Az Egyesült Államok nagyvárosaiban hetek óta terrorcselekményeket hajtanak végre feltehetően arab öngyilkos merénylők. A titkosszolgálat információi szerint Hamri Al Assad áll a háttérben. A Terrorelhárítás szerint egy bizonyos Fayed nevű férfi kiadná Assad tartózkodási helyét, ha cserébe megkapja Jack Bauert, hogy megölhesse, és bosszút álljon fivére halála miatt. Wayne Palmer elnök elintézi, hogy Kína visszaszállítsa Jacket, aki közel két éve egy kínai börtönben raboskodik. Jacket átadják Fayednek. Mielőtt megölné, Fayed elárulja neki, hogy nem Assad áll a merényletek hátterében, sőt, Assad azért érkezett az Egyesült Államokba, hogy megállítsa a terrorcselekményeket.

Miután Jacknek sikerül megszöknie, Jack megpróbálja megakadályozni a célzott légicsapást Assad ellen, de senki nem hallgat rá. A kihallgatott koordináták alapján egymaga rátalál Assad tartózkodási helyére, és kimenekíti a férfit. Assad beleegyezik, hogy segít Jacknek felkutatni Fayedet. Jack megakadályozza, hogy Fayed egyik embere öngyilkos merényletet hajtson végre a metrószerelvényen. Ahmed megöli Stant, amikor a férfi rátámad, de súlyos sérüléseket szerez a dulakodásban. Wayne húga, Sandra, megpróbálja megakadályozni, hogy az FBI ügynökei megsértsék az Iszlám-Amerikai Szövetség munkatársainak szabadságjogait.

Jack szándékosan karambolozik Fayed emberével, a helyszínre érkező Assad felajánlja a terroristának, hogy elviszi a kocsijával, ahová kívánja. Így próbálnak eljutni Fayed rejtekhelyére. A sérült Ahmed túszul ejti Ray családját, és azt követeli a férfitól, hogy szerezzen meg neki egy bizonyos csomagot. Az FBI nyomozását hátráltató Sandrát letartóztatják muszlim barátjával, Waliddal együtt. Jacknek feltűnik, hogy Curtis ellenségesen bánik Assaddal, és megbízza Chloet, nézzen utána, van-e közös múltjuk.

Ray megszerzi a csomagot, de Ahmed csak a feleségét hajlandó szabadon engedni, míg a férfi le nem szállítja Fayednek a szerkezetet. Az ideiglenes fogolytáborban Walid hallani véli, hogy az arab fogvatartottak a terrorcselekmények részleteiről beszélnek. Wayne teljes büntetlenséget biztosít Assadnak, amennyiben nyilvánosan békekötésre hívja fel a világ iszlám szervezeteit. Curtis megpróbál végezni Assaddal, így Jack kénytelen lelőni őt.

Amikor a terroristák felrobbantották az atombombát Los Angeles külvárosában, Fayed mérnöke is meghalt, így a többi bomba detonátorának átprogramozására újabb szakembert kell keresnie. Sandrának nem tetszik, hogy az FBI bepoloskázza Walidot, és arra használják, hogy lebuktassa a feltehetően terrorista kapcsolatokkal rendelkező fogvatartottakat. Jack megdöbben, amikor kiderül, hogy apja cégének köze lehet a terroristákhoz.

Jack felkeresi öccsét, Graemet, és kiszedi belőle, hogy egyik alkalmazottjuk játszotta a terroristák kezére az atombombákat, majd kényszeríti őt, hogy vigye el McCarthy irodájába. Lennox, akit már régóta zavar, hogy Karen nem hajlandó támogatni a javaslatait, el akarja mozdítani a helyéről. Karent lemondásra kényszerítik. Walid kémkedése balul sül el, lebukik és a fogva tartottak kis híján agyonverik. Közel-keleti származása miatt Nadia hatáskörét korlátozzák, ami jelentősen lassítja a munkáját.

Jack számára világossá válik, hogy öccse nyakig benne van az aznapi történésekben. Wayne kormányülést hív össze, hogy megtárgyalják Lennox javaslatait, melyek jelentősen korlátoznák az állampolgári szabadságjogokat. Morris rossz hírt kap a testvéréről, ezért azonnal elindul hozzá, de későn derül ki, hogy mindez pusztán csel volt, hogy kicsalják a Terrorelhárítás épületéből. McCarthy elrabolja, hogy elvigye Fayedhez, Morris ugyanis képes átprogramozni az atombombákat.

Fayed elmenekül Jack kommandójának rajtaütése előtt, és magával viszi azt a berendezést is, amellyel bármikor élesítheti a táska-atombombákat. Mindeközben az elnöki stábból többen arra készülnek, hogy az alelnöknek játsszák át a hatalmat. Jacket bűntudat gyötri megkínzott testvére halála miatt, mivel ekkor még nem is sejti, hogy Graham halála nem az ő, hanem az apja lelkén szárad. Ezalatt Jack apja tovább dolgozik azon, hogy eltüntesse a nyomokat, amelyek őt a terrorakciókat a háttérből szervező orosz Gredenkóval kötnék össze. A mindenre elszánt férfi még arra is képes, hogy saját unokája és menye életét is kockára tegye.

Miután Jack rájön, hogy Marilyn félrevezette, éktelen haragra gerjed, a nő pedig bevallja, hogy Philip a fia életével zsarolja. Jack Marilyn segítségével próbál apja nyomára bukkanni. Morrist nagyon megviseli a tény, hogy engedett az erőszaknak, és segített a terroristáknak működőképessé tenni a további atombombákat. A nagy nyomás alatt már-már újra az alkoholhoz nyúl. Milo eközben taktikai bevetésen megsérül. Lennox nehéz döntés elé kényszerül.

Lennox hiába is próbál szabadulni, nem tudja megakadályozni, hogy Reed és társa merényletet kövessenek el az elnök ellen, miközben éppen Assaddal készül beszédet mondani. Jack találkozik Loan egykori elnökkel, aki arról számol be neki, hogy az orosz konzulátuson van valaki, aki Gredenko nyomára vezethet. Chloe továbbra is falaz Morrisnak, de Nadia egyre gyanakvóbb.

A súlyos sérüléseket szenvedett Palmer elnököt mesterséges kómában tartják. Daniels alelnök veszi át az elnöki jogkört, és első lépésként biztonsági szigorításokat vezet be. Lennox megnevezi a merényletért felelős személyeket, de Daniels elnöknek jobban tetszik az a verzió, miszerint Assad helyezett el bombát a teremben. A merénylet hírére Karen visszatér, hogy továbbra is nemzetbiztonsági tanácsadóként segítse a kabinet munkáját. Jack és Logan ellátogatnak az orosz konzulátusra.

Miközben Jack az orosz konzulátuson bujkál az őrök elől, Buchanan Mike Doyle ügynököt küldi oda, hogy kimenekítse Jacket, és elfogja Markovot. Logan elnök felkeresi volt feleségét, Marthát, hogy segítsen elsimítani a diplomáciai incidenst, melyet a konzulátus megtámadása jelent. Gredenko egy újabb célpontot szemel ki, Daniels alelnök pedig nukleáris csapással fenyeget egy arab országot.

Gredenko és Fayed egy robotrepülőt indítanak útnak az egyik bombával. A terrorelhárításnál úgy tűnik, tégla van az ügynökök között, a terroristák ugyanis minden ellenlépésükről értesülnek. Mindenki lázasan próbál a robotrepülő nyomára bukkanni. Nadiát árulással vádolják. Karen és Lennox megdöbbenve látják, hogy az alelnök atomtámadásra készül.

Karen ráveszi Sandrát, hogy adjon engedély Wayne felébresztésére. Noha az orvosok nem javasolják, a kétségbeejtő helyzetre való tekintettel Sandra megengedi, hogy bátyját felébresszék a kómából. Doyle bizonyítékot talál arra, hogy Nadia ártatlan, csak valaki a tudta nélkül feltörte a rendszerét. Jack eljut két testvérhez, akik feltehetően elvezethetik Gredenkóhoz.

A mesterséges kómából felébresztett Wayne igyekszik erősnek mutatni magát, ezért nagy mennyiségű adrenalin injekciót adat be magának, noha az orvosa figyelmezteti, hogy életveszélyes lehet számára. Wayne mindenáron meg akarja akadályozni, hogy Daniels alelnök atomháborút robbantson ki. Jack kényszeríti Gredenkót, hogy találkozót beszéljen meg Fayeddel. Gredenko karjába jeladót ültetnek be, hogy ne tűnhessen el...

Wayne egy trükkel rávesz egy arab országot az együttműködésre. Jacknek sikerül elfognia Fayedet, de hiába vallatja, nem tudja megtörni. Doyle-lal kifőznek egy tervet, melynek során közel-keleti származású ügynökök úgy tesznek, mintha kiszabadítanák Fayedet. A terrorista azonban gyanút fog?

Cheng, a kínai kormány ügynöke cserét ajánl Jacknek. A bombák vezérlő egységét kéri cserébe Audrey életéért. A vezérlő egység algoritmusa azonban hozzáférést adna Kínának a teljes orosz védelmi rendszerhez, ezért kevés a valószínűsége annak, hogy a terrorelhárítás segítségére számíthasson. Doyle rajtakapja Jacket, amint ki akarja szerelni az egységet, és őrizetbe veszi.

Jack magától Palmer elnöktől kér engedélyt arra, hogy végrehajthassa a kínaiak által ajánlott cserét. Az elnök állapota rosszra fordul, újra kómába esik, így Daniels alelnök kerül ismét a székébe, aki határozottan megtiltja a cserét. Tom Lennox, az elnök tanácsadója egy olyan személyzeti döntés meghozatalában vesz részt, ami alaposan felkavarja a kedélyeket.

Nadia, a Terrorelhárítás ideiglenesen megbízott vezetője olyan vallatási technikát engedélyez, ami veszélybe sodorhatja Audrey életét. Doyle nem helyesli a döntést, ezért segít Jacknek megszökni. Daniels alelnök rájön, hogy tégla van a Fehér Házban, mert az orosz elnök szinte minden történésről tudomást szerez.

Lisa Miller felhívja barátját, az oroszoknak kémkedő Mark Bishopot, miközben Tom Lennox és Noah Daniels alelnök kihallgatják a beszélgetést. Úgy tervezik, a találkozás alkalmával Lisa őrizetlenül hagyja majd a zsebszámítógépét, amelyen hamis adatokat helyeztek el, így akarják csapdába csalni Bishopot. Cheng emberei behatolnak a csatornahálózatba, ahonnan támadást készülnek végrehajtani a terrorelhárítás épülete ellen.

Cheng emberei a csatornarendszeren keresztül bejutnak a Terrorelhárításhoz, Jack egyszemélyes küzdelmet folytat a túszok kiszabadításáért. Sikerül Cheng nyomára bukkannia, aki át akarja adni Josht a nagyapjának, hogy az magával vigye Kínába. Miközben Jack Josh életét próbálja megmenteni, Chengnek sikerül elmenekülnie. Daniels alelnök azt hazudja Szuvarov elnöknek, hogy megszerezték a vezérlő egységet.

Jack apja cserét ajánl: az unokáját kéri a vezérlő egységért cserébe. Jacket kijátszva Doyle elviszi a fiút az átadás helyszínére. Karen a karrierjét kockáztatja, amikor megkéri Billt, hogy segítsen Jacknek megszökni. Jack és Buchanan későn érnek az átadás helyszínére. Doyle súlyosan megsérül, Josht pedig elviszik Phillip emberei.

A Terrorelhárítás Jack apjának nyomára bukkan egy olajfúrótornyon. Ahelyett azonban, hogy kommandós egységet küldenének a helyszínre, hogy megmentsék Josh-t és biztonságba helyezzék a vezérlőegységet, Daniels alelnök azonnali légitámadást rendel el a fúrótorony ellen. Jack és Bill elindulnak kiszabadítani Josh-t.