Booth se vraća u FBI-a nakon razgovora s doktorom Sweetsom i pita se jesu li njegovi osjećaji prema Brennan istinski ili tek posljedica operacije mozga. Angelina vidovnjakinja i medij, Avalon (Cyndi Lauper) vodi Booth i Brennana do zločina i tijela koja su zakopana ispod fontane. Jedno od tijela je i Avalonina mlađa sestra.

Booth i Brennan prihvaćaju povjerljiv slučaj smrti CIA-nog analitičara te pokušavaju saznati koji je bio sadržaj poslovne torbe u njegovom vlasništvu. U Jefforsonian institutu proračun je smanjen pa financiranje Wendellovog školovanja postaje upitno. U međuvremenu, Booth se bori s posljedicama kome u kojoj se je nalazio i mora ponovno učiti popravljati neke stvari u svom domu.

Tim istražuje ostatke tinejdžera, pripadnika amiške zajednice koji je nestao prije rumspringa, kada je mogao dobiti priliku otkriti novi svijet. Istražitelji uskoro doznaju da je dječak bio nevjerojatni pijanist, koji je svoj talent sakrivao od obitelji. Boot pomaže riješiti kompliciranu obiteljsku situaciju.

Brennan i Booth istražuju ljudske ostatke nađene za vrijeme velike kvartovske veselice. Političke spletke, tajne i skandali daju većini susjeda dobre motive za ubojstvo pa Brennan, Booth i Sweets moraju dobro istražiti kako bi pronašli krivca. U međuvremenu, stažist Arastoo s Jeffersonian instituta otkrije svoje podrijetlo, a Bootu sin pokušava naći djevojku.

Pougljenjeni ljudski ostaci pripadaju egipatskoj mumiji koja se nalazila na posudbi u Institutu Jeferson. Ubijen je kurator, koji je pripremao mumiju za izložbu, i sada je očito da je posrijedi prljava igra. Istraga otkriva nove detalje o mumiji, a slučaj se počinje pretvarati u otkriće povijesnih razmjera.

Pronađeno je osakaćeno tijelo lokalnog uzgajivača kokoši. Farmer je imao reputaciju okrutnog uzgajivača protiv kojeg su ljubitelji životinja često prosvjedovali. Imao je mnogo neprijatelja, od ekstremnih aktivista za životinjska prava, do ljutitih susjeda.

Zbog operacije glave, Booth ponovno polaže ispit u streljani na kojem pokaže da više nije precizan strijelac kakav je nekad bio. Tim istražuje ubojstvo osobe niskog rasta koja se hrvala pod nadimkom Željezni Vilenjak.

Boothov djed Hank dolazi živjeti s njim i pridružuje se Boothu i Brennan u istrazi pougljenjenih ostataka koje je našao trgovac nekretninama dok je pokazivao kuću potencijalnim kupcima. I dok Hank izigrava ljubavnog posrednika Boothu, ujedno Brennan otkriva nekolicinu obiteljskih tajnih.

U kamionu je pronađeno beživotno tijelo igrača poznate video igrice. Gamer je uvijek bio vrlo natjecateljski raspoložen i svoje je protivnike često izazivao da pokušaju srušiti njegov sjajan rezultat.

Osoba odjevena kao Djed Božićnjak raznese se za vrijeme pljačke banke koja je krenula po zlu, a Brenann i Booth pokušavaju otkriti identitet pljačkaša i motive razbojstva. Brennan planira provesti Božić u El Salvadoru, no njen otac je uvjeri da provede praznike s njim i Margaret Whitesell, daljom rođakinjom koja je tek nedavno ušla u njihove živote.

U Novom Meksiku pronađeni su ljudski ostaci, a kraj njih i dokazi izvanzemaljskog podrijetla. Žrtva je lokani istraživač NLO-a, čije je neumorno traganje za izvanzemaljskim životom urodilo plodom, ali ga i koštalo života. Čak i Brennan i Booth njegove dokaze prihvaćaju kao vrlo uvjerljive. U međuvremenu, Angela i Wendell, stažist Instituta Jefferson, otkrivaju svoju vezu.

Vladini agenti privremeno zatvore Institut Jefferson i traže od Brennan i njenog tima da otkriju razlog smrti neidentificiranih ljudskih ostataka. I dok tim počinje vjerovati da je istraga povezana s poznatim atentatom na predsjednika, Boothov nadređeni pomaže mu da provali u laboratorij i otkrije istinu. U međuvremenu, Cam se brine da Michelle pred njim nešto skriva.

Prizori građanskog rata ponovno oživljavaju kada jedan od glumaca pronađe ljudski kostur u rovu bojišta. Istragom ostataka nesretnika utvrđeno je da kosti ne pripadaju starom vojniku, već lokalnom zubaru. Boothov brat Jarred vraća se sa svojih putovanja s iznenađujućim vijestima, no Booth novosti prima s nevjericom. U međuvremenu, Booth i Brennan odlaze u dom žrtve gdje nađu Lucasa, koji je iznenađen Dannyjevom smrću, no otkrije da je žrtva imala grozan prekid s bivšom ženom.

Brennan i Booth istražuju nekolicinu unakaženih ostataka, nagrđenih na vrlo jedinstven način. Jedna žrtva bila je pacijent dr. Adama Copelanda iz Havenhurst bolnice za mentalno oboljele, a osumnjičene je teško okarakterizirati i razotkriti. U međuvremenu, u Institutu Jefferson stažist Arastoo Vaziri otkriva tajnu iz svoje prošlosti.

U jubilarnoj, stotoj epizodi Brennan i Booth prisjete se prvog slučaja koji su zajedno rješavali za objavljivanje u knjizi doktora Sweetsa. Tada mladi i buntovni Booth traži pomoć antropologinje i uličnog umjetnika, a Brenann i njen student Zack te Hodgins primaju se posla te impresioniraju Bootha radeći nevjerojatnom brzinom i sposobnošću otkrivanja novih tragova, koji će pokrijepiti Boothovu teoriju o gradskom sucu s dobrim poslovnim vezama.

Na tajnom zadatku Brennan i Booth se pretvaraju da su u braku i odlaze na njenu proslavu srednjoškolske obljetnice kako bi istražili ubojstvo jedne od njezinih školskih kolegica. Neobično je što se i kao odrasla osoba Brennan osjeća kao autsajderica u starom školskom društvu, a jedina osoba s kojom se druži je ćudljivi školski domar. U međuvremenu, Hodgins otkrije tajnu iz laboratorija.

Ljudski ostaci pronađeni su u utrobi morskog psa, no dokazi ukazuju da je žrtva bila plijen nekolicine drugih riba. Sada tim istražuje akvarij iz kojega je nestao predavač, zloglasni guru koji podučava o samopomoći i propovijeda o iscjeliteljskim moćima oceana. Brennan i Booth odjednom se uhvate kako analiziraju svoj odnos, a povod je bila morska biologinja koja je pokazala interes za Bootha.

Tijelo bogatog avanturista pronađeno je u hotelskoj perilici rublja. Booth i Brennan vode istragu koja ih odvodi do rock'n'roll kampa. U laboratoriju je s ostacima žrtve pronađen djelić kljove prapovijesnog mamuta, a Angelini znanje o glazbenoj industriji posluži u traženju poveznice između potencijalnih sumnjivaca i pronađenih tragova. U međuvremenu, zbog kćeri Michelle, Cam je u potrazi za doktorima.

U izgorenoj kolibi u šumi pronađena su dva kostura – jedan pripada modernoj vještici, očigledno nedavno nastradaloj, a drugi vještici iz Salema iz 17. stoljeća. Booth i Brennan kreću u istraživanje svijeta wicce, neopoganske moderne religije. U međuvremenu, zbog Hodginsove neoprezne vožnje, Angela i on završe u zatvoru, a Sweets i stažist Clark Edison pokušavaju pomoći timu.

Počinje suđenje Gravediggeru, točnije bivšoj državoj tužiteljici Taffet koja se odlučila sama braniti. Hodges, koji još uvijek ima noćne more zbog Taffet, misli da se ona na sudu poigrava s njima. Taffet diskreditira čak i Boothovo svjedočenje pa tim na Institutu Jefferson na sve načine pokušava pronaći forenzičke dokaze koji bi optužili Kopačicu grobova.

Brennan i Booth istražuju stan čovjeka koji je volio sakupljati i gomilati svakojake stvari. Žrtva je imala četrdesetak godina, a u stanu su pronađeni kukci koji su možda pridonijeli brzom raspadu tijela. Uskoro Booth dobiva primamljivu ponudu iz vojske, a u posjet dolazi i Angelin otac koji za to ima specijalni razlog.