Pragnący zostać samurajem Usagi udaje się do miasta Neo Edo, gdzie przypadkowo uwalnia złoczyńcę, który był więziony przez tysiąc lat.

Usagi i jego przyjaciele walczą z Kagehito — pająkopodobnym yōkai z wieloma rękami, nogami i oczami — a następnie muszą uratować pana Kogane przed atakiem.

Usagi, Kitsune, Chizu i Gen udają się do centrum kulturalnego, gdzie spotykają yōkai, który żyje wewnątrz porzuconych rzeczy i potrafi zmieniać swój kształt.

Gen zostaje poddany leczeniu w szpitalu, a Usagi i Kitsune trafiają w sam środek sporu między Mogurą a Bat Eskadrą.

Karasu Tengu zgadza się zostać senseiem Usagiego, jeśli schwyta on Troje Miejskich Yōkai. Pani Fuwa wprowadza w życie plan przejęcia władzy w Neo Edo, kradnąc kamień Ki.

Banda Neko Ninja atakuje świątynię, zmuszając Chizu do opowiedzenia się po jednej ze stron. Gen udaje się do dodatkowej pracy, a Usagi poszukuje drugiego yōkai.

Po tym, jak Usagi i Chizu szukają ostatniego Miejskiego Yōkai w Ukrytym Dōjō, Usagi zmienia zdanie. Kagehito jest coraz bliżej odnalezienia brakującego przedmiotu.

Usagi ponownie dołącza do drużyny, która walczy z panią Fuwa i jej ninja. Kagehito rozpoczyna brutalny atak, aby przymocować Clavis do Kamienia Ki.

Kamień Ki usiłuje zamknąć portal przed potencjalnymi najeźdźcami z kosmosu, ale brakuje mu ważnego elementu. Czy Usagi i jego drużyna znajdą go na czas?