Drie proefpersonen ontwikkelen vreemde symptomen na een uitgebreid experiment en wenden zich tot geneticus Dr. Alex Sarkov voor hulp.

In de hoop Sarkov te vinden, gaan de Imperfecten op zoek naar een andere deelnemer aan het Welzijnsprogramma, terwijl ze omgaan met de gevolgen van hun nieuwe krachten.

Terwijl Juan weer in contact komt met zijn familie, ontmoeten Abbi en Tilda een andere proefpersoon met eigen krachten. Onderzoekers openen de jacht op de Imperfecten.

Bij Sarkov thuis doen Tilda en Juan een schokkende ontdekking. Abbi en Hannah vrezen dat Finch een bedreiging kan vormen voor Dr. Burke.

Burke en Sarkov beginnen aan een geneesmiddel, met Burke als proefpersoon. Met overheidsagenten op de hielen komt de groep samen om zich tegen hen te verdedigen.

Abbi, Juan en Tilda onderzoeken een aanval door een mutant. Sarkov komt steeds dichter bij een geneesmiddel en Burke heeft een doorbraak.

Sarkov heeft nanobots nodig voor zijn geneesmiddel en stuurt het team op een missie in Idaho. Burke en Finch werken samen om Dr. Crain een stap voor te blijven.

Na slechts nieuws van het thuisfront probeert Abbi de remedie na te maken. Juan gaat naar een feest. Tilda probeert Sarkov te waarschuwen voor de risico's van nanobots.

Abbi en Tilda gaan samen met een onverwachte bondgenoot achter Sarkov aan, die grote plannen heeft voor Juan. Nieuwe onthullingen brengen nieuwe uitdagingen voor de groep.