דרמת מתח זוכת פרסי האמי וגלובוס הזהב בכיכובו של קיפר סאת'רלנד המגלם את ג'ק באוור, סוכן ביחידה ללוחמה בטרור. כל פרק מתאר שעה אחת במהלך יממה בחייו של באוור בעודו מנסה לעצור את איומי הטרור על מולדתו.

ביחידה ללוחמה בטרור חוקרים איום להתנקשות בחייו של דיוויד פאלמר, המועמד האפרו-אמריקאי לנשיאות ארה"ב. בינתיים, המתח גובר לאחר שהחיפושים אחר קים וחברתה שברחו מהבית נמשכים...

קים וג'נט מצליחות לברוח מהחוטפים שלהם ומבקשות עזרה מנער חסר בית. ג'ק מגלה שהכרטיס שמכיל מידע על ההתנקשות בפאלמר נצרב במחשב של נינה. כתבת טלוויזיה מאיימת על פאלמר בחשיפת פרטים מפלילים על בנו קית.

ג'ורג' מייסון משבית את הפעילות בלוט"ר, וג'ק נאלץ למצוא דרך יצירתית כדי לעקוב אחרי קצה חוט אפשרי בזמן שנינה וג'יימי מחפות עליו בהיעדרו. פאלמר מגלה איך נודע לכתב על מה שקרה לבנו, ובמקביל ג'ק מגלה שבתו קים וחברתה נחטפו.

ג'ק נוקט בפעולה דרסטית כדי לזכות בשיתוף פעולה עם האדם היחיד שיכול לעזור לו להציל את קימברלי, אך נתקל במייסון שמסכן את תכניתו. בינתיים, פאלמר מחליט להיפגש עם הכתבת שרוצה לחשוף פרטים על בנו.

ג'ק מגיע לבית החולים כדי לדבר עם טרי ופוגש את אלן יורק, אביה של טרי, ומבקש לשוחח איתה כשתתעורר. במקביל, גיינס יוצר קשר עם ג'ק, כדי ליידע אותו שקימברלי בידיו, ופאלמר מחליט לפרסם בעצמו פרטים שקשורים לרצח האנס של ניקול.

גיינס מכריח את ג'ק להחליף את כרטיס המפתח שמנסים לפענח בלוט"ר בכרטיס אחר, בעוד נינה מנסה לעצור אותו ומסתבכת. בינתיים, טרי מנסה להתרחק מאלן יורק כשהיא מגלה מיהו באמת.

גיינס פוקד על ג'ק ללכת לתחנת הכוח בה פאלמר אמור לנאום. נינה מנסה להתקשר לג'יימי וכשהיא לא משיגה אותה, היא מתקשרת לטוני שעוזר לה. ג'ק מצליח להסיט את תשומת הלב של סוכן השירות החשאי כך שיגנו על פאלמר.

ג'ק מובא למעצר על ידי השירות החשאי, ומצליח להימלט ומנסה לדלות מידע נוסף מכרטיס המפתח. בינתיים, נינה וטוני מנסים לחקור את ג'יימי, ולפאלמר נודע שג'ק באוור הוא הסוכן שחשוד בהתנקשות בחייו.

אלברטה גרין, המנהלת החדשה של לוט"ר, מוציאה הודעה שג'ק נחשב לפושע נמלט ומאיימת על נינה שתגלה את מיקומו. האנשים שהזמינו את ההתנקשות בפאלמר מתקשרים לגיינס ומאיימים עליו שאם לא יצליח לחסל את פאלמר הם יהרגו אותו.

פאלמר מנסה לחבר את חלקי הפאזל כדי להבין מדוע הסוכן באוור רוצה במותו. בינתיים, דרייזן דוחק בגיינס להרוג את טרי ואת קים.

דיוויד פאלמר מנסה להזהיר את ד"ר פרגאמו שנשקפת לו סכנה, אך הוא מסרב להקשיב לו. אלברטה גרין משעה את נינה, וטוני ומאיימת עליהם בפיטורים והעמדה לדין. ג'ק מצליח לחדור למכלאה של גיינס ולהגיע לטרי וקים.

ג'ק משחק עם גיינס משחק קטלני של חתול ועכבר שתוצאותיו מובילים לעימות אחרון ביניהם. בינתיים, גרין מורה לנינה וטוני לחקור את אמה של ג'יימי, ופאלמר מתעקש לדבר עם התובע המחוזי ולספר לו הכל על קית.

ג'ק ופאלמר נפגשים סוף סוף פנים מול פנים ומבינים מדוע עוקבים אחריהם. השניים מחליטים לשתף פעולה כדי לעצור את אלו שרוצים לנקום בהם, וג'ק מוחזר לתפקידו באופן זמני למרות רוחו של ריאן שאפל.

אחרי ששלח תמונות של שלושת המתנקשים לסנטור פאלמר, ג'ק ומייסון מגלים כי בין אליזבת לאלקסיס יש רומן. בינתיים, אנשיו של דרייזן מצליחים לאתר את טרי ואת קים, למרות שהן שוהות בבית בטוח.

ג'ק משתמש באליזבת כפיתיון בכדי לתפוס את אלקסיס. בינתיים, טרי סובלת מאובדן זיכרון, ומנסה לאתר מקומות מוכרים. ג'ק מגלה שנינה יצאה מהבית הבטוח מוקדם מדי ושטרי יודעת על הרומן ביניהם?

ג'ק מתחזה לאלקסיס והולך לפגוש איש קשר שעשוי לתת לו מידע חיוני, אבל סוכן שנוטר לג'ק טינה עלול לסכן את הצלחת המשימה. בינתיים, טרי, נלקחת חזרה אל ביתה.

ג'ק ומייסון מחליטים לבדוק כתובת שפאלמר מצא בתיק האבוד על דרייזן, ומגיעים למקום שומם שרשום כשמורת טבע. פאלמר מתוודה על הכל במסיבת עיתונאים, והאיש שנשכר לחסל את טרי מגיע לביתה ומאיים עליה.

מייסון מחליט לחזור ללוט"ר ולתחקר את אלקסיס, וג'ק ממשיך לחפש רמזים באזור ומוצא כלא ממשלתי שמור שבו מוחזק אסיר סודי במיוחד. קים נלקחת למעצר, ונחקרת ע"י המשטרה.

פאלמר מקבל בשורה משמחת בנוגע לבחירות המקדימות. ויקטור דרייזן ובנו מצליחים להשתלט על מתקן הכליאה ותופסים את ג'ק כבן ערובה. קים מצליחה לשכנע את חוקרי המשטרה שהיא דוברת אמת אך מוצאת את עצמה בתסבוכת נוספת.

ויקטור מחזיק בג'ק ורוצה להרוג אותו, אך ג'ק מרוויח זמן בכך שהוא אומר לדרייזן שהוא יודע את מיקומו של אלקסיס. אנדרה מתקשר ללוט"ר ומבקש לבצע עסקת חליפין: הוא יקבל לידיו את אלקסיס ובתמורה ישחרר את ג'ק.

ג'ק מקבל הוראה מוויקטור למסור לידו של פאלמר טלפון נייד. ג'ק מנצל את ההזדמנות ומפיץ שמועה שהסנטור מת, אך נינה מודאגת שיש "חפרפרת" בתוך היחידה.

בפרק סיום העונה, קים מצליחה לחמוק מידיהם של הדרייזנים, אך נינה מספרת לג'ק שקים מתה, וגורמת לו לרדוף אחריהם כדי לנקום את מותה. בינתיים, הסוכנים בלוט"ר ממהרים לגלות מי החפרפרת השנייה, אך האם יהיה זה מאוחר מדי?