Mientras Jack lidia con un problema personal secreto, terroristas narcotraficantes amenazan con soltar un virulento virus de peste a menos que su líder sea liberado de la prisión.

Jack descubre la relación entre Kim y Chase mientras investiga los contactos con traficantes de drogas de Goss. Wayne descubre un secreto sobre Anne.

Jack encuentra en la bolsa de Kyle una sustancia blanca sospechosa. Palmer descubre más sobre las alegaciones que incriminan a Anne. Chase se enoja porque Jack no lo tuvo en cuenta en la persecución de Kyle.

Cuando la CTU le pierde el rastro a Kyle, Palmer piensa que la alternativa es ceder ante las demandas de los terroristas o sufrir una catastrófica epidemia viral, pero Jack propone una arriesgada tercera posibilidad.

Durante el recreo de la prisión, Jack y Salazar son tomados como rehenes por otros prisioneros; la CTU localiza a Kyle; Kim y Chloe se enteran de que Jack consume drogas.

Después de capturar a Kyle, los agentes de la CTU intentan evitar que Jack se escape con Ramón Salazar.

Mientras Jack trata de impedir que Ramón lo mate durante su viaje a México, los agentes de la CTU se enteran de que Gael ha estado trabajando para los Salazar y Chase sale a buscar a Jack.

Tony explica que junto con Gael estuvo ayudando a Jack a volver a infiltrarse en la organización de los Salazar y Jack trata de concertar una reunión entre los Salazar y la gente que vende el virus.

Jack y los Salazar se enteran de que tienen un rival en la subasta del virus; los hombres de Salazar torturan a Chase; el contribuidor más importante de la campaña de Palmer le ordena despedir a Wayne; Kim y Michelle se dan cuenta de que Tony no está apto para trabajar.

Jack sigue a Nina cuando ella se va a encontrar con Amador; Claudia ayuda a Chase a escapar de sus torturadores; Wayne le pide a Julia Milliken que lo ayude a impedir que el esposo de ella lleve a cabo su vendetta contra Palmer.

Mientras Nina recibe la entrega del virus por parte de Amador, la CTU se desplaza para interceptar la operación; Sherry no tiene éxito en su primer intento de chantajear a Milliken y Kim se entera de que el bebé de Chloe no es de ella.

Mientras Jack lleva a Nina de vuelta a Los Ángeles en avión, ella libera un virus informático que había colocado en la Unidad Antiterrorista y Sherry encara a Milliken acerca de su participación en el asesinato perpetrado con un automóvil en el cual el conductor se dio a la fuga.

Jack lleva a Nina a la Unidad Antiterrorista, en donde Tony la interroga; Jack es interrogado a su vez por asuntos internos; Kim encara a Chase acerca de su bebé y Sherry trata de ocultar su participación en la muerte de Milliken cuando se descubre que éste está muerto.

Finalmente, Jack atrapa a Michael Amador pero después de que Marcus Alvers se escapó con el virus y se dispone a liberarlo en un hotel importante; la policía se entera de que Sherry estaba en la mansión de Milliken cuando éste murió.

Jack deja escapar a Amador para poder seguirlo; el virus es liberado en el hotel y la gente entra en pánico; Palmer debe decidir si mentir o no para proteger a Sherry.

Jack se entera de que el hombre que liberó el virus es un ex colega de él; Saunders comienza a reclamar al presidente Palmer; Michelle y Tony comienzan a aceptar el destino de los que resultaron infectados en el hotel.

Mientras Jack se prepara para cumplir la orden de Saunders y matar a Chappelle, Chase y una brigada de ataque llegan juntos al apartamento de Saunders y Michelle se entera de que un hombre expuesto al virus se escapó del hotel.

Kim se ofrece como voluntaria para hacer de doble de la hija de Saunders; los agentes de la Unidad Antiterrorista encuentran al hombre infectado que había escapado del hotel; Palmer recibe la próxima demanda de Saunders.

Cuando los agentes de la Unidad Antiterrorista usan a la hija de Saunders para determinar su ubicación, Saunders los utiliza a ellos para planificar su huida. A Michelle le da negativo el análisis para determinar si estaba afectada por el virus, pero después de que a la hermana de Adam el mismo análisis le da positivo, Chloe trata de convencer a Tony de que Adam no puede realizar bien su trabajo.

Mientras Jack trata de determinar cómo hizo Saunders para escapar, Tony planea en secreto el intercambio de Jane Saunders por Michelle y Sherry Palmer le ofrece un trato al adversario de campaña de Palmer.

Mientras Jack localiza a Tony y Jane Saunders, Michelle se escapa del padre de Jane y el senador Keeler enfrenta a Palmer con la prueba de que éste mintió a la policía.

Después de que Saunders da la ubicación de diez de los once recipientes que contienen el virus, Jack sale en busca del último frasco, que está en el subterráneo de Los Ángeles y Sherry pesca in fraganti a Wayne y Foxton forzando la entrada de su casa.

Mientras Jack persigue al hombre que lleva el último frasco con el virus, Wayne le cuenta a Palmer lo que le pasó a Sherry y a Tony lo acusan de traición.