A raíz del asesinato de Bruce Wayne, su hijo adoptivo es incriminado por matar a Caped Crusader, junto con los hijos de algunos de los enemigos de Batman.

En un intento por limpiar sus nombres, Turner, Duela, Cullen, Harper y Carrie regresan a la escena del crimen en busca de los diarios de Bruce Wayne. Mientras tanto, mientras Harvey profundiza en la investigación, comienza a preguntarse si Turner es inocente después de todo. Por último, Stephanie es interrogada después de que el GCPD sospechara que podría estar ayudando a Turner.

Después de que Carrie derriba a su líder, Mutant Gang toma represalias contra Gotham tomando rehenes en la Gala anual del Fundador, lo que obliga a Turner, Duela y Harper a salir de su escondite para salvar a la gente de Gotham. En otra parte, Cullen se infiltra en el GCPD después de que el equipo descubriera una posible conexión entre la Corte de los Búhos y la muerte de otro miembro de la familia Wayne. Por último, Harvey toma una gran decisión sobre su futuro.

Después de descubrir algunas pistas potenciales en su investigación, Turner y Harper investigan una posible conexión entre la muerte de Bruce Wayne y la misteriosa muerte de un abogado. Mientras tanto, Carrie y Duela se dirigen a un hogar de ancianos para interrogar a Eunice. En Belfry, Stephanie se sincera con Cullen sobre su vida en casa, mientras que Harvey hace un descubrimiento inquietante.

Un plan para acabar con la Corte de los Búhos lleva a Turner y al equipo a una notoria familia de mafiosos, los McKillen. Mientras tanto, Carrie y Stephanie se preparan para el almuerzo de padres de la Gotham Academy y Harvey busca la ayuda de un psiquiatra.

Cuando Joe Chill está a punto de ser ejecutado por el asesinato de los padres de Bruce Wayne, recurre a Harvey para hacerle una última petición: hablar con Turner. Mientras tanto, Stephanie busca la ayuda de su padre, Arthur Brown, cuando tiene problemas para descifrar un código, y Carrie se ve obligada a ayudar en el hospital después de que su vida secreta de vigilancia la lleve a problemas con su madre.

Tras una serie de robos de arte en Gotham, Turner y los Caballeros centran su atención en una posible conexión con la Corte de los Búhos. Mientras tanto, Duela y Carrie buscan respuestas sobre La Garra de Eunice, y Rebecca recurre a Harvey en busca de ayuda después de temer que su vida esté en peligro.

Una serie de pistas crípticas llevan a Turner y Duela a una de las reuniones secretas de La Corte de los Búhos. Mientras tanto, Stephanie se entera de que la adicción de su madre es peor de lo que pensaba y recurre a su padre Arthur en busca de ayuda. Finalmente, un lapso en el tiempo lleva a Harvey a un sorprendente descubrimiento.

Después de que uno de los suyos sea capturado por la Corte de los Búhos, los Caballeros se encuentran en una carrera contrarreloj. Stephanie y Harper trabajan juntas para localizar una pieza de material crucial que podría salvar a un miembro de su equipo. En otra parte, Harvey toma medidas para protegerse, solo para que se confirme su peor temor.

En la reunión de cumpleaños de Duela con su madre, Jane Doe, descubre información impactante que la cambiará irrevocablemente. Mientras tanto, Stephanie se ve obligada a elegir entre su familia y los Caballeros, lo que la pone en desacuerdo con Harper. Finalmente, Harvey se encuentra en curso de colisión con alguien de su pasado.

El equipo entra en acción tras descubrir la existencia de pruebas que podrían limpiar sus nombres. Harvey sigue una pista que podría ayudarlo a reconstruir lo que sucedió la noche en que Bruce Wayne fue asesinado. Después de reunirse con su madre, Duela comienza a tener dudas.

Enfrentados a su rescate más peligroso hasta el momento, los Caballeros de Gotham se dan cuenta de que confiar los unos en los otros puede ser la única forma de salvarse a sí mismos y a Gotham. Mientras tanto, Harvey se enfrenta a una decisión imposible que podría tener consecuencias devastadoras.