Se celebra un festival a cargo de los chicos superdotados del colegio, con la ayuda de la profesora Caroline. Nada más llegar los padres y hermanos de Malcolm al recinto, comienzan los desastres.

Reese se enamora de una animadora y decide hacerse animador con la ayuda de Malcolm y Dewey quiere le compren un juguete de moda e intenta convencer desesperadamente a Hal y Lois. Por otra parte, Francis tiene una conversación sincera con Spangler.

Hal vuelve a ser el hombre alocado que un día fue y ayuda a Malcolm y sus amigos superdotados a construir un robot asesino. Mientras, Lois visita la academia militar después de la operación de Francis.

Malcolm y sus traviesos hermanos construyen una moderna arma silenciosa a la vez que sus padres, Hal y Lois, intentan compatir a un motorista que circula a toda velocidad y que tiene aterrorizado a todo el barrio.

Malcolm y Reese compiten con Dewey para ver quién se queda con una encantadora niñera. Mientras, Hal y Lois asisten a una convención donde Hal no puede resistir pelearse con un antiguo enemigo.

Malcolm se somete a terapia para escaparse de su clase. Mientras, Francis se ocupa de limpiar la lavandería y Dewey se convierte en un prodigio en un juego de bolos. Por otro lado, Hal y Lois intentan limpiar un armario repleto.

Los amigos de Malcolm quedan en un segundo plano cuando de repente el chico se convierte en la estrella del teatro de la escuela. Por otro lado, Lois descubre las ventajas de un buen masaje.

Cuando Reese abandona su posición de matón del colegio, Malcolm sufrirá a manos de sus sucesores. Por otro lado, Francis se aterroriza por la llegada de su cumpleaños en la Academia Marlin.

Malcolm se mete en problemas con un vecino anciano. Por otro lado, el amigo perezoso de Francis se inscribe en la Academia Marlin; y Dewey intercambia su mochila por una cartera.

Malcolm experimenta su primer amor pero como una mezcla confusa de amor y odio. Mientras, Francis trata de escapar del castigo que le han impuesto por su última travesura.

Hal deja su trabajo para convertirse en un artista y Francis sufre una semana de trabajo haciendo inventario en Lucky Aide. Por su lado, Malcolm comienza a preguntarse sobre su carrera futura.

Malcolm es hospitalizado por apendicitis; mientras, Francis inicia una huelga de hambre en la Academia Marlin.

Cynthia, una amiga de Malcolm, invita a éste a su fiesta de cumpleaños. Malcolm, a pesar de que quiere ir, se siente un poco incómodo, porque el resto de la gente a la que ha invitado su amiga se dedica criticarla en secreto.

Malcolm intenta ayudar a Reese para que mejore sus notas. Mientras, Francis se exilia en la casa de un amigo después de desafiar la orden de Lois de arreglar el techo.

Sin darse cuenta, Hal es el responsable de la fuga de un químico tóxico que obliga a la evacuación del vecindario. Malcolm se enfrenta con ser castigado incluso en el refugio para desamparados; Francis sufre el encuentro de un sabelotodo de 12 años.

Tras las vacaciones de verano Malcolm regresa a la escuela, donde habrá ingresado una estricta profesora. Mientras, Eric se presenta en casa para hablar con sus padres sobre la decisión de emanciparse. Lois no acepta que Eric abandone la Academia.

Malcom logra su primer noviazgo oficial. Mientras Dewey inventa un amigo imaginario, y Francis encuentra refugio con un loco en una cabaña remota en Canadá.

Malcolm y sus hermanos se hacen pasar por recolectores de una iglesia de caridad y se quedan con las ganancias. Por su lado, Francis disfruta de su vida en un campamento forestal.

En su nuevo trabajo, Reese es acusado de robar. Mientras, Dewey intenta convencer a sus padres de que él puede mantener vivo a un pez, y Malcolm se irrita cuando un super genio entra en su clase.

Cynthia finalmente vuelve, pero enfadada y de malas maneras. Cuando Malcolm intenta saber que es lo qué está pasando, Malcolm descubrirá algo inesperado sobre la chica.

A Malcom y a los Krelboynes les obligan a alistarse en el “consejo” de estudiantes. Hal, por su parte, está tentado a derribar el arreglo de fichas de dominó que Dewey ha preparado.

Malcolm recibe grandes humillaciones durate su primera semana de clases en secundaria. Mientras, Dewey disfruta de su primera semana solo en casa, y Francis descubre el padecimiento de trabajar para un jefe demasiado permisivo.

Malcolm compite en un “octatlón” académico pero odia la intensidad y la seriedad con la que compiten los otros participantes. Mientras, Hal lucha por recuperar el cariño de Dewey, y Reese trata de evitar ir a un baile.

Hal se lleva a los muchachos a una exposición de novias, en donde Reese se mete en muchos problemas y a Hal se le olvida que es cumpleaños de Dewey. Francis y Piama están de visita, pero también Ida llega en el momento menos esperado y nadie la quiere en casa. Lois empieza a senir las contracciones del bebé.

Cuando Hal está saliendo del estacionamiento, tiene un pequeño accidente con el coche y tiene que ir con los muchachos al hospital. Lois llama a los amigos de Hal para que le ayuden a sacar a Ida de su casa. Al final, Francis ayuda a su mamá a que el bebé nazca.