Piper è incinta e non riesce più ad affrontare i demoni perché ha paura di mettere in pericolo il bambino; Paige intanto ottiene una promozione, divenendo un'assistente sociale, mentre Phoebe ha ottenuto una grande notorietà per la sua rubrica e sta pianificando il divorzio da Cole, ma questo riuscirà a tornare bloccando per il momento le pratiche del divorzio.

Una sirena di nome Miley chiede il loro aiuto, dicendo che se non riuscirà a far dichiarare il suo fidanzato Craig, dovrà morire: ha infatti stretto un patto con la strega del mare, che la renderà umana se egli le dichiarerà il suo amore, ma in caso contrario le prenderà la sua immortalità e lei morirà. Le sorelle riescono a far incontrare i due, ma quando Craig scopre che Miley è una sirena la lascia, e così la strega del mare la rapisce. Il Trio riesce a liberarla, trasformando Phoebe in una sirena e trovando la strega del mare, ma alla fine Phoebe decide di restare nell'oceano.

Phoebe è sempre più decisa a restare nell'oceano. Piper, per cercare di salvare sua sorella, fa un incantesimo su se stessa per liberarsi dalle sue paure, ma questo le si ritorce contro facendola diventare impavida fino a rischiare la sua vita e quella del bimbo che porta in grembo. Con l'aiuto di Cole le due sorelle riescono a riportare Phoebe indietro e Cole seppure a malincuore decide di concederle il divorzio e lasciarla libera.

La strega cattiva si libera uccidendo il guardiano delle favole e quando scopre che ci sono tre streghe più forti di lei, Piper, Phoebe e Paige, tenta di eliminarle facendole vittime delle più famose fiabe. Intanto Piper, temendo di non riuscire a proteggere il bambino che porta in grembo, chiede a Leo di far tornare sua nonna sulla terra, ma ad accontentarla non sarà suo marito ma il suo magico bambino.

Un demone che capta i poteri degli altri usa un ragazzo che grazie a dei disegni magici riesce a farsi trasformare in un super cattivo dei fumetti e avere finalmente dei poteri. Dopo aver incontrato il ragazzo le tre streghe decidono di aiutarlo e lui all'insaputa del demone trasforma le tre sorelle in supereroine.

Phoebe scopre, attraverso una chiromante, che un demone di nome Cree ruba gli occhi alle zingare nel tentativo di cancellare un incantesimo fatto al padre. Phoebe, è inoltre preoccupata in quanto non ha premonizioni da mesi e anche il suo potere di levitazione si è drasticamente ridotto. Tuttavia, ella riesce a riprendersi alla meglio: le sue premonizioni, d'ora in poi, saranno più pericolose per lei, in quanto vi interagisce tramite la sua proiezione astrale.

Paige non crede di essere all'altezza del Trio. Intanto il demone della paura, Barbas, vuole impossessarsi dei poteri di Cole per prendere il comando degli inferi e distruggere il potere del Trio. Con l'inganno riesce a convincere Paige a creare una pozione che liberi Cole dai suoi poteri essendo vittima di visioni che lo portano a far del male agli innocenti. Cole acconsente di togliersi i poteri ma nessuno sospetta che così facendo questi passeranno a Barbas.

Phoebe ha una premonizione in cui vede Miles, il suo nuovo compagno, morire in un conflitto a fuoco. Con l'aiuto di Piper riesce a impedire che la premonizione si avveri, ma stranamente il ragazzo continua a rischiare la morte a causa di misteriosi incidenti, e ogni volta viene salvato da Phoebe. Nel frattempo arriva dal futuro il demone Bacarra, incaricato dal Cole del futuro di salvare Phoebe: difatti Miles è destinato a morire e se la ragazza continuerà a proteggerlo morirà anche lei.

Paige, al suo primo incarico come angelo bianco, deve proteggere Sam, un brav'uomo che sembra abbia perso la retta via. Quando un angelo nero prova ad attaccare Sam, Paige porta il suo protetto in casa Halliwell e Piper lo riconosce: è l'angelo bianco di sua madre, il padre di Paige. Nel frattempo Cole, distrutto dal dolore per aver perso Phoebe, cerca di suicidarsi facendosi uccidere dalle sorelle, ma scopre di essere diventato invulnerabile. Si scopre inoltre che anche Piper è divenuta invulnerabile, protetta dall'immenso potere della creatura che porta in grembo.

Jeric è un demone che usa il corpo delle streghe per contenere lo spirito della sua amata Isis, sperando che, se riuscirà a trovare una strega abbastanza potente, Isis impossessandosi dei suoi poteri potrà scacciarne via lo spirito e appropriarsi del corpo definitivamente. Finora però l'incantesimo non ha mai funzionato e ben presto la presenza di due anime nello stesso corpo porta la strega alla morte, così quando la strega sta per soccombere, Jeric la mummifica per non far passare oltre lo spirito dell'amata, e si mette alla ricerca di un altro corpo. Stavolta la strega presa di mira è proprio Phoebe, che viene rapita da Jeric e posseduta da Isis. Quando Cole lo viene a sapere, si unisce a Jeric, mummifica Phoebe e aiuta Jeric a rapire Paige.

Cole, deciso a riconquistare Phoebe cerca di conquistare il Nesso, una potente forza intrappolata sotto le fondamenta di casa Halliwell. Per farlo organizza una serie di eventi che portano le sorelle ad essere nei guai con la legge, tra questi l'omicidio di una donna a seguito di un incidente stradale con Paige. Piper, per poter far uscire la sorella di prigione, si fa prestare i soldi da un usuraio mettendo la casa come garanzia, ma l'usuraio in realtà è Cole che con questo patto entra in possesso della casa.

Cole compie 118 anni, ma il dolore della perdita di Phoebe è diventato insopportabile, decide così di unirsi alle Incarnazioni ottenendo enormi poteri, tra cui quello di creare una realtà alternativa dove Paige, dopo la morte di Prue, è stata a sua volta uccisa dal demone Shax e quindi non ha mai conosciuto le proprie sorelle. Cole è infatti convinto che se il Trio non fosse stato ricostituito lui e Phoebe non si sarebbero lasciati. Tuttavia il piano di Cole fallisce in quanto Paige, che nel momento in cui Cole compie l'incantesimo stava orbitando, finisce in questa realtà alternativa. All'inizio Paige ha difficoltà a convincere le sue sorelle e Leo di ciò che è effettivamente accaduto, ma poi ci riesce, ricomponendo così il "Potere del Trio": dopo alcuni ripensamenti, Phoebe sceglie di eliminare definitivamente Cole, che scompare anche nella vita reale.

I demoni che le Sorelle hanno eliminato nel corso degli anni hanno creato delle forme di energia negative che continuano a provocare danni in casa Halliwell. Le Sorelle così chiamano uno stregone che le elimini, ma lui, impressionato dall'energia negativa presente in quella casa sospetta che Piper, Phoebe e Paige siano cattive e cerca di distruggerle utilizzando le loro ossessioni. Piper diventa ossessionata dall'ordine e dalla pulizia della casa, Phoebe dal lavoro e dalla concorrenza e Paige dal suo migliore amico-ex fidanzato, di cui è ancora innamorata, prossimo al matrimonio con la sua nuova ragazza.

L'essere che fa sognare gli uomini è inseguito da un demone braccatore e chiede così aiuto al Trio per salvare se stesso, il suo popolo e i sogni di tutti. Ma il demone fa in modo che i sogni delle sorelle diventino realtà e loro sono costrette a sconfiggere prima i loro demoni interiori per poter eliminarlo.

Durante una notte in cui nel cielo splende una spettacolare e anomala aurora boreale, Piper sviene all'improvviso e, dopo una visita in ospedale scopre di soffrire tossiemia insorta a causa della sua stressante vita di strega combinata con i naturali sintomi della gravidanza e che, se non vuole compromettere la salute della nascitura, deve attendere il parto rilassandosi il più possibile e cercando di evitare tutte le situazioni che potrebbero darle ansia.

Mentre le Halliwell iniziano ad abituarsi alla vita con il bambino alla villa, arrivano i primi guai: qualcuno tenta di rapire il piccolo. Paige, recatasi al mercato dei demoni per cercare di scoprire chi sia stato, viene rapita da alcuni demoni chiamati Parassiti.

Phoebe ha un nuovo capo di lavoro, da cui è irresistibilmente attratta, Jason Dean.

Viene inoltre scelto il nome per il bimbo: si chiamerà Wyatt, in onore del papà Leo, e come secondo nome Matthew, in onore della zia Paige.

I leprecauni sono minacciati da un demone dagli occhi di serpente che vuole rubare le loro pepite d'oro, fonti della fortuna che trasmettono agli uomini. Paige, venendo a conoscenza da Leo che il mondo sta passando un periodo di sfortuna, pronuncia l'incantesimo della buona sorte che la fa teletrasportare nel mondo dei leprecauni.

Quando i primi conflitti coniugali causano una perdita di controllo dei poteri di Piper, sua sorella Phoebe fissa un appuntamento con un consulente matrimoniale. Piper fa un incantesimo riuscito male che porta Paige e Phoebe dentro i ricordi di Piper e Leo per riviverli, dove incontreranno una donna che è in realtà uno spirito famigliare, ed era stata fino a due anni prima la loro gatta Kit.

Le tre ninfe dei boschi sono perseguitate da un demone di nome Xavier che vuole raggiungere l'acqua magica che rende immortali. Le ninfe, dopo la morte del satiro e anche di Lily, una di loro, chiedono aiuto alle Halliwell per difendersi e per aiutarle a trovare il loro satiro. Piper ferisce Xavier che non è più in grado di inseguire le ninfe e Paige viene trasformata in ninfa dalle due rimaste. Tull, il fratello minore di Xavier, si finge il satiro che Paige e le altre due ninfe cercavano e le tre lo conducono alla fonte dell'acqua magica, dopo averlo fatto Paige capisce che è un demone, torna strega e, con le sorelle, lo trasformano in un albero dato che è diventato immortale poiché ha bevuto dalla fonte.

Crone vuole conoscere la potenza del bambino del Trio e con la magia del totem delle tre scimmie, ruba i sensi alle tre sorelle rendendo Piper cieca, Phoebe sorda e Paige muta. Unendo le forze il Trio riuscirà a sconfiggere anche questa forza demoniaca e Wyatt, orbita per la prima volta per salvare il papà.

Piper, preoccupata che qualche demone interferisca con l'iniziazione di Wyatt, elimina tutti i demoni che potrebbero attaccare il bimbo. Nel giorno della cerimonia invocano nonna Penny che scopre che il suo pronipote è un maschio. Intanto Piper, Phoebe e Paige scoprono l'esistenza del demone Negromante, un fantasma che vuole assorbire tutta la magia delle loro antenate per tornare in vita. Nonna Penny viene sedotta dal demone, suo amante quando erano in vita, ma grazie all'incantesimo della verità pronunciato da Paige anche per risolvere una sua situazione personale, riusciranno a salvare la magia Halliwell.

Quando i Titani, dei della mitologia greca, vengono liberati dopo secoli trascorsi sotto i ghiacci artici, vogliono vendicarsi di coloro che li avevano imprigionati, e cominciano ad uccidere tutti gli anziani, e anche Leo è in pericolo. Nel frattempo, Chris Perry, un misterioso angelo bianco che viene dal futuro, arriva alla villa per informare le sorelle che, se la storia non cambierà e gli anziani continueranno a morire, la magia buona nel futuro sarà completamente persa. Chris guida le Halliwell quando Leo decide, data l'emergenza, di dare alle sorelle i poteri delle dee greche per eliminare i Titani, nonostante il rischio che le sorelle vengano sedotte dagli smisurati poteri di cui adesso dispongono.

Diventate adesso delle potenti dee greche (Phoebe è la dea dell'amore, Piper la dea della Terra e Paige la dea della guerra), le sorelle devono cercare di non venire sedotte dai loro nuovi poteri e di dedicarsi ad eliminare i Titani prima che uccidano tutti gli anziani. Nel frattempo Leo deve decidere se diventare un anziano o rimanere con Piper ed il piccolo Wyatt. La rabbia consuma Piper, permettendo alle sorelle Halliwell di distruggere i Titani.