Een machtige heks wordt gedood door demon Aimes die als speciale kracht heeft dat hij zichzelf kan klonen. Ontzet door de gebeurtenis duikt Leo’s collega Nathalie plots op bij de Halliwells. Ze vraagt Leo om haar te helpen, maar trapt met haar autoritaire houding op de tenen van de zussen. De Halliwells willen bewijzen dat ze volgens hun eigen, intuïtieve methode de demon kunnen uitschakelen, en trekken ondanks Nathalies tegenwerpingen op eigen houtje ten strijde. Hun acties hebben echter niet het verhoopte resultaat. Phoebe bekent ondertussen aan Leo dat ze Balthazor niet heeft kunnen doden, maar hij reageert niet zoals ze verwacht had.

De vader van Phoebe, Prue en Piper wil een dorp opkopen. Maar volgens de geruchten zouden er geesten ronddwalen. Daarom neemt hij Phoebe mee naar de plek. Phoebe ziet er inderdaad geesten en ziet hoe een indiaan wordt afgeranseld. Wanneer ze even later terug naar huis keren, krijgt Phoebe allerlei lichamelijke letsels, letsels die de indiaan ook heeft opgelopen. Prue probeert Phoebe te redden en keert terug naar het verleden om de indiaan en zo ook Phoebe van de dood te redden.

Terwijl Phoebe Paige probeert in te wijden in de magie van ‘Het Boek Der Schaduwen’, heeft Piper nog steeds de grootste moeite om het verlies van Prue te verwerken. Ze richt haar woede dan ook op het Kwade en spendeert haar tijd enkel aan het elimineren van gevaarlijke demonen. Er is geen haar op haar hoofd dat eraan denkt om Paige ook maar een beetje in haar leven te sluiten. Wanneer ze door het Kwade bezeten wordt na een gevecht met de Furies, is het hek pas goed van de dam.

Piper en Phoebe hebben Paige’s hulp nodig om een boze geest uit hun huis te verdrijven. De magie die ze nodig hebben, werkt immers enkel als de drie zussen hun bovenaardse krachten bundelen en ze vragen Paige om bij hen in te trekken. Paige weigert, maar komt al snel tot de vaststelling dat ze haar zussen ook zelf permanent nodig heeft. Een tovenares uit de middeleeuwen is immers naar de toekomst gereisd om Paige naar het leven te staan.

‘The Source’ breekt een contract tussen goed en kwaad en heeft daardoor voldoende krachten om de Halliwell-zussen te verslaan. Hij steelt Piper en Paige hun magie en verwondt Leo. Phoebe heeft een visioen waarin Cole door ‘The source’ vermoord wordt en ze wil haar verloofde bijgevolg niet bij de situatie betrekken. Cole belandt echter in de andere wereld en ‘The Seer’ doet hem vervolgens een voorstel om ‘The Source’ uit te schakelen.

Een jongen bezit de gave om zijn tekeningen tot leven te brengen en een boosaardige demon wil dat hij het leven schenkt aan een gevaarlijke stripfiguur die een tovenaar moet doden. Wanneer de demon gevaarlijk wordt, besluit de jongen om drie vrouwelijke stripfiguren te tekenen die Piper, Phoebe en Paige in superhelden veranderen. Zij moeten zowel de jongen als de tovenaar tegen de demon beschermen.

Nadat Paige, Phoebe en Piper afrekenen met een Manticore-demon, ontdekken ze dat de duistere geest een baby achterlaat, die half mens, half demon is. Chris dringt er bij de zussen op aan het kind te doen verdwijnen maar hun moedergevoel steekt hier een stokje voor. De baby is immers nog te klein om een gevaar te vormen. Ze zijn er bovendien van overtuigd dat de kwaadaardigheid van de jongen bepaald wordt door zijn opvoeding. Ondertussen begeeft Phoebe zich op glad ijs, wanneer ze plots de diepste gevoelens van Jason verklapt.

Phoebe en Jason zijn al vijftien maanden een koppel. Paige vindt dat de tijd is aangebroken om de vriend van haar zus de waarheid te vertellen over hun magische krachten. Phoebe twijfelt echter: zij vindt het nog veel te vroeg. Wanneer Jason hun magie per toeval ontdekt, voelt hij zich verraden en wil hij niks meer te maken hebben met zijn vriendin en haar hekserij. Ondertussen spreekt Richard een spreuk uit die hem moet verlossen van het slechte karma van zijn voorouders. Er gaat echter iets mis, waardoor de geest van Mata Hari, een dubbelagente en stripteaseuse uit de Eerste Wereldoorlog, zich nestelt in het lichaam van Phoebe. Daarnaast hebben Paige en Piper alle moeite van de wereld om komaf te maken met de Swarm Demons, de laatste belangrijke demongroepering op het lijstje van Chris.

Wanneer de magieschool geteisterd wordt door een gevaarlijke, donkere ruiter zonder hoofd, roept Leo’s oude leraar Gideon de hulp in van de Haliwell-zusjes. De geest heeft het gemunt op de hoofden van de leerkrachten, die het probleem zelf niet de baas kunnen. Terwijl Piper en Paige onderzoeken welke leerling verantwoordelijk is voor het oproepen van de ruiter, wordt Phoebe door een jonge sjamaan aangespoord om een persoonlijke, spirituele ontdekkingstocht te maken. Tijdens dit visioen wordt ze geconfronteerd met haar grootste angsten en doet ze een verrassende ontdekking over de ware identiteit van Chris.

Agent Brody overtuigt Paige hem te helpen bij een reeks vreemde ongevallen. Telkens gaat het om mensen die het ene moment een ongeluk overleven, maar even later toch op een onfortuinlijke manier om het leven komen. Samen ontdekken ze dat dit het werk is van de demon Sarpedon, die de engelbewaarders van onschuldige slachtoffers steelt. Zo hoopt hij zichzelf te beschermen tegen een mysterieuze, nieuwe bedreiging. Piper en Phoebe hebben hun handen vol met Leo : ze helpen hem de confrontatie aan te gaan met zijn diepste angsten. Tijdens deze onderbewuste, spirituele zoektocht wordt hij begeleid door zijn zoon Chris, die hem de waarde van zijn bestaan onthult.