה-סי-איי-איי מאתר את אירינה דרבקו בגרמניה, אך כושל בלכידתה. אמילי סלואן מדווחת לקונסוליית ארה"ב בפירנצה על מיקומו של בעלה. ווהן וסידני יוצאים ללכוד את סלואן ואירינה בטוסקנה.

Tandis que Vaughn est mis hors jeu en raison de l'enquête dont il fait l'objet, Sydney apprend que sa mère a trahi la CIA en volant le manuscrit de Rambaldi et rejoignant Sloane. Irian et Sloane doivent être retrouvé et Jack est officiellement nommé pour diriger la mission ...

에밀리는 남편에 관한 결정을 내려야 한다.

Irina tudta nélkül Jack egy alvó adóvevőt ültetett a bőre alá, hogy ha az asszony mégis megszökne a CIA-tól, követni tudják. Sloane egy génkutató központ kutatási eredményeit akarja megszerezni, hogy Rambaldi műveinek segítségével megtalálja az örök élet titkát. Irina vállában az adóvevő sugározni kezd. Sark rájön, és figyelmezteti. Elektrosokkal sikerül hatástalanítaniuk, és a nő ismét eltűnik a CIA látóköréből. Emily találkozik a régen halottnak hitt Irinával, és rájön, hogy férje képtelen megváltozni, ezért jelentkezik a firenzei konzulátuson, és felajánlja, hogy a CIA kezére játssza a férfit. Az akció rosszul sül el, és Dixon pisztolya véletlenül Emilyt találja el...

Na haar moeders bedrog bereidt Sydney zich lichamelijk en geestelijk voor op hun volgende ontmoeting. Sydney en Vaughn sporen Irina op in een lab in Duitsland waar zijn probeert een gecodeerde database in handen te krijgen. Emily Sloane duikt op in Florence, waar ze moet besluiten of ze samenwerkt met haar man of hem zal verraden.