En el primer aniversario de las chicas como brujas, las hermanas Halliwell se enfrentan a un demonio del plano astral llamado Abraxas, que consigue robar el Libro de las Sombras. Abraxas resucita a algunos de los demonios que las Embrujadas habían vencido ya. Prue, que todavía está afectada por la muerte de Andy, se dedica por completo a su trabajo en la casa de subastas. Piper intenta conseguir fondos para poder abrir su propio club.

Después de que Phoebe tenga una premonición de ella misma siendo quemada viva, las Embrujadas lanzan un hechizo, con el que viajan al futuro, para averiguar lo que sucede. Una vez allí descubren que sus poderes han aumentado, y que Phoebe usó la magia para matar a un hombre. Piper descubre que en el futuro está casada con Leo y que tienen una hija, Melinda Wyatt-Halliwell.

Prue encuentra una inscripción extraña en un cuadro que está tasando en Bucklands, y se ve atrapada en su interior, cuando repite una frase escrita en el cuadro. Allí se encuentra a un brujo que lleva encerrado 70 años. Phoebe hace un hechizo para aumentar su inteligencia, para conseguir un trabajo de programadora informática. Piper se siente atraída por su nuevo vecino, Dan.

Los negocios en el nuevo club de Piper no van bien. Leo atrae al representante del grupo Dishwalla, que ha hecho un pacto con el demonio Masselin, al P3 para que las Embrujadas lo destruyan. Darryl investiga la desaparición de algunas chicas en los conciertos de Dishwalla, y sospecha que podrían desaparecer más en el concierto del P3.

Mientras una ola de calor acecha a San Francisco, Phoebe comienza a tener exóticos sueños que terminan con el asesinato de los amantes de sus sueños. Luego de que Morris le pida ayuda a Prue para resolver el asesinato de cuatro hombres, Phoebe teme que ella sea un Súcubo, siendo ella quien asesina a los hombres. Prue sugiere invocar el hechizo para atraer y destruir mediante llamas de fuego al Súcubo y tener el poder de Piper preparado en el caso de que realmente Phoebe sea la culpable. Afortunadamente para Phoebe, no sucedió aquello, pero desafortunadamente para Prue, el hechizo la convierte en un hombre. Además, Piper contrata a The Cranberries para tocar en P3.

Tuatha, una bruja asesina de brujas buenas, es liberada por accidente de la cueva en la que ha estado encerrada doscientos años. Leo le explica a las Halliwell que el único que la puede vencer es El Elegido, un chico llamado Kyle, que es el único capaz de usar la varita de Tuatha en su contra. Mientras, Piper tiene que decidir entre Leo y Dan.

Las Halliwell ayudan a Eric un joven que ha conseguido descubrir el lugar exacto donde se encuentran los Manuscritos Aksha, la fuente de conocimiento más poderosa del mundo. Eric es perseguido por unos brujos llamados Recolectores, que tienen la capacidad de absorber el conocimiento de las personas.

Las Embrujadas deben destruir al demonio de agua que mató a su madre. Cuando llegan al campamento donde murió su madre, descubren una parte de la vida de ésta que no conocían. Leo y Piper descubren que ellos no fueron la primera bruja y Luz Blanca en enamorarse...

Las hermanas Halliwell se ven sorprendidas en su casa por una mujer que intenta asesinarlas. Prue, en defensa propia, usa su poder y mata a Ms. Hellfire, una asesina a sueldo, que tenía como objetivo matar a las Embrujadas. Prue se hace pasar por la señorita Hellfire, y se acaba enamorando de Bane, el asesino que contrató a la verdadera señorita Hellfire. Morris descubre el secreto de las Halliwell y Prue desarrolla un nuevo poder: la proyección astral.

Drasi, el demonio del odio, roba a Cupido el anillo con el que entra en los corazones de las personas, con el propósito de romper todas las parejas que había unido, para destruirlo. Cupido llega hasta las Embrujadas y les pide ayuda para derrotar a Drazi. Phoebe se enamora de Cupido, y descubre por qué tiene problemas en sus relaciones con los hombres.

Phoebe llega a casa con un bebé, después de haber tenido una premonición en la que el bebé y su padre eran atacados por un fantasma. Después descubren que ese fantasma está matando a todos los hombres de una familia de la que el bebé es el último que queda.

Cuando Piper se enferma, Prue y Phoebe invocan un hechizo para curarla, ignorando la regla de no usar sus poderes para obtener beneficio personal. Como resultado, las hermanas esparcen (sin saberlo) el virus mortal a otras personas y deben deshacer el hechizo que salvó a Piper, para volver las cosas a la normalidad, incluso si ello atentara contra la vida de Piper. Mientras tanto, la vida de cada una de las Halliwell cambia al comenzar Phoebe la universidad, Prue renunciar a su empleo y Piper descubrir que Leo ha vuelto para luchar por su amor.

Un trío de estudiantes universitarias buscando hombres en el día de San Valentín, acuden a la magia para transformar a tres animales en hombres, con cierta ayuda indirecta de Phoebe. Como los ex-animales deciden permanecer humanos, se dirigen hacia las chicas y comienzan a buscar a Phoebe para, a través de su magia, evitar volver a convertirse en animales. La relación de Piper con Dan se complica cuando ella decide darle a Leo una tarjeta de San Valentín. Mientras, Prue intenta pasar un día sin hacer nada ahora que no trabaja.

Una de las vidas pasadas de Phoebe vuelve para eliminarla, y ella descubre que en 1924 su vida pasada fue seducida por un hechicero llamado Anton en un intento de robar los poderes de sus primas (las vidas pasadas de Prue y Piper). Phoebe pronto descubre que la muerte de su vida pasada la llevará a su muerte en el presente, a menos que pueda prevenirlo, mientras Anton continúa en su intento para robar sus poderes. Piper descubre que en su vida pasada Leo era un antiguo amante suyo y Dan era su esposo.

Un demonio conocido como Litvack ordena a sus subordinados matar a Bane Jessup, a quien Prue ayudó para ponerlo entre rejas cuando Bane intentó matar a las Encantadas. Bane consigue escapar y secuestra a Prue, con la esperanza de que sus poderes lo protejan. Prue se niega a ayudarlo al principio, pero luego comienza a crecer en ella la atracción hacia Bane. Mientras, viendo la dificultad de Piper en elegir entre Leo y Dan, Phoebe realiza un pequeño hechizo para ayudar a Piper a encontrar su verdadero amor.

Prue empieza a trabajar como fotógrafa para la revista 415 y como primer trabajo tiene que fotografiar a Magie Murphy, una mujer a la que la suerte le ha dado la espalda. Prue salva a Magie cuando ésta intentaba suicidarse. Pero cuando Prue hace un hechizo para cambiar la suerte de Magie, es maldecida por una Sombra, lo que hace que caiga en una profunda depresión, que le puede costar la vida. Leo recupera sus poderes Piper y el vuelven definitivamente.

La tía de las Halliwell pide ayuda a las hermanas cuando algunos cadáveres aparecen en su pueblo. Pero la verdadera intención de la tía Gail es robar los poderes de las Encantadas para recuperar su juventud, en manos del demonio Cryto. Cuando las hermanas descubren que sus poderes han sido robados por ellos, Piper ve esta situación como una forma de recuperar una vida normal -sin brujería- y vacila en intentar recuperar sus poderes perdidos.

Las Embrujadas son atacadas por el Demonio de la Ilusión, que tiene el poder de traer a los personajes de las películas al mundo real. De esa manera Phoebe puede conocer a su amor platónico, Billy, el protagonista de la película "Mátalo antes de que muera". Las Halliwell se ven forzadas a luchar contra los psicópatas de la gran pantalla.

Phoebe no encuentra tiempo suficiente para estudiar para los exámenes finales de la Universidad. Una compañera de clase de Phoebe, que estaba a punto de demostrar la existencia de los demonios, es asesinada misteriosamente. Las Halliwell deben encontrar al responsable del asesinato, un demonio llamado Libris, que asesina a cualquiera que encuentre pruebas de la existencia de demonios. Dan descubre que Leo está casado y se lo cuenta a Piper. Prue ayuda a un hombre a que se haga justicia con el asesinato de su hija.

Las Embrujadas tienen que enfrentarse a cuatro demonios desconocidos, que en realidad son los Cuatro Jinetes del Apocalipsis. El hechizo que usan para desvanecerlos sale mal, y Prue junto con uno de ellos es absorbida por un vórtice. En ese momento Piper y Phoebe no tienen más remedio que trabajar junto a los tres jinetes restantes. Si quieren recuperar a Prue, deben decidir se liberan a Prue y al 4º jinete, lo que destruiría el mundo, o dejar morir a su hermana para que el mundo siga.

Las hermanas han enfurecido tan seguido al Parlamento del Infierno, que quieren darle una lección a las Halliwell. Esto involucra a un genio que es enviado para concederle un deseo a cada una. Sin embargo, las hermanas ignoran las oscuras intenciones que oculta esta acción.