While on a case to track the activities of Khasinau, a.k.a. "The Man," Sydney runs into her ex-lover, Noah Hicks, who broke her heart and left without saying goodbye five years earlier. Meanwhile, Sydney tells Sloane that she wants to find her mother; Jack is ordered to see CIA psychiatrist Dr. Barnett to help him deal with his churning emotions after discovering that his wife may still be alive; and Will and Francie become suspicious of Sydney's activities after finding one of her airline ticket stubs.

Jackovi a Vaughnovi se povedlo dostat Sydney ze spárů FBI díky odvedení pozornosti. Ona a Dixon se ale musí vypravit do Vídně a získat data na ruské ambasádě, aby znovu vystopovali muže známého jako Kasinov. Sydney se však na misi setkává se starou láskou. Vydá se s ním znovu na Sibiř, aby získala zařízení, které může poskytnout vodítka, které je dostanou blíže k úhlavnímu nepříteli SD-6.

Suite à son échappée sous-marine, Sydney s'est rendue au Mont Subasio en Italie, elle escalade les montagnes, prouvant de cette façon qu'elle n'est pas au coeur de la prophétie Rambaldi. Arrivée en haut, elle appelle la CIA via son téléphone-satellite ...

ג'ק מגלה שגופתה של לורה בריסטו לא נמצאה מעולם, וסידני מחליטה למצוא אותה. ווהן שולח אותה להשיג מידע על אדם שלטענתו הפעיל את אמה ואשר השתייך ל-קג"ב, מה שמפגיש את סידני עם דמות מעברה.

Tras escapar del FBI y viajar a Italia para probar que la profecía de Rambaldi era errónea, Sydney regresa a Estados Unidos y se entrega. Allí su padre le informa de que la agencia dirige sus pesquisas a la búsqueda de su madre, Laura Bristow, ya que nunca se probó que muriera en el accidente de tráfico y que, de hecho, se cree que sigue viva.

Sydney decide centrar sus esfuerzos en encontrar ella misma a su madre y solicita a Sloane un permiso especial, pero éste envía a Sydney a una misión relacionada con Khasinau. Sloane le dice que éste era el superior de su madre en el KGB y que por ello la misión está directamente relacionada con Irina Durevko, el verdadero nombre de Laura Bristow.

La misión les lleva a Austria pero su contacto es asesinado y Sydney escapa gracias a Noah Hicks, un antiguo novio que también es agente del SD-6 y que fue asignado a una misión de larga duración fuera de Estados Unidos. Syd y Noah extraen el chip del difunto contacto y Noah, habiendo descubierto su condición de espía, consigue escapar de allí gracias a Dixon y Sydney.

Días más tarde, ambos tienen que realizar una misión en Rusia, donde Sydney aprovecha para investigar más sobre su madre y confirmar parte de los datos de los que ya dispone. Allí, la vieja llama entre ambos agentes es puesta a prueba. Después de su misión, Sidney y Noah llegan a la casa de refugio y Noah le confiesa a Sidney que lo atrae. Acto seguido, Sidney se levanta y lo besa y hacen el amor.

Mientras, Jack está furioso con Sloane por haberle ocultado el informe que recogía la creencia de que Laura seguía viva y decide ahogar sus penas en alcohol, a pesar de la oferta de Sydney para intentar hablar sobre sus sentimientos. La CIA ordena a Jack que vea a la Dra Barnett, pero este rechaza la orden, aunque más tarde se obliga a sí mismo a acudir a la terapia.

Om te bewijzen dat ze niet de vrouw uit de profetie van Rambaldi is die de wereld zal vernietigen, beklimt Sydney de Monte Subasio. Volgens Rambaldi's profetie zal ze die klim niet volbrengen. Bij terugkomst komt Sydney tot haar verrassing haar ex Noah tegen, een SD-6-agent met wie ze vijf jaar eerder iets had. Hij moet de bezigheden van 'De Man' in de gaten houden.

시드니는 한때 사귀었던 SD-6 요원과 재회한다.

Sydney konnte vor dem FBI fliehen und hat nur noch ein Ziel: Beweise für das Überleben ihrer Mutter Laura zu finden. Sie ist nicht die Einzige, auch die CIA sucht inzwischen nach ihr. Anstatt Sydney auf ihren eigenen Wunsch zu beurlauben, schickt Sloane sie mit Dixon nach Wien. Dort sollen sie sich auf einem Maskenball mit jemandem treffen, der ihnen mehr über Khasinau sagen kann.

Sydney mindent elkövet, hogy bebizonyítsa, nem róla mintázták a Rambaldi-féle műtárgyon azt az asszonyt, aki pusztulást hoz a világra. Miközben ő Olaszországban próbál bizonyítékokat találni, apja meglepő dokumentumokat talál Sydney anyjáról, akiről mindenki azt hitte, hogy 20 éve autóbalesetben halt meg. Sydney is értesül a fejleményekről és azonnal Bécsbe utazik, ahol találkozik valamikori barátjával...

Mentre è impegnata in una nuova missione a Vienna, Sydney si imbatte in una sua vecchia fiamma, nonché altro agente, Noah Hicks, che l'ha piantata cinque anni prima. Jack consulta uno psichiatra, dopo aver scoperto che sua moglie Laura è ancora viva. Will e Francie cominciano a nutrire alcuni sospetti su Syd.