Nils nappaa haltijan, joka tarjoaa pojalle kultakolikkoa vapaudestaan. Tämä ei kuitenkaan ole pahanilkiselle Nilsille tarpeeksi. Haltija hermostuu ja muuttaa Nilsin peukalon mittaiseksi.

Sana Nilsin kutistumisesta kiirii farmilla nopeasti ja pojan kaltoinkohteluun kyllästyneet eläimet päättävät maksaa potut pottuina. Pakotie aukenee yllättäen Martti-hanhen tempauksen myötä.

Martti-hanhi taistelee pysyäkseen villihanhien vauhdissa. Uupunut Martti säälittää jopa Nilsiä ja kaksikko saa yllättäen turvaa toisistaan. Koti-ikävä hiipii Nilsin mieleen...

Uudesta avuliaisuudestaan yllättyneenä Nils lähtee hamsterinsa kanssa pelastamaan häkkiin teljettyä oravaa. Vanha rouva näkee kuitenkin Nilsin häkin lukon kimpussa ja rientää kertomaan muille.

Nils lähtee hamsterinsa kanssa etsimään ruokaa, mutta päätyykin kahden pojan kaappaamaksi. Martti-hanhi rientää apuun, mutta päätyy itse poikien kynsiin, jotka haaveilevat hanhipaistista.

Villihanhet eivät vielä ole hyväksyneet Marttia osaksi parveaan, joten kömpelön Martin tulee suoriutua erinäisistä testeistä. Onnistuuko Martti uuden ystävänsä Nilsin avulla?

Myrskyisä sää pakottaa parven laskeutumaan. Nils lähtee hamstereineen jälleen ruoanhakumatkalle, joka päättyy katastrofiin.

Haltia ei usko Nilsin muuttuneen eikä suostu palauttamaan tätä normaalin kokoiseksi. Harmistunut Nils juoksee metsään, jossa hän oppii, että korjatakseen virheensä hänen on vain jatkettava yrittämistä.

Nils pääsee osallistumaan eläinten rauhan päivän juhlaan! Tunnelma onkin varsin iloinen, kunnes Smirre menettää malttinsa.

Villihanhet laskeutuvat yöksi kirkon kellotapulin katolle. Kun hanhet ovat nukahtaneet, Nils lähtee hamsterinsa kanssa tutkimaan kaupungin öisiä katuja.

Nils saa Akka Kebnekaiselta yövahdin tehtävän. Innokkaana Nils tarttuu toimeen, mutta huomaa pian olevansa aivan liian kokematon. Myös Smirre on liikkeellä.

Martilla on salaisuus, jonka Nils päättää selvittää. Nils löytää loukkaantunen hanhen ja yrittää auttaa tätä, mutta hanhi pyörtyy ja pelästynyt Nils luulee aiheuttaneensa tämän menehtymisen.

Akka Kebnekaiselaisen parvi joutuu huonon sään pakottamana laskeutumaan luolaan. He eivät kuitenkaan ole ainoita luolassa.

Nils suututtaa säiden hallitsijan ja kaikki joutuvat kärsimään tästä. Kaksi lasta joutuvat heikoille jäille ja Nils johdattaa lapset turvaan Martin avustuksella.

Nälkäinen kaksikko, Nils ja hamsteri, löytävät yöllisellä retkellään kirotun kaupungin.

Villihanhien lauma laskeutuu varisten maille. Varikset eivät ota vieraita suopeana vastaan. Smirre tekee sopimuksen varisten kanssa.

Varisten johtaja käy entistä ahneemmaksi, mutta pilkka osuukin omaan nilkkaan ja johtaja kaipaa pettämänsä Nilsin apua kipeästi.

Hanhet paheksuvat ihmisten kuivattaman järven kohtaloa ja syytön Nils ajautuu riidan keskelle. Lopulta kimpaantunut Nils loukkaa Marttiakin. Retkellään Nils tutustuu houkutuslintuun.

Nils ajautuu taas nahistelemaan järven kohtalosta, mutta Akka Kebnekaiselainen menee väliin. Hanhet joutuvat pelastushommiin ja pelastavat samassa enemmän kuin arvaavatkaan.

Nils ja hamsteri törmäävät hirviemoon, joka on kadottanut poikasensa. Pekonin tuoksu johdattaa kaksikon kartanoon.

Nils ja Martti opettavat hirven vasaa uimaan. Martin pelokkuus laukaisee tapahtumaketjun jolla on vakavat seuraukset koko metsälle.

Huono sää pakottaa parven laskeutumaan ennen aikojaan. Sään armoilla on muitakin onnettomia, joita Nils ystävineen päättää auttaa.

Nils putoaa Martin selästä ja laskeutuu karhun pesään. Akka Kebnekaiselainen vaarantaa koko parven Nilsin etsintöjen vuoksi.

Parvi laskeutuu Uppsalaan. Nils hamstereineen yrittää varpusten ja pulujen apajille.

Kevät koittaa vihdoin ja sulattaa lumet, aiheuttaen tulvia. Smirre turvautuu likaiseen temppuun.

Akka Kebnekaiselainen saa odottamattoman avunpyynnön joutsenilta. Martti ja joutsenet ottavat yhteen.

Bataki-korppi on pitkään ihmetellyt mitä vanha puinen mökki pitää sisällään. Kun korppi huomaa avonaisen oven, lennähtää tämä suoraan sisään, mutta jääkin vangiksi. Nyt tarvitaan Nilsin apua!

Akka Kebnekaiselainen antaa Nilsille luvan lähteä tutkimaan festivaalialuetta. Innostunut Nils löytääkin kaikkea mitä on kaivannut, musiikkia, lapsia, tarkkuusammuntaa, kilpailuja.

Matka pohjoiseen jatkuu. Nuori villihanhi pyytää lupaa vierailla vanhempiensa luona. Akka Kebnekaiselainen arvaa Martin liittyvän asiaan läheisesti.

Nils käyskentelee kauniilla niityllä kuumana kesäpäivänä, kunnes Smirre yllättää hänet. Nils juoksee läheiselle maatilalle, jossa on iso vahtikoira. Kuka päätyykään lopulta liekaan?

Akka Kebnekaiselainen lentää pitkin kaunista lahtea laumansa kanssa, kunnes yhtäkkiä paikallinen kalastaja säikäyttää heidät. Martti saa niin kovan sätkyn, että Nils ja hamsteri putoavat mereen!

Nils ja hamsteri tutustuvat kotkaan. Alkuun kotkan jutut kuulostavat hölynpölyltä, mutta sitten selviää, että heillä on yhteinen tuttu.

Nils on kovin nälkäinen ja väsynyt. Leivän tuoksu houkuttelee peukaloisen maatilalle, jossa koti-ikävää poteva Nils päättää tehdä jotain odottamatonta ja paljastaa itsensä maatilallisille.

Kolmikko jatkaa kulkuaan kohti pohjoista. Nils ikävöi Akka Kebnekaiselaista, mutta saa lohdutusta yllättävästä yhteentörmäyksestä.

Nils joutuu kohtaamaan pelottavan metsäpalon! Eläinten panikoidessa pieni metsähiiren poikanen on joutunut eksyksiin perheestään. Nils ja kotka lähtevät etsimään hiirulaista palavasta metsästä.

Kolmikko pysähtyy lepäämään ja joutuu erotuomariksi lintujen kiistaan. Lintujen sanaharkka äityy niin sekavaksi, että Nilskin on pyörällä päästään.

Kolmikko lähestyy Lappia ja loitonnee samalla auringosta. Nilsiä paleltaa ja nälättää.

Akka Kebnekaiselaisen salainen laakso on paljastunut. Kaksi ihmislasta vaeltaa laaksossa etsimässä isäänsä. Nilsin käy lapsia sääliksi ja hän päättää auttaa heitä.

Kevät on tullut Lappiin. Hanhet rakentavat innoissaan pesiään ja valmistautuvat perheenlisäykseen. Martti on täpinöissään ja Nilsillä on aikaa etsiä seikkailuja.

Smirre kaappaa yhden Martin poikasista ja vaatii vaihdossa Nilsiä. Akka Kebnekaiselainen ei suostu vaihtokauppaan.

Poikasten hölmöilyt pitävät hanhet kiireisinä aamusta iltaan. Nils tylsistyy ja lähtee tutkimaan lähialueita.

Bataki tutustuttaa Nilsin mökkihöperönä pidettyyn naiseen. Pian Nilsille selviää, ettei kyseessä ole mikään mökkihöperö vaan todella eläinrakas ihminen.

Kesä enteilee loppuaan ja etelään muutto alkaa olla käsillä. Akka Kebnekaiselainen ei henno jättää hyvästejä Gorgolle, mutta kotkan on opittava elämään kuin oikea kotka.

Matkalla etelään huono sää pakottaa seurueen laskeutumaan. Nils lähtee tutkimaan paikkoja ja kohtaa kirotun puutarhurin!

Nils tapaa tytön, joka kertoo rutiköyhän kalastajakylän tarinan. Saattaakseen pienen kylän taas loistoonsa, Nils auttaa kalastajia tekemään sovinnon lokkien kanssa.

Nils hamstereineen päätyy pitämään sadetta observatorioon - he eivät ole ainoita paikalla ja kuulevat eriskummallisen tarinan jättiläisistä.

Nälän piinaama Smirre jäljittää yhä Nilsiä. Smirre tapaa tyttöketun ja kertoo epäonnisen saalistustarinansa.

Nilsin tunteet kotiinpaluusta ovat kaksijakoiset. Akka Kebnekaiselainen paljastaa todelliset ehdot jotka haltia antoi palauttaakseen Nilsin normaalikokoiseksi.

Kauhistunut Nils ei aio palata kotiin, jotta Martti saa pitää henkensä. Lohduton Nils toivoo kaiken olleen vain pahaa unta ja Akka yrittää lohduttaa häntä.

Nils päättää jäädä hanhien keskuuteen, mutta haluaa kerran vielä kävellä kotipihansa läpi. Kävelyllään Nilsille selviää millaisissa vaikeuksissa hänen vanhempansa ovat.

Haltian ehdoista tietämätön Martti lentää suoraan ansaan näyttäessään kotipaikkaansa poikasilleen. Ehtiikö Nils pelastaa Martin ennen kuin haltian loitsu käy toteen?