母亲和妹妹都被死亡商人幽灵所杀的隼太郎志愿加入了国际刑警组织，成为了飞天五虎将的S5号。他和四名同伴一起，使用各种科学装备和幽灵战斗。

『巨人の星』『いなかっぺ大将』で有名な川崎のぼるの漫画が原作のスパイアクションアニメ。平凡な青年・隼太郎は、機密マイクロフィルムを狙う死の商人ゴーストの暗躍に巻き込まれ、母と妹を失う。彼は世界の悪と戦う日本国際秘密警察スカイヤーズに参加を志願し、Ｓ５号のコードネームでゴースト打倒を誓う。Ｓ１号ことキャプテンやＳ３号ユリなど４人の仲間そして愛犬ピーターと共に科学装備で悪に挑むＳ５。彼の戦いの行方は？