Depois de impedir um assalto de Rupert Thorne, Batman retorna à batcaverna para saber que todos os criminosos no Asilo Arkham foram misteriosamente libertados. Batman descobre que foi um palhaço enlouquecido chamado Coringa quem os libertou, e ele planeja fazer um dirigível cheio de gás hilariante explodir sobre Gotham para que cada cidadão se transforme em lunático. Cabe ao Batman detê-lo.

Depois que um estranho abutre começa a roubar diamantes e joias, Batman decide descobrir quem está por trás disso. Acontece que o vigarista é o rude e egoísta Osward Cobblepot, também conhecido como Penguin, que vai à festa de Bruce Wayne. Alfred tenta pegar Penguin por seu mau comportamento na festa, mas infelizmente, Penguin pega Alfred. Batman deve encontrar a mansão de Penguin e salvar Alfred, bem como derrotar Penguin e devolver todas as joias e gemas que ele roubou.

Três chefes da máfia querem se vingar do Batman porque ele constantemente derruba suas operações. Eles chamam um homem muito misterioso chamado Bane para acabar com ele, de uma vez por todas. Bane pode parecer um criminoso normal, mas ele tem um segredo, um segredo tão poderoso que poderia destruir toda Gotham. Após seu primeiro encontro, Bane facilmente derrota Batman, machucando-o gravemente. Agora, Batman deve pensar em uma nova maneira de parar essa ameaça.

Depois de seguir em uma longa perseguição com sua nova inimiga, Mulher-Gato, o cinto de utilidades do Batman é roubado. Agora, com o cinto nas mãos erradas, Batman precisa descobrir como encontrar o ladrão antes que ela não use o cinto.

Um bando de morcegos leva Yin e Bennett às Indústrias Wayne, onde Bruce tem um cientista chamado Dr. Langstrom trabalhando em um projeto relacionado a morcegos. Na verdade, Langstrom realmente desenvolve um soro que pode transformá-lo no "" Homem-Morcego "", então as pessoas vão temê-lo. Homem-morcego sai de controle e voa para a cidade, alimentando-se de sangue animal.

Usando seus novos poderes de gelo, o Sr. Freeze rouba os diamantes mais raros e valiosos de Gotham. Quando ele e o Batman se cruzam pela primeira vez, ele diz ao Morcego que é a razão de ele ser um monstro criogênico. É por causa de uma perseguição muito anterior entre eles, que levou a um laboratório de criogenia. Ele não vai parar por nada para fazer de Gotham seu domínio pessoal, a menos que o Batman possa pensar em uma maneira de impedir essa ameaça.

Batman conhece Vagalume, um homem que se veste com um conjunto de mosca fortemente blindado e tem um jet pack turbo aprimorado. O Vagalume invade várias empresas de Gotham, destruindo sua tecnologia, e voa para os céus quando Batman chega. Como o Morcego descobre, ele não é um inimigo fácil de derrubar. Enquanto isso, Bruce se encontra com o prefeito Grange, que lhe diz que ele terá que dar o trabalho de caridade de seu pai para a GothCorp em vez da Wayne Enterprises devido ao seu estilo de vida.

Arthur Brown, um homem inteligente que agora se autodenomina O Mestre das Pistas, planeja vingança sobre as pessoas envolvidas no game show "" Think Thank Thunk "" por deixar seu oponente vencer anos atrás. O Batman pode detê-lo e salvar os reféns do Mestre das Pistas?

Arnold Wesker é um ventríloquo que controla Scarface, um fantoche vivo que tem uma personalidade totalmente diferente. Juntos, eles arrancam assaltos a bancos e Scarface promete que este é o último deles. Scarface, junto com dois músculos nodulares, planejam roubar uma reserva de ouro de Gotham Bank. Batman tenta parar o fantoche e seus lacaios. Enquanto isso, Alfred faz o papel de casamenteiro de Bruce.

Coringaestá fora de Arkham. Ele está perseguindo todos os responsáveis ​​por fazê-lo ser preso, transformando-os em cartas de baralho ... com o Batman sendo seu principal alvo.

Penguin tem ciúmes da riqueza de Bruce Wayne e invade a Mansão Wayne. Ele sequestra Alfred e vasculha o lugar enquanto Bruce está dando uma entrevista. Batman chega para ajudar na hora certa, apenas para ser acorrentado por Penguin também. O Batman pode encontrar uma maneira de sair dessa bagunça maluca?

O Coringa está de volta à cidade e tem uma nova invenção, o Joker putty, que pode transformar qualquer coisa em borracha ou massa. Enquanto isso, o chefe Rojas diz a seus detetives para parar o Coringa e o Batman de uma vez por todas, dizendo que os dois não têm lugar em Gotham.

Saindo depois do episódio anterior, Ethan se transforma no monstruoso Cara-de-Barro pela massa do Coringa. Depois de fazer toda a cidade temê-lo e detestá-lo como Cara-de-Barro, ele tem como alvo o homem que ele mais despreza, o chefe Rojas. Quando Batman e Yin perceberem quem ele é, eles terão que trabalhar juntos para evitar que Ethan se torne algo como o Coringa.

Durante um assalto a museu, uma parceria é formada entre Mulher-Gato e Pinguim. Mas quando Penguin trai a Mulher-Gato antes que ela possa traí-lo, ela e Batman têm que parar Penguin antes que ele desencadeie seu verdadeiro plano: controlar o poder de Rá!

Um vilão misterioso conhecido como Charada desafia Yin, secretamente ajudado por Batman, a uma série de enigmas. As coisas não são o que parecem dos enigmas ...

Vagalume e Mr. Freeze se unem para colocar seu plano devastador em ação: colocar Gotham City de forma permanente em um inverno sem fim. Assim que o baile de gala de caridade do policial for colocado no gelo, tudo depende do Batman.

O Coringa decide assumir o papel de "Batman" e dosa Bruce com o veneno do Coringa para criar seu próprio arquirrival.

Crocodilo, meio homem, meio réptil, planeja submergir toda Gotham na água para facilitar o saque da cidade.

Penguin descobre um dispositivo sônico que permite que ele transforme o Homem-Morcego em seu escravo pessoal. Enquanto isso, Alfred deve lidar com um guaxinim que encontrou seu caminho para a Caverna do Morcego e está causando estragos no equipamento elétrico.

Ethan Bennett é capturado e levado a julgamento por seus crimes como Cara-de-Barro. Ele foi solto em liberdade condicional, mas pode achar as tentações de uma vida criminosa muito grandes.

Coringa pirateia as ondas de rádio de Gotham para divulgar seus crimes na TV como entretenimento. Quando o novo parceiro super cuidadoso do detetive Yin tenta derrubar o príncipe do crime, ele simplesmente se torna o mais recente "co-astro" do Coringa. O Batman precisa descobrir de onde o Joker está transmitindo antes de executar seu plano de fazer Gotham morrer de tanto rir!

Ragdoll, um contorcionista de junta tripla, cruza com o Batman e a Mulher-Gato enquanto tenta continuamente roubar artefatos de valor inestimável. Além disso, Selina Kyle faz amizade com Bruce Wayne ... mas quais são suas intenções?

Spellbinder, um místico de três olhos com a capacidade de induzir hipnose e visões, emprega os servos dos ricos para roubar o Olho de Sarkana - incluindo Alfred!

Solomon Grundy emerge de um pântano na noite de Halloween para espalhar o caos em Gotham.

Coringa faz a detetive Yin como refém, mas uma vez capturado, ele se recusa a contar sobre o paradeiro dela. Convencido de que é a única maneira de saber a localização de Yin antes que ela encontre sua morte, Batman usa um dispositivo criado pelo Professor Hugo Strange para entrar no cérebro bizarro do Coringa em busca de uma resposta.

Joker, Penguin e Riddler lutam pelo controle da cidade, até finalmente decidirem resolver suas diferenças entregando Gotham para quem conseguir capturar e descobrir a verdadeira identidade do Batman.