Een eenzame zeemeermin wil haar onsterfelijkheid opgeven voor haar grote liefde. Deze man moet echter zijn liefde verklaren zodat de zeemeermin menselijk wordt. Wanneer hij dit niet voor een bepaalde tijd doet, gaat haar sterfelijkheid naar een boze waterheks. Ze vraagt de Halliwell-zussen om hulp. Nu Piper zwanger is, heeft ze echter moeite om haar magie te gebruiken. Wanneer Phoebe de scheidingspapieren wil tekenen, daagt Cole plotseling op.

Phoebe is in een zeemeermin veranderd en wil in de zee wonen. Ze wordt echter achternagezeten door een boze tovenaar die uit is op haar onsterfelijkheid. Haar zussen en Leo willen de demon uitschakelen en hun zus terug naar huis brengen. Cole wil bewijzen dat hij veranderd is en nog steeds van Phoebe houdt.

Een boze heks ontdekt dat de Halliwell-zussen meer krachten hebben dan haar en ze wil hen daarom uitschakelen. De heks laat de zussen verschillende sprookjes beleven en wil hen zo van het leven beroven. Ze zorgt ervoor dat Phoebe in Assepoester verandert en op een boze prins verliefd wordt. Ze laat Paige van een vergiftigde appel eten en verandert oma Halliwell in een boze wolf.

Een jongen bezit de gave om zijn tekeningen tot leven te brengen en een boosaardige demon wil dat hij het leven schenkt aan een gevaarlijke stripfiguur die een tovenaar moet doden. Wanneer de demon gevaarlijk wordt, besluit de jongen om drie vrouwelijke stripfiguren te tekenen die Piper, Phoebe en Paige in superhelden veranderen. Zij moeten zowel de jongen als de tovenaar tegen de demon beschermen.

Phoebe wil weten waarom ze de laatste maanden geen visioenen meer heeft en gaat daarom naar een waarzegster. Tijdens het waarzeggen heeft Phoebe een visioen dat ze zelf niet te zien krijgt, maar doorgeeft aan de zigeunervrouw. In het visioen ziet de vrouw een zigeunerjager die haar vermoordt en haar ogen steelt. Wanneer het visioen uitkomt, proberen de Halliwell-zussen de zigeuners te helpen.

De gevaarlijke demon Barbas speelt met Coles geheugen waardoor hij gewelddadig wordt. Hij heeft zichzelf niet meer onder controle en vraagt de Halliwell-zussen om hulp. Dezelfde demon manipuleert echter tevens Piper, Phoebe en Paige waardoor ze Cole niet willen helpen. Paige laat zich niet beïnvloeden door Barbas, maar ze zorgt er echter wel voor dat de demon Cole zijn krachten steelt.

Phoebe heeft voortdurend visioenen waarin haar nieuwe vriend Miles sterft. Samen met haar zussen probeert ze hem te beschermen. Cole krijgt bezoek van Bacarra, een tovenaar uit de toekomst. Hij vertelt hem dat Miles gedoemd is om te sterven en dat Phoebe door hem te beschermen zelf sterft. Cole kan voorkomen dat Phoebe sterft, maar daarvoor moet hij Miles zelf vermoorden.

Wanneer Cole zich realiseert dat hij opnieuw aan het kwade moet toegeven, plant hij een aanval op de Halliwell-zussen. Met deze aanval hoopt hij dat ze hem voorgoed uitschakelen en er zo een einde aan zijn lijden komt. Ondertussen krijgt Paige haar eerste opdracht als White Lighter. Ze is geschokt wanneer ze ontdekt dat de man die ze moet beschermen haar biologische vader is.

De boosaardige demoon Jeric gaat op zoek naar het perfecte lichaam om zijn geliefde Isis terug tot leven te brengen. Hij ontvoert Phoebe en brengt Isis' geest in Phoebes lichaam. Piper en Paige vragen aan Cole om hun zus op te sporen. Hij wil echter een deal sluiten met de demoon om zo Phoebes liefde terug te winnen.

Paige raakt betrokken in een auto-ongeval wanneer haar wagen plots op onverklaarbare wijze over de weg begint te slingeren. Paige komt er zonder kleerscheuren vanaf, maar een andere bestuurder raakt gewond. Kort nadien wordt Paige gearresteerd voor vluchtmisdrijf. Ook Piper heeft kopzorgen. Door haar zwangerschap is ze niet alleen bijzonder prikkelbaar, maar haar club wordt bovendien gesloten wegens een veiligheidsprobleem met de waterleiding en een rattenplaag. Ook voor Phoebe ziet de toekomst er niet rooskleurig uit. Zij wordt gedagvaard door één van haar lezers en dat levert haar een rechtszaak én haar ontslag op.

Cole wil meer dan ooit Phoebe terug aan zijn zijde. Hij besluit een Avatar-demon te worden. Hierdoor beschikt hij over onuitputtelijke krachten en kan hij teruggaan in de tijd om het heden te veranderen. Hij spreekt bijgevolg een spreuk uit waardoor iedereen terugkeert naar het moment waarop Piper en Phoebe Paige nog niet kenden en waarop Phoebe en Cole nog steeds een gehuwd stel vormden. Hij slaagt in zijn opzet, maar toch loopt ook in die periode niet alles zoals hij hoopte. Bovendien krijgt hij af te rekenen met een vastberaden Paige, de enige die zich ervan bewust is dat de realiteit waarin ze zich bevindt geen hedendaagse waarheid is.

Nadat de zussen Halliwell geplaagd worden door plagerige huisgeesten, besluiten ze een beroep te doen op een voodoo-dokter. Hij inspecteert het huis en stelt vast dat de geesten ontstaan zijn uit de energie van de demonen die de zussen door de jaren heen in hun huis hebben geneutraliseerd. Hij besluit de geesten te elimineren, maar vermoedt dat de zussen kwaadaardige heksen zijn en rapporteert dit aan zijn voodoo-gemeenschap. Deze besluit de zussen alle drie aan een obsessieve spreuk te onderwerpen die hen uiteindelijk zal doden.

Ten huize Halliwell heeft iedereen last van terugkerende nachtmerries. Piper heeft erotische dromen over een soapacteur. Leo droomt dat zijn pasgeboren kindje hem ontnomen wordt. Paige ziet in haar dromen hoe niemand interesse heeft om Pipers baby te zien. Phoebe droomt op haar beurt dat het Zandmannetje vermoord wordt door een demon. Voor Phoebe is het overduidelijk dat die dromen allen verwijzen naar iets dat zich in realiteit zal voordoen, temeer omdat ze dat in een visioen heeft gezien. Bovendien gedraagt iedereen zich in San Francisco bijzonder prikkelbaar.

De zwangere Piper wordt opgenomen in het ziekenhuis met hoge bloeddruk. Voor het welzijn van haar baby moet ze op doktersadvies zo veel mogelijk rusten en stress vermijden. Haar zussen proberen erop toe te zien dat ze zich geen kopzorgen hoeft te maken, maar dat wordt geen sinecure. Het Halliwell-huis wordt immers overstelpt met magische dieren, Phoebe en Paige zijn hun bijzondere krachten kwijt, het Boek der Schaduwen is plots blanco en op de koop toe komt vader Halliwell op bezoek met zijn nieuwe vrouw.

Piper is bevallen van een zoon. Hij draagt de naam Wyatt en wordt door de familie Halliwell met open armen in hun gezin ontvangen. Maar al snel blijkt dat twee demons het op de baby gemunt hebben. De Halliwell-zussen moeten dan ook tot het uiterste gaan om het kind te beschermen. Maar al snel blijkt dat ook Wyatt over bijzondere krachten beschikt. Ondertussen krijgt Phoebe af te rekenen met professionele problemen. De nieuwe eigenaar van de krant waarvoor ze werkt, brengt het voortbestaan van het dagblad namelijk danig in het gedrang.

De zussen Halliwell moeten afrekenen met een demon die het gemunt heeft op kabouters. Hij wil hun allen vermoorden en hun magie stelen. De zussen snellen de dwergen ter hulp en als beloning worden de zussen door hen met geluk overladen. Paige krijgt materiële welstand cadeau. Phoebe ontmoet de man van haar dromen en Piper slaagt erin een grote ster naar haar club P3 te halen. Maar net die fortuinlijke gebeurtenissen brengen het hele beschermingsplan in gevaar.

De relatie van Piper en Leo komt onder druk te staan. Piper ziet het allemaal niet meer zitten. Ten einde raad beroept ze zich op een magische spreuk waardoor ze samen met haar man een blik op hun toekomst kan werpen. Maar de spreuk gaat de mist in wanneer Phoebe en Paige terug naar het verleden gestuurd worden om Pipers herinneringen opnieuw te beleven. Bovendien gooit ook een tovenaar – die de drie zussen wil elimineren – roet in het eten.

Sinds jaren nemen drie nimfen de bescherming van een idyllisch meer op zich Wanneer één van hen aangevallen wordt een demon, snellen de Halliwell-zussen ter hulp. Ze slagen erin de demon te elimineren, maar dan maken de twee overige nimfen er een punt van dat Paige permanent de plaats inneemt van de gevallen nimf. De nimfen zijn enorm vastberaden, tot grote paniek van de Halliwell-zussen.

De Crone heeft het gemunt op Wyatt, de baby van Piper en Leo. Om zijn slag thuis te halen steelt de Crone van elke Halliwell een zintuig. Paige verliest haar stem, Phoebe haar gehoor en Pipers zicht wordt gestolen. Met de hulp van deze drie zintuigen probeert Crone Wyatts aandacht te vestigen en een ontvoering mogelijk te maken.

Oma Halliwell komt langs voor Wyatts doopceremonie. De zussen ontdekken echter al snel dat hun grootmoeder onwetend een geest uit het verleden met zich heeft meegebracht. Deze voormalige geliefde van oma Halliwell wil de drie heksenzussen om het leven brengen en zich herenigen met oma. Ondertussen worstelt Phoebe met haar geweten : moet ze ingaan op Jasons uitnodiging ook al betekent dit dat ze haar familie op dit belangrijke moment in de steek moet laten? Paige worstelt eveneens met liefdesperikelen. Zij spreekt een waarheidsspreuk uit over Nate om te achterhalen of hij zich waarlijk kan verzoenen met het feit dat ze een heks is.

Wanneer Leo verneemt dat alle Goden door de Titanen werden gedood, is hij ten einde raad. Hij beseft dat hij zo snel mogelijk orde op zaken zal moeten stellen. Terwijl een mysterieuze collega van hem de Halliwell-zussen ad interim begeleidt, zorgt Leo ervoor dat Phoebe, Piper en Paige over buitengewone krachten kunnen beschikken. Als Griekse godinnen moeten ze er op die manier kunnen in slagen om de Titanen te elimineren. Leo neemt hiermee een groot risico, want de keerzijde van de medaille is dat de heksenzussen mogelijk verslaafd raken aan hun buitengewone krachten en nooit meer terug de ouden willen worden.

De Halliwell-zussen hebben de gedaantes aangenomen van Griekse godinnen. Enkel op die manier kunnen ze erin slagen de Titanen te elimineren, maar ze hebben de grootste moeite om zich niet door hun buitengewone krachten te laten verleiden. Ondertussen komt Leo voor een hartverscheurende keuze te staan : één van de Goden worden of kiezen voor een gezinsleven met Piper en Wyatt.