Le territoire américain est assigié depuis 11 jours par de nombreuses attaques qui ont causé plus 900 morts dans 10 villes différentes. Une nouvelle bombe fait 23 victimes de plus à Los Angeles. Les mililtants islamiques apparaissent comme les premiers suspects, avec en tête un certain Hamri Al-Assad. Wayne Palmer, qui a prêté serment à la Maison Blanche 3 mois auparavant, a négocié à prix fort la libération de Jack Bauer avec le gouvernement chinois. Le Président compte utiliser l'ex-agent de la CAT comme monnaie d'échange contre des informations permettant de localiser le terroriste soupçonné d'être derrière tous ces massacres. De retour au pays après 20 mois de détention, Bauer doit être remis entre les mains d'Abu Fayed. Ce dernier, déterminé à venger la mort de son frère, veut plus que tout voir Jack mort...

A partir des infos fournies par Fayed, la CAT déploie ses forces armées vers leur cible. Entretemps, Jack est parvenu à échapper à Fayed. Il contacte la CAT pour les prévenir qu'ils vont s'en prendre à la mauvaise personne. Guère convaincu, et étant donné la situation de crise, le Président Palmer donne l'autorisation d'éliminer Al-Assad... Ahmed Amar est chargé par Fayed lui-même d'une importante livraison... Sandra, la soeur du Président Palmer, défend ses principes et les droits de son organisation lorsque des agents du FBI viennent réclamer les dossier du personnel. Elle refuse qu'une sorte de profiling ethnique soit effectué...

Fayed contacte le Président Palmer. Il exige la libération de 110 combattants de son pays dans l'heure qui suit en contre-partie d'un cessez-le-feu. Wayne ne croit pas aux bonnes intentions du terroriste mais il est décidé à accéder à sa demande pour gagner du temps... Bauer convainc Hamri Al-Assad qu'ils doivent collaborer avec la CAT pour retrouver la trace de Fayed... Sandra Palmer et Walid sont emmenés dans un camp de détention provisoire où sont retenus d'éventuels suspects...

Avec l'aide d'un complice au sein de la Garde Nationale, Hasan Numair parvient à s'échapper. Spécialiste de l'armement, celui-ci est une pièce maîtresse du plan de Fayed. Le terroriste est en possession d'une arme nucléaire qui, si elle explose en ville, pourrait faire des milliers de morts...

Une bombe nucléaire explose à Valencia, à la périphérie de Los Angeles, faisant des dégâts sur une zone de 1 km². Le pays est en alerte, d'autant plus que la CAT a découvert l'existence de 4 autres bombes. Fayed est furieux car la bombe n'a pas atteint la cible prévue. Et son scientifique est mort sur place. Il lui faut quelqu'un d'urgence avec les détonateurs adéquats pour activer les autres bombes...

Profitant de la démission de Karen Hayes, Tom Lennox tente de convaincre le Président d'accepter son plan destiné à restreindre les libertés civiques afin de multiplier les chances de mettre fin aux agissements de Sayed... Jack est en pleine tragédie familiale. Sa responsabilité dans les événements du jour ayant été découverte, Graham donne l'ordre à ses hommes de se débarrasser de son frère et de son père... McCarthy trouve un profil compétent susceptible d'armer les bombes restantes de Fayed. Reste à convaincre cette personne de coopérer...

Morris tombe dans le piège tendu par McCarthy. Celui-ci compte bien le mener à Fayed qui a besoin de lui pour activer les autres bombes. Avec les moyens de la CAT, Jack tente de retrouver le mari de Chloé... Tom a du mal à encaisser que le Président ait rejeté toutes ses propositions sur les mesures à prendre...

Fayed est parvenu une fois de plus à échapper à la CAT de justesse. Il est désormais en possession, grâce à la collaboration forcée de Morris, d'un dispositif lui permettant de re-programmer les bombes restantes... De son côté, la CAT suit une nouvelle piste. Milo a découvert un lien entre Fayed et Gredenko, un ex-général russe... Le Président Palmer n'adhère pas du tout aux méthodes extrêmes de son équipe. Il préfère pousser Al-Assad à demander le soutien de la popularition musulmane via la télévision...

Jack échappe de justesse au piège qui lui était tendu. La maison indiquée par Marilyn était remplie d'explosifs. Il essaie de retrouver Marilyn et Milo, qui sont poursuivis par les hommes de Phillip Bauer... Tom Lennox fournit à Reed Pollock l'itinéraire du Président pour que soit mis en place son assassinat. Une fois Palmer éliminé, le vice-Président prendra le relais et des mesures radicales pourront être mises en place pour sortir le pays de la crise... Rongé par la culpabilité, Morris a du mal à tenir le coup...

L'ex-général russe Gredenko rassemble les pièces de son plan : il coopère avec Fayed afin de prendre sa revanche sur les Américains tout en rejetant la faute sur les extrêmistes islamistes... Jack suit une nouvelle piste qui pourrait l'amener à Gredenko. L'ex-Président Charles Logan, actuellement en résidence surveillée, prétend avoir les moyens de localiser Gredenko... Chloé prend des risques en couvrant Morris. Mais est-ce vraiment une bonne idée ?...

A la suite d'un attentat à la bombe, le Président Palmer est entre les mains des médecins. Son état enfin stabilisé, Wayne Palmer est toujours inconscient. Le Vice-Président Daniels, partisan d'une action plus agressive contre le terrorisme, est chargé de le remplacer aussitôt. L'absence de Tom Lennox commence sérieusement à inquiéter tout le monde. Reed tente de persuader Lennox de se rallier à leur cause... Jack Bauer conduit Charles Logan jusqu'au consul russe Markov. L'ex-Président est persuadé que celui-ci sait où se trouve Gredenko, l'homme qui a vendu les bombes à Fayed...

Jack Bauer est retenu captif au consulat russe. La CAT organise aussitôt un plan d'assaut pour libérer Jack et vérifier si le consul Markov est bel et bien lié à Gredenko. L'agent Mike Doyle prend la direction des opérations sur le terrain... Charles Logan conduit à la CAT propose de faire appel à Martha pour les aider... Le Vice-Président Daniels compte sur le soutien de Tom Lennox...

L'équipe de Doyle libère Jack du consulat russe. Alerté par l'arrivée imminente des américains, Gredenko presse Fayed de lancer un seul drone sur les trois prévus, pour leur laisser le temps de fuir. La CAT a redirigé les satellites pour suivre le parcours du missile mais ils perdent mystérieusement le contact visuel avec l'engin. Une arme nuclaire survole le sol américain et personne ne peut la localiser. Remonté, le Vice-Président Daniels réunit l'Etat-major pour préparer une contre-attaque militaire...

Jack est parvenu à éviter que le drone atteigne sa cible. Lors de son atterrissage dans une zone industrielle, le choc a provoqué une fuite radioactive qui a contaminée les membre de l'équipe de secours. Une raison suffisante pour le Vice-président Daniels pour ordonner une attaque nucléaire contre le pays de Fayed... La CAT suit une nouvelle piste à l'aide d'une communication interceptée entre Gredenko et un certain Mark Hauser... Doyle détient la preuve que Nadia n'y était pour rien sur la fuite opérée à partir de son poste de travail. Ce rebondissement pourrait bien lui coûter des ennuis. Va-t-il garder le secret sur cette nouvelle information ?

Sorti du coma, Wayne Palmer annule la frappe nucléaire contre le pays de Fayed ordonnée par son Vice-Président. Daniels invoque aussitôt le 25ème amendement, prétextant que le Président n'est pas en état de diriger le pays. Les membres du Cabinet doivent se réunir et statuer sur cet état de fait... Gredenko négocie la livraison de Fayed contre son immunité...

Pendant que Jack tente de faire parler Fayed, Tom et Karen apprennent, décontenancés, que le Président Palmer a autorisé une attaque nucléaire. Ils ne comprennent pas son comportement et tentent par tous les moyens d'empêcher que le missile atteigne sa cible. En vain. Alerté de l'attaque imminente, l'ambassadeur prévient Palmer qu'ils ont une nouvelle piste : le général Mohmar Habib qui aurait aidé Fayed à coordonner les attaques...

Les chinois utilisent Audrey Raines comme monnaie d'échange. Ils font pression sur Bauer pour qu'il leur fournisse un composant de la bombe nucléaire qui contient tous les codes de défenses russes. Si les russes apprennent que les américains ont fourni de telles infos à la Chine, les répercussions seront très graves. Mais Jack n'a pas le choix... En dépit de son état de santé fragile, le Président Palmer lance un ultimatum à Daniels...

Sur ordre de Noah Daniels, la CAT doit empêcher Jack de remettre les informations sur les russes aux chinois. Celui-ci parvient à se débarrasser de Doyle. Il ne veut pas prendre le risque de faire capoter l'opération : les russes pourraient alors s'en prendre à Audrey ! De son côté, Karen Hayes se retrouve dans une position délicate...

A cause de l'intervention de Doyle et de ses hommes, les Chinois parviennent à s'enfuir avec la technologie russe. Jack, menotté, et Audrey, sous le choc, sont conduits à la CAT où Nadia a pris la direction des opérations... Le Vice-Président Daniels est contacté par le Président Suvarov...

Grâce à l'information communiquée par Audrey, la CAT s'apprête à intervenir dans une usine désacfectée qui pourraient bien abriter le quartier général des chinois. Pendant ce temps, les Chinois se préparent pour un assaut... A la Maison Blanche, Tom et Noah utilisent Lisa pour dérouter les russes...

Les hommes de Cheng ont attaqué la CAT pour kidnapper Josh Bauer, leur monnaie d'échange contre le dispositif réparé que leur fournira Phillip Bauer. Le personnel de la CAT est retenu en otage. Jack se prépare à intervenir rapidement pour pouvoir suivre les traces de Josh avant qu'il ne soit trop tard... Lisa Miller a pour mission de duper Mark Bishop, l'espion russe. Mais son comportement pourrait bien susciter des soupçons chez son amant...

Mis au pied du mur par l'ultimatum du Président russe, Daniels donne l'ordre à la CAT de monter une opération afin d'échanger Josh Bauer contre le dispositif. Placé en détention provisoire, Jack a les mains liés. Il sait que l'échange aura lieu pour rien, son père ne donnera pas le dispositif, qui reste un précieux moyen de pression. Il fait appel à Karen pour prendre les mesures nécessaires...

Grièvement blessé au visage, Doyle est tombé dans le piège tendu par Phillip Bauer. Arrivé trop tard sur le lieu de l'échange, Jack pense que son père se cache sur l'une de ses plates-formes pétrolières. Un sous-marin chinois est d'ailleurs en route pour récupérer Phillip et son petit-fils. Les russes, de leur côté, se préparent à ouvrir le feu sur une base militaire américaine en Asie du Sud-Est. Sur les conseils de son Secrétaire à la Défense, Daniels ordonne une attaque aérienne pour s'assurer de la destruction du dispositif avant qu'il ne leur échappe totalement. Mais Jack, refusant que son neveu soit sacrifié, est décidé à intervenir coûte que coûte...