A rendőrök kénytelenek elengedni Sloane-t, aki azzal fenyegetőzik, hogy a kezében lévő távirányítóval levegőbe röpíti az épületet. Sydney lakásában Vaughn felfedez egy lehallgatókészüléket. A CIA átvizsgálja a lakást, és több poloskát is talál, melyekről kiderül, hogy Marshall készítette őket Sloane számára. A CIA állást ajánl Dixonnak, de Dixont a felesége azzal fenyegeti, hogy elhagyja, amennyiben elfogadja az állást. Sloane Afganisztánban felkeres egy pastu hadurat, és felajánlja neki, hogy társuljon vele. Kabir feltétele, hogy az új fegyverrel öljék meg volt feleségét, aki Mexikóban dolgozik, a Vatikán nagykövetségén. Sark beveti a fegyvert, mely az embereket nyomtalanul "eltünteti" anélkül, hogy a környezetükben a legcsekélyebb kár keletkezne.

סלואן נוטש את סידני ומרכיב נשק קטלני, שבעזרתו הוא רוכש בן ברית בדמותו של בעל צבא פרטי מפקיסטן. ווהן מאתר את מכשירי הציתות בדירתה של סידני. דיקסון מתחיל לעבוד למען ה-סי-איי-איי.

Sloane trifft sich in Kandahar mit dem Bandenchef Ahmad Kabir und heuchelt Interesse an einer Zusammenarbeit. Der will allerdings von Sloane zuvor eine Demonstration seiner Macht und fragt ihn nach einem bestimmten „Ziel“. Ohne zu zögern gibt Sloane seine Ex-Frau an.

Sloane si prepara a testare l'arma di Rambaldi e prova a convincere Kabir a diventare suo partner nel piano nefasto. Vaughn chiede aiuto a Will, mentre viene individuato quello che è l'obiettivo scelto da Kabir come prova. Vaughn chiede a Dixon di salvare Syd, mentre Sloane trova la pagina mancante.

Když se Sloaneovi dostane do rukou děsivá Rimbaldiho zbraň, která způsobuje vnitřní samovznícení, musí se Sydney obrátit o pomoc na zrazeného Dixona. Ale když její ex-parťák odmítá jakoukoli pomoc, nemá jinou možnost než provést misi sama. Když je Sydney unesena, musí Vaughn přesvědčit Dixona, aby pomohl CIA při záchraně Sydney z tábora v Afghánistánu.

시드니는 딕슨을 영입하라는 지시를 받는다.

Sydney et Sloane partent de la banque pendant que Vaughn désarme la bombe dans le sous-sol de la banque. Sloane parvient une de fois de plus à échapper à la CIA. Vaughn et Sydney découvrent que son appartement est sous écoute. Marshall les informe qu'il a fabriqué ce matériel d'écoutes alors qu'il était encore au SD-6. Sloane est à la recherche d'une nouvelle arme destructrice de grande envergure ...

A mysterious Rambaldi device's powers are finally revealed and Sloane has its secrets. Meanwhile, Vaughn begs Dixon to aid the CIA in rescuing Sydney, Will is called upon to participate in a crucial CIA briefing session, and Sydney senses that Francie is keeping secrets.

De krachten van een mysterieus apparaat van Rambaldi worden eindelijk ontrafeld, maar een verraderlijke Sloane heeft geheimen. Vaughn smeekt de weinig coöperatieve Dixon om de CIA te helpen Sydney te redden. Will wordt gevraagd mee te werken aan een cruciale CIA-briefing. Sydney voelt dat Francie geheimen heeft.

Sloane consigue escapar saltando del coche en una persecución donde le asisten sus subordinados. Sydney y Kendall discuten sus frustraciones por lo escurridizo que es Sloane.

La casualidad hace a Vaughn descubrir un micrófono en el apartamento de Sydney y Marshall lo identifica como suyo propio, ya que él mismo lo fabricó cuando trabajaba en el SD-6. Ahora el pequeño genio tendrá que desmontarlo para tratar de averiguar quién lo implantó allí, hacia donde transmitía y qué conversaciones había grabado. Francie informa a Sark de que han descubierto los micrófonos así que le aconsejan que encuentre rápidamente un chivo expiatorio. Francie asesina al fontanero y dispone una serie de pruebas que le incriminan, dando carpetazo al tema.

Sloane intenta obtener un aliado en Afganistán, para conseguir una serie de materiales que sólo él puede entregarle. La CIA descubre esta reunión y parece que sólo Dixon puede encargarse de este tema, debido a alguna misión suya en el pasado de modo que Kendall ordena a Syd que convenza a Dixon para que se una a la CIA, pero de nuevo rechaza la proposición. Will, que estaba investigando a Kabir, el potencial aliado de Sloane, recomienda que contacten con su ex mujer, la cual puede ofrecerles información sensible para llegar a él y usarla para que colabore con la CIA.

La casualidad hace que Sark se dirija al mismo lugar, con la intención de asesinar a la ex esposa de Kabir con el arma Rambaldi que acaban de construir. Syd y Kazabi, la ex mujer, huyen del lugar justo cuando Sark hace uso del arma. Aunque no ocurre nada en un principio, de repente las personas ¡¡comienzan a arder espontáneamente!! resultando todas muertas. Kazabi, al ser convencida de que su ex marido está por medio, decide colaborar.

Los vídeos de las muertes son suficientes para que Sloane cuente con un nuevo aliado mientras que la CIA tome con preocupación esta nueva arma. De ese modo Sydney viaja con un traje especial que la protege, a la base de Kabir para desmantelar esta nueva arma. Sydney es apresada pero la CIA decide no montar un equipo de rescate, de modo que Vaughn solicita ayuda a Dixon. Éste decide ayudar y consiguen salvar a Sydney, aunque tienen que matar a Kabir.

Aparentemente, la pérdida del arma es un revés para Sloane pero éste mira la pieza de artesanía que Kabir le entregó a cambio del arma y la rompe, extrayendo de ella el trozo de página del manuscrito de Rambaldi que le faltaba.