גופה של יועצת חינוכית בתיכון עשויה להוכיח את חפותה של ברנן, אך קודם הצוות צריך לברר אם כריסטופר פלאנט עדיין מנהל את ההתרחשות מאחורי הקלעים. בינתיים, ברנן ואביה ממשיכים לחמוק מה-אף-בי-איי.

בות' וברנן חוקרים יחד מקרה רצח של עורך דין מפורסם לגירושין, שהיה במהלך תהליך גירושין בעצמו. החקירה מזכירה לבות' וברנן את הקשיים במערכת היחסים שלהם לאחר ששהו 3 חודשים בנפרד.

לאחר שברנן ובות' מזהים גופה של אדם שמת בפיצוץ במכונית, הם מגלים כי הוא עדיין בחיים. מסתבר כי זוג תאומים זהים ,לא ידעו האחד על קיומו של השני, וסבלו במקביל מאיומים מנשותיהם.

עובד גן חיות נהרג, והצוות קובע כי יש למקרה קשר לסחר לא חוקי בבעלי חיים. ד"ר סוויטס ודייזי מדברים על מצב מערכת היחסים ביניהם ומגיעים להחלטות.

הצוות נקרא לזהות גופה מרוטשת של אישה, לאחר שנזרקה לפח זבל גדול בעיר. ברנן מתקשה להפריד בין חייה הפרטיים לעבודה כשבות' מרחם על סוויטס ומזמין אותו להישאר איתם עד שימצא מקום מגורים חדש.

ברנן אוספת את הצוות שלה לפרוייקט מיוחד. היא מבקשת מהם לזהות שרידים שנקבעו כבלתי ניתנים לזיהוי, כשהמשימה הקשה ביותר היא שרידים של גופה מה-9/11, שלא יודע אם היא קורבן או מחבל.

בות' וברנן חוקרים כיצד גופתו של מנקה זירות פשע נשטפה אל החוף בתוך תרמיל אטום למים. בחזרה במעבדה, אנג'לה והוגינס מגלים שלקאם יש רומן סודי.

אמן רחוב המדביק את היצירות שלו על שלטי חוצות, נופל יחד עם הדבק על גופה, מצב מאתגר לצוות שצריך להפריד בינו לבין העצמות שדבוקות אליו. בות' יוצא למשימה סמויה כדי לזהות חשודים פוטנציאליים.

בזמן חקירת רצח של ילד, הצוות מאפשר להרמוניה אבלון גישה לגופה בשל טענתה כי נשמתו של הילד עוד לא השתחררה. עבודתה של אבלון גורמת לצוות לחשוב מחדש על אמונתם בחיים שאחרי המוות.

רצח של רקדנית מספר ימים לפני אודישן למופע גורם לבות' וברנן לאוורר את נעלי הריקוד שלהם, ולצאת למשימה סמויה כמשתתפים בתחרות לריקודים סלוניים.

הצוות יוצא למשימה, לאחר שארכיאולוג ידוע נרצח, ממש לאחר תגלית משמעותית שהייתה אמורה להזניק את הקריירה שלו.

לאחר שסוממו, מתעוררים אנג'לה והוגינס לגלות גופה מעל למיטתם ועלי כותרת פזורים סביב לעריסת בנם. הם בטוחים כי פלאנט חזר לנקום בהוגינס, בות' מציע לפעול מבפנים.

הצוות חוקר שרידים של שתי גופות שנמצאו באותה חלקת קבר, אחת של חולת סרטן השד והשנייה של מי שהדריכה אותה בתהליך האבל עם המחלה. בהשפעת המקרה, בות' וברנן דנים בבחירות שלהם לסידורים אחרי המוות.

אנג'לה יוצאת למשימה סמויה לאחר שמתגלה גופה של מחליקת רולר דרבי. קאם מודאגת מהמספר העצום של פגישות עם הרופא שבות' הולך אליהן, ולוחצת עליו לגלות לה מה קורה.

ברנן עובדת עד מאוחר במעבדה והופכת קרבן לירי. היא מובהלת במצב קריטי לבית החולים. בזמן שהותה שם היא חווה חזיונות לא נעימים הסותרים את ההגיון הפנימי שלה. חקירת המקרה מגלה כי הירי קשור לצוות.

הצוות חוקר מקרה מוות של נער בן 15. אימו וסביבתו הקרובה חושבים שהיה נער אינטיליגנטי בעל כישורים חברתיים נמוכים. אולם בחקירה מסתבר כי הוא היה מעורב בפעילות בלתי חוקית, ואולי אף השתמש בסמים.

הגרסה החדשה לממצאים שמציע המתמח החדש של ברנן מאתגרת אותה לסטות מהדרך המדעית הצרה. בות' מודאג כי הפתיחות של לתיאוריות קצה, עלולה להשפיע על חקירת מקרה הרצח שלו.

בות' וברנן בוחנים מקרה רצח של מהגר מסייר לאון שגופתו נמצאה בתוך חבית באתר פסולת מסוכנת. במעבדה, יחסיהם של קאם וארסטו עומדים להיחשף וברנן ובות' מתכננים חופשה.

שרידים חרוכים של גופת חייל מארינס לשעבר, מובילה את הצוות לחקירת קבוצה המתכוננת לקראת אפוקליפסה. בות' וברנן חווים רגשות מעורבים כשסוויטס מוצא סוף סוף דירה להשכרה.

שוטר סמוי שהיה מעורב בחקירת שרשרת מקרי שוד של כספומטים, נמצא מת כשבתוך גופו הפצוע מוחבאת שקית של יהלומים. על הצוות לגלות אם מקרי השוד הובילו לרצח, או שמא היה זה שוטר מושחת.

הצוות חוקר רצח של מפיק טלוויזיה. ברנן מתקשה להשלים עם העובדה שקריסטין היא ילדה רגילה, כשהיא מואשמת שנשכה חבר לכיתה. הוגינס משתמש בידע הכימאי שלו כדי לפצח את מרכיביו של הרוטב המיוחד של פין.

הקבוצה חוקרת רצח של סוכן בורסה מצליח ביום וחשפן בלילה. חשד נופל על חבריו הקרובים במועדון החשפנות. אמו של בות' מגיעה לבקר אחרי 24 שנים ויש לה בקשה מיוחדת.

הצוות יוצא לעצור התפרצות של נגיף, בזמן חקירת רצח של עיתונאית שגופתה נמצאה נגועה במתקן לחומרים מסוכנים. כאשר הוירוס האלים תוקף את אחד מחברי הצוות, הסיכוי היחיד שלהם להצילו הוא פתרון הרצח.

בפרק האחרון לעונה, הגאון כריסטופר פלנט חוזר לאיים על הקבוצה. הם מגלים קשר בין רציחות סוכני ה-אף-בי-איי לבין בות'. ברנן מתחילה לפקפק ביחסיה עמו.