Kim und Teri werden im Krankenhaus untersucht während Jack verhört wird. Er bitte deshalb Nina die beiden im Krankenhaus zu beschützen. Währenddessen begeben sich Gaines' Männer in einen abgelegenen Schuppen, wo eine Überraschung auf sie wartet. Inzwischen erfährt Palmer, dass Jack für den Anschlag verantwortlich sein soll und will ihn dazu persöhnlich sprechen.

Jack kann Palmer davon überzeugen, dass er nicht hinter dem Mordversuch gegen ihn am Vormittag steckt, der daraufhin die "Operation Nightfall" detailliert prüfen lässt. Das Ziel der Operation war die Ermordung von Victor Drazen, bei der seine Frau und seine Tochter umkamen. Kim und Teri verstecken sich mit Nina weiterhin in einem "Safe Room". Teri erfährt dort, dass sie schwanger ist - und mehr über Nina's Rolle in Jack's früheren Leben!

Präsident David Palmer nutzt eine Auszeit um mit seinem Sohn einen Angelausflug zu machen, als das Vorhaben unterbrochen wird durch einen Anruf des Geheimdiensts. Die Terror-Organisation „Second Wave“ plant einen nuklearen Anschlag auf LA. Palmer fordert Jack Bauer an, der jedoch noch um den Tod seiner Frau trauert. Jacks Tochter Kim macht erste Erfahrungen mit dem Berufsleben als AuPair–Mädchen.

Während einer Pressekonferenz versucht Palmer das Misstrauen der Reporter zu besänftigen. Nur Reporter Ron Wieland bleibt hartnäckig, weshalb Palmer ihm einen Deal anbietet. Über seine alten Undercover-Beziehungen versucht Jack derweil an Joseph Wald heranzukommen. Kim findet unterdessen Besorgniserregendes über Greg Matheson heraus.

Um Sie aus der Stadt zu bekommen erzählt Jack Kim von der Atombombe, doch diese möchte ohne Megan nicht gehen. Sie bittet einen Freund um Hilfe. Palmer trifft sich mit einem Botschafter und dabei kommt es zu einem. Unterdessen fährt Tony zum Haus der Warners, denn Reza könnte wichtige Informationen liefern und Mason möchte Jack aus der CTU-Zentrale verbannen, weil Nina Myers zum Verhör vorgeführt wird.

Kim, Miguel und Megan versuchen aus LA zu entkommen und Tony versucht Infos aus Reza herauszubekommen. Dabei offenbart sie einen Zusammenhang zu Bob Warner. Jack erfährt von Masons Kontamination und kann mit ihm einen Deal aushandeln um an Nina heranzukommen. Palmer bekommt überraschenden Besuch von seiner Ex-Frau Sherry, die immer noch in Regierungskreisen gut vernetzt ist. Sie bietet David an, ihm zu helfen.

Kim's Retter Lonnie hat sich aus dem Großstadtleben zurückgezogen und lebt allein im Wald. Roger Stanton bricht endlich sein Schweigen. Er habe von allem gewusst, aber nichts unternommen, um Palmers Abwehrpolitik zu beeinflussen, die er als zu lasch empfand. Eine Kommandoeinheit soll die Bombe im letzten Moment entschärfen. Diese ist aber bereits fort und auch die Ermittlung der Flugzeugnummer des verdächtigen Flugzeuges führt in eine Sackgasse.

Palmer's Vertrauen in Sherry wird endgültig ruiniert als er von Stanton erfährt, dass auch Sherry von dem Plan wusste. George Mason geht es inzwischen so schlecht, dass er freiwillig Tony die Führung der CTU übergibt. Kim irrt in den Wäldern um LA herum und Jack kann Marie Warner fassen. Während des Verhörs kann er ihr den aktuellen Standort der Bombe entlocken.

Der Leiter des Supermarktes wird erschossen und der Eindringling bedroht auch Kim. Jack will mit Kate das CTU-Gebäude verlassen, doch Tony versucht vergeblich das verhindern. Carrie verdächtigt Michelle, woraufhin Tony Michelle überwachen lässt. Auf dem Weg zu dem Unbekannten werden Jack und Kate von Yusef Auda verfolgt, der ihnen aber seine Unterstützung anbietet. Der Unbekannte stellt sich als Jonathan Wallace vor, der Vermisste des Kommandos, dem die Atombombe gestohlen wurde.

Kim wird von der Polizei verhört. Nur der provozierte Unfall und die Fahrerflucht können ihr noch zum Verhängnis werden. Sie solle die CTU anrufen. Weil die Terroristen arabischer Abstammung seien, versucht Palmer mit Hilfe der Homeland Security, Vergeltung an der islamischen US-Bevölkerung zu verhindern. Jack, Wallace und Kate suchen ein Lagerhaus auf, nachdem sie versuchen zu Flüchten, wird Wallace angeschossen. Jack versucht ihn noch zu retten, aber es ist zu spät.

Kate holt die verstörte Kim ab und bringt sie zur CTU. Jack kann Alex einholen und muss ihn ins Bein schießen um ihn zu stoppen. Chapelle stoppt den Hubschrauber und lässt Tony verhaften. Dadurch kommt für Alex jede Hilfe zu spät. Es gibt nun keine Beweise mehr die Sherry Palmer belasten. Jack will, dass sie deshalb nun Peter Kingsley in eine Falle lockt.

Neue Informationen lassen Mike Novick misstrauisch werden, weshalb er Jack doch wieder unterstützen will. Chapelle kann Jack jedoch nur über Tony und Michelle erreichen und muss daher seine Anklagen fallen lassen. Jack berichtet der CTU von seinem Plan, will aber nicht auf die Unterstützung warten müssen. Sherry und Jack ziehen das zu zweit durch. Sherry entlockt Kingsley ein Geständnis doch dieser wird misstrauisch und bedroht Sherry's Leben.

Drei Jahre sind seit der Gift-Attacke auf Präsident Palmer vergangen. Jack Bauer arbeitet wieder für die CTU, und auch seine Tochter Kim ist dort inzwischen als Computer-Spezialistin tätig. Chef der Abteilung ist Tony Almeida. Sie alle werden vor eine neue große Herausforderung gestellt, als Terroristen, die im Besitz eines tödlichen Virus sind, die Freilassung des Drogenbarons Ramon Salazar fordern. Sollte sich die Regierung weigern, drohen die Terroristen damit, das Virus in Los Angeles freizusetzen, von wo aus sich die Seuche in Windeseile über alle Erdteile ausbreiten würde...

Zwischen Jack und seinem neuen Partner Chase kommt es zu Problemen, nachdem Jack erfahren hat, dass seine Tochter seit einer Weile mit Chase liiert ist. Zudem macht Jack seine offensichtliche Drogenabhängigkeit zu schaffen. Trotzdem finden er und Chase eine Spur, die zu Kyle Singer und dem Ort führt, wo das Virus aufbewahrt wird. Präsident David Palmer ist wieder in L.A., um seine Wiederwahl vorzubereiten. Sein Bruder Wayne ist sein neuer Stabschef und fürchtet, dass Davids neue Freundin Anne seine Chancen auf die Wiederwahl verschlechtern würde.

Jacks Versuch, Ramon zur Flucht aus dem Gefängnis zu verhelfen, löst eine Gefängnisrevolte aus. Sie werden beide von den Gefangenen als Geiseln genommen. Chase erhält die Befehlsgewalt und versucht Jack und Ramon zu befreien. Während Kim versucht, Kyle ausfindig zu machen, sucht der verzweifelt nach einem Weg, wenigstens Linda zu retten. Als Chloe in Michelles Auftrag Jacks Büro durchsucht, um eine Erklärung für Jacks Verhalten zu finden, entdeckt sie, dass er ein Drogenproblem hat. Sie informiert auch Kim und Michelle darüber. Gleichzeitig beginnt die Präsidentschaftsdebatte zwischen Palmer und Keeler.

Jack und Ramon sind weiter auf der Flucht, während Palmer die Präsidentschaftsdebatte wegen des Vorfalls unterbricht und Chapelle das Kommando bei der CTU übernimmt. Chapelle fragt den Präsidenten, ob er Jacks Hubschrauber abschießen lassen soll, aber bevor er eine Antwort erhält, erreichen Jack und Ramon das Stadtgebiet, was einen Abschuss zu riskant macht. Kyles Eltern erfahren, dass ihr Sohn nur noch wenige Stunden zu leben hat, und Kim findet heraus, dass Gael die ganze Zeit mit Salazar in Kontakt stand. Trotzdem kann sie nicht mehr verhindern, dass ihr Vater in die Gewalt der Salazars gerät.

Jack befindet sich weiterhin in der Gewalt von Nina – lässt aber natürlich nichts unversucht, dieser zu entfliehen. Derweil kommt es wiederholt zu mehr oder weniger schweren Streits zwischen den Salazars. Palmer beauftragt derweil seine Ex-Frau Sherry, sich der Milliken-Angelegenheit anzunehmen.

Die Übergabe in Mexiko steht kurz bevor. Nachdem Hector erschossen wurde, leitet Ramon Salazar nun die Geschäfte und schickt Nina zu Amador, um die Übergabe durchzuführen. In L.A. gräbt Sherry derweil eine von Millikens Leichen aus.

Die CTU findet heraus, dass Saunders eine Tochter hat. Für das Doubeln findet sich jedoch nur eine Person, was Jack ganz und gar nicht gefällt… Der Präsident entschließt sich derweil, das Kabinett zu informieren, was in den letzten Stunden geschehen ist. Auch die Leute dort sind alles andere als begeistert, diese Dinge zu hören.

Die CTU kann herausfinden, wo sich Saunders aufhält und macht sich auf den Weg. Derweil beruft Palmer eine erneute Pressekonferenz ein und Michelle bekommt ihr Testergebnis.

Saunders ist endlich bereit zu kooperieren, doch weiterhin bleibt einer der Virus-Sprengsätze verschwunden. Derweil bricht Wayne in das Haus von Sherry ein, um nach den Beweisen zu suchen.

Jack und Chase sind weiterhin auf der Suche nach dem letzten Kurier. Derweil muss Wayne dem Präsidenten eine traurige Nachricht überbringen. In der CTU kommt Gaels Witwe an und ist entsetzt, als sie den Terroristen Saunders in die Augen blickt.

Es sind drei Monate nach Tag 3 vergangen. Jack wird in das Büro der jetzigen Cheffin der CTU gerufen. Sie teilt ihm mit, dass er nicht mehr tragbar für die Regierung ist und mit sofortiger Wirkung entlassen ist.

Gegen 7:00 Uhr entgleist an der Westküste ein Pendlerzug - alles deutet auf einen terroristischen Anschlag hin. Jack Bauer ist in seiner neuen Funktion als Vertreter des US-Verteidigungsministeriums gerade auf dem Weg zu einem Meeting mit dem CTU. Dort angekommen wird er sofort in die Arbeit der Einheit verwickelt, denn ein zweiter Anschlag durch türkische Topterroristen soll unmittelbar bevorstehen...

Jack Bauer wird provisorisch wieder als CTU-Agent aktiviert, um Andrew Paige in Sicherheit zu bringen. Verteidigungsminister James Heller und seine Tochter Audrey werden währenddessen vom Terroristen Omar und dessen Helfern in einer alten Lagerhalle gefangen gehalten.

Kalil erkennt, dass er verfolgt wird, und beendet durch einen spektakulären Unfall sein Leben, um die CTU nicht zu Omar zu führen. Verteidigungsminister Heller und seine Tochter versuchen sich unterdessen das Leben zu nehmen, um dem terroristischen Schauprozess, den Omar plant, zu entgehen.

Jack Bauer schafft es in letzter Minute, den Verteidigungsminister und Audrey aus den Händen der Terroristen zu befreien. Audreys Ehemann Paul kommt nach L.A., um seine Frau zurückzuerobern. Derweil erteilt Navi Araz einem Killer namens Tariq den Auftrag, seinen Sohn Behrooz zu töten.

Die CTU steht kurz davor, das Kontrollgerät zu finden, doch noch immer stellen sich die beiden einzigen Zeugen, Paul Raines und Dina Araz, quer. Jack bzw. Tony müssen bei ihren Verhörmethoden auf andere Mittel zurückgreifen.

Jack und Paul machen sich auf den Weg zu Marwans Arbeitsplatz, um seinen Computer nach Dateien zu durchsuchen. Derweil versucht Heller Driscoll davon zu überzeugen, nach dem Tod ihrer Tochter lieber nach Hause zu gehen.

Nachdem Air Force One abgestürzt ist, gibt es einige offene Fragen: Lebt der Präsident? Und Wo ist Marwan? – die wichtigste ist aber wohl: Wo ist der nukleare Football – jenes Gerät, mit dem der Präsident die Kontrolle über das Atomarsenal der USA hat.

Logan wurde zum Präsidenten vereidigt und hat immer mehr Schwierigkeiten, wichtige und vor allem richtige Entscheidungen zu treffen. Die CTU hat einen Mann gefangen nehmen können, der möglicherweise Marwan kennt und weiß, wo sich dieser aufhält, doch ein Verhör ist nicht so einfach wie Anfangs gedacht. Marwan hat sich derweil einen Atombombe beschaffen können.

Tony wurde von Mandy gefangen genommen – doch noch weiß niemand, wer die Terroristin ist – und vor allem, was bereits alles auf ihr Konto geht. In Washington gibt es immer mehr Konflikte mit den Chinesen. Agent Bern soll nun aus LA ausgeflogen werden, um ein wasserdichtes Alibi zu erhalten.

Mandy redet endlich und sagt, wo sich Marwan befindet. Noch immer ist der Ort, an dem die Rakete einschlagen soll, unbekannt. Die Chinesen fordern nun die Auslieferung von Jack, doch der Sicherheitsberater von Logan hat eine „bessere“ Idee.

Zwölf Monate nach den Ereignissen von Tag 4 trifft Jack auf einem verlassenen Firmengelände auf Chloe. Sie berichtet Jack, dass sich ein Hacker zugriff auf seinen Autopsiebericht verschafft hat.

Als Jack zu seinem Auto zurückkehrt bemerkt er das er beobachtet wird.Schafft er es unerkannt zu entkommen ?

18 Monate sind seit den Ereignissen von Tag 4 vergangen. Mit Ausnahme von David Palmer, Tony Almeida, Michelle Dessler und Chloe O'Brian glaubt die Welt, dass Jack Bauer tot ist. Jack lebt in der Nähe von LA unter dem Namen Frank Flynn, arbeitet auf einer Bohrinsel und lebt mit Diane Huxley und ihrem Sohn Derek zusammen. In LA besucht David Palmer seinen Bruder Wayne, als er von einer Kugel eines Attentäters getötet wird. Während sich die CTU bemüht, mehr Informationen zu sammeln, tötet eine explodierende Autobombe Michelle und verletzt Tony. Chloe wird ebenfalls von einer unbekannten Gestalt verfolgt, aber sie entzieht sich ihm und schafft es, Jack um Hilfe zu bitten.

Jack ist zurück, doch nun ist er derjenige, der von der CTU verdächtigt wird David Palmer ermodet zu haben. Nicht nur die Suche nach dem wahren Mörder, sondern auch der Beweis seiner eigenen Unschuld stehen nun an erster Stelle für ihn und Chloe.

Walt Cummings hat den Auftrag gegeben, dass Jack Bauer ermordet werden soll. Dafür wird er in die CTU-Hauptzentrale gebracht. Den Terroristen ist derweil die Flucht vom Flughafen gelungen. Das Nervengas konnten sie ebenfalls in ihren Besitz bringen und damit planen sie nun einen Anschlag auf Moskau.

Bevor sie sich noch einmal unterhalten konnten, werden Jack und Novick verhaftet. Doch Jack schafft es den leitenden Secret-Service-Agenten davon zu überzegen, dass Walt Cummings in den Nervengasdiebstahl verwickelt ist. Somit kann er mit dem Präsidenten reden und droht Cummings Folter an, wenn er nicht gesteht.

Jack, der Hendersons Falle entkommen konnte, will nun in dessen Haus Beweise sichern. Dabei greift er zu drastischen Mitteln, um an Computer-Passwort von Henderson zu kommen. Währenddessen ist es den Terroristen gelungen an eine CTU-Keycard zu gelangen.

Einer der Terroristen schafft es in die CTU-Zentrale einzudringen und kann so einen Nervengasbehälter im Lüftungssystem installieren. Jack entdeckt ihn und kann ihn töten, doch es ist schon zu spät für eine Evakuierung.

Collette Stenger nennt Audrey als ihre Kontaktperson. Jack glaubt ihr nicht, nimmt Audrey jedoch in Gewahrsam und verhört sie. Bierko und seine Männer treffen in einer Verteilerzentrale für Erdgas ein. Das Nervengas soll über die Leitungen zu den Haushalten geführt werden.

Karen Hayes und ihre Mitarbeiter übernehmen die CTU. Wayne kontaktiert Jack. Martha Logans Assistentin hat Beweise, die Davids wahren Mörder belasten. Ihre Tochter wird jedoch von Hendersons Leuten festgehalten. Jack vermutet, dass der Vizepräsident an den Ereignissen beteiligt ist.

Jack, Henderson und das TAC Team fahren zu Natalia um Bierko aufzuhalten. Es kommt zur entscheidenden Konfrontation zwischen Jack und Henderson. Jack beschließt, sich alleine um Logan zu kümmern und bittet Mike Novick um Hilfe.

Jack bringt Logan in eine verlassene Lagerhalle. Er fordert ihn auf, ein Geständnis abzulegen. Doch nicht nur Logan wird mit seinen Taten konfrontiert. Auch Jack wird von seiner Vergangenheit eingeholt.

Ein neuer US-Präsident hat über Jacks Freilassung aus einem chinesischen Gefängnis verhandelt, damit Jack eine Reihe von Terroranschlägen stoppen kann ... mit seinem Leben.

Können Jack und ein unwahrscheinlicher Verbündeter einen Selbstmordattentäter stoppen und den Architekten dieser Terrorakte verfolgen?

Probleme mit der Familie: Jack mit seinem Bruder und Vater, während Morris sich Sorgen um seinen eigenen Bruder macht.

Der Präsident trifft sich mit einem bekannten Terroristen, während Jack nach Morris sucht, Fayed einen Abzug sucht und Tom Lennox eine Wahl trifft.

Bei der Suche nach Gredenko wird Jack im russischen Konsulat gejagt und ein ehemaliger Präsident ruft seine Ex-Frau an.

Das Satellitenortungssystem der CTU wird kompromittiert, während eine bewaffnete Drohne auf eine unbekannte Stadt zusteuert. Unterdessen bereiten sich die US-Streitkräfte auf eine nukleare Vergeltung im Nahen Osten vor.

Während sich die USA auf den Amtsantritt der ersten Präsidentin Allison Taylor vorbereiten, ist Ex-Agent Jack Bauer vor den Sünden der Vergangenheit und einem drohenden Untersuchungsausschuss in Afrika abgetaucht. Als er seinen einstigen Mentor Carl Benton trifft, wird er in einen diffizilen Konflikt verstrickt: Im Staat Sengala will sich der grausame Warlord Colonel Benjamin Juma an die Macht putschen - und rekrutiert für seine Armee sogar Kinder. Bauer will eingreifen, doch ihm läuft die Zeit davon.

Jack Bauer verteidigt sich gerade vor Gericht, als er plötzlich vom FBI um Hilfe gebeten wird. Er soll einen alten Arbeitskollegen ausfindig machen, der in Zusammenhang mit Terroristen gebracht wird.

Präsidentin Allison Taylor muss sich mit den Eskalationen zu den Unruhen in Sangala auseinander setzen während Jack Bauer bei den Untersuchungen bezüglich Tony Almeida hilft.

Matobo weigert sich immer noch aus seinem Versteck zu kommen, weswegen Jack die Sache selbst in die Hand nimmt. Entgegen Larrys Wunsch, macht sich Renee im Alleingang auf den Weg zu Matobo und Henry Taylor kommt Roger's Mörder immer näher.

Das Team um Jack ist aktuell dabei, die Übergabe vorzubereiten, doch Emerson macht Probleme. Dubaku hat das Warten langsam satt und will seinen Forderungen Nachdruck verleihen. Präsidentin Taylor bleibt unterdessen bei ihrer Meinung.

Während Larry seine Untersuchungen intensiviert, um Jack zu fassen, versuchen Jack und Tony in den Besitz der Waffe zu gelangen. Im Weißen Haus kommt es derweil zu einer Entscheidung, welche Allison Taylor schwer zu schaffen macht.

Jack arrangiert sich mit der neuen Situation, die auch Renee sehr beschäftigt. Larry versucht unterdessen, die biologischen Waffen zu finden, stößt dabei auf einige Probleme.

Damit Kim nichts geschieht muss hat Jack keine Wahl und muss den Befehlen von Cara folge leisten. Olivia wird unterdessen im Weißen Haus mit Ethan Kanin bekannt gemacht, worüber sie weiter beunruhigt ist.

Tony gibt alles, damit sein Plan den lang ersehnten Abschluss findet während Renee nach Jack sucht. Olivia wird unterdessen von Ethan zur Rede gestellt. Sie soll ihrer Mutter die Wahrheit sagen und sie damit vor eine sehr schwere Entscheidung stellen.

Präsident James Heller ist in Großbritannien zu Besuch, um mit den Briten einen Vertrag zum Einsatz von Drohnen auszuhandeln. Derweil bekommt die CIA-Zentrale in London einen Tipp, dass auch Jack Bauer in London gesehen wurde. Jack's Festnahme war jedoch zu einfach. Kate Morgan glaubt deshalb, dass etwas nicht mit rechten Dingen vor sich geht.

Während die CIA versucht Jack zu fassen, ist dieser auf der Suche nach Derek Yates, der die Drohne ferngesteuert hatte. Unterdessen setzt sich Präsident Heller mit dem Premierminister der Briten auseinander, der über den Drohnenvorfall nicht sehr glücklich ist.

Nach Simones Unfall versuchen Jack und Kate im Krankenhaus Informationen über Margot aus ihr herauszubekommen. Derweil bekommt Navarro immer größere Schwierigkeiten mit Jordan um nach einer Lösung zu suchen.

Jack kann die Gründe des Präsidenten nachvollziehen, versucht aber dennoch Heller von seinem Plan abzubringen. Derweilen versucht Jordan seinem Angreifer zu entkommen und kämpft um sein Leben, während für Navarro die Situation immer heikler wird.

Jacks Erzfeind Cheng Zhi lebt und hat Chloe und das Override-System in seiner Gewalt gebracht. Als Jack versucht ihm zu folgen wird er von einem russischen Killer-Kommando aufgehalten, das von Stabchef Mark Boudreau auf seine Spur gebracht wurde.

Cheng Zhi hat einen teuflischen Plan: Mit dem Override-System will er einen chinesischen Flugzeugträger versenken und so einen Krieg zwischen den USA und China anzetteln. Einer von Chengs Scharfschützen hat Jacks große Liebe Audrey bereits im Visier. Doch muss Jack Cheng lebend fassen, um den Chinesen die Verschwörung zu beweisen und einen Weltkrieg zu verhindern.