Na putu prema mjestu nesreće Brennan priča Boothu kako je godišnji odmor provela s bratom i kako je odlučila zajedno s njim krenuti u potragu za ocem, koji je nestao prije mnogo godina. Ubrzo stižu na mjesto na kojem je vlak iskočio iz tračnica, a tamo ih dočekaju policajci i medicinsko osoblje. Istraga ukaže da se tragedije dogodila jer se Warren Lynch automobilom zaustavio na tračnicama, najvjerojatnije kako bi počinio samoubojstvo. No kad Brennan otkrije da je Warren bio mrtav satima prije no što ga je udario vlak, u istrazi dolazi do zaokreta.

Policija u marini pronađe tijelo Carlie Richardson, trudnice čiji je nestanak istraživala Brennan. Slučaj koji je prije godinu dana prilično zainteresirao medije, ali je ostao neriješen, sada je uzrok prepirke između Brennan i Bootha. Policija otkrije kako je tek vjenčanu žrtvu suprug varao te su se vjerojatno posvađali i na dan njezina nestanka, a svjedoci su ga vidjeli na putu prema marini. Tijekom vožnje prema laboratoriju Bootha nazove bivša djevojka i potakne ga na razmišljanje o sinu.

Kamion za smeće otkriva tijelo mladića koji je nestao prije tri tjedna. Istraga otkriva prvog osumnjičenog - djevojku koja je odrasla bez svojih pravih roditelja. Detektivka Brennan se emocionalno veže za djevojku jer je i ona sama prošla kroz takvo iskustvo i uvjerena je u njezinu nevinost iako ona i sama priznaje zločin. Ostatak tima to primjeti što rezultira sukobom između Cam i Brennan.

Brennanicu i Bootha policajac vodi šumom do mjesta na kojem je jogger naišao na ljudske ostatke. No pored njih naiđu na agresivnog dobermana koji im ne dopušta prići pa će se Brennan morati potruditi zavarati psa i omogućiti im da prionu istrazi. U laboratoriju otkriju kako je žrtva tinejdžerka, a ubrzo svima postane jasno da je njezin ubojica Howard Epps, koji u zatvoru iščekuje smrtnu kaznu. Brennan je jedina s kojom ubojica želi razgovarati i ubrzo joj ukaže na novu žrtvu, ubijenu prije samo tjedan dana. Jasno je kako Epps ima suradnika, koji ubija nakon njegovog uhićenja.

Brennan nazove Bootha u vezi s tijelom pronađenim na gradilištu i prilično se iznenadi kad se na mobitel javi njegova bivša djevojka. Iako se on pretvara kako je kod bivše došao pokupiti sina, Brennan je kristalno jasno što se upravo dogodilo. Nakon toga, oni odvojeno stignu na mjesto zločina i ubrzo otkriju identitet ubijenog muškarca, koji je vodio dvostruki život i imao dvije obitelji. Isprva se čini kako su ubojstvo počinile njegove dvije supruge kako bi kaznile poligamnog supruga i uzele novac od osiguranja, ali kad se pojavi novi dokaz i treći osumnjičeni, pokaže se da je riječ o nečem posve drugom... Epizoda 6. - The Girl in Suite 2103 U hotelu u kojem je održana konferencija o krijumčarenju droge dogodila se eksplozija prilikom koje je poginulo četvero ljudi. Brennan i Booth dolaze na mjesto događaja. Predstavnik vladina ureda Alex Radziwill povjeri im svoju sumnju da je eksplozija bila namijenjena govornici konferencije, Kolumbijki Dolores Ramos, koja je sudski ataše. Angela i Hodgins u laboratoriju otkriju kako je hotelska soba pretrpjela požar prije same eksplozije. Ispadne kako je netko bio u sobi prije eksplozije, a dokazi upućuju na hotelsku konobaricu Lisu. Istražitelji sada ispituju Lisinu mamu, koja im kao ključnu informaciju iznese činjenicu da njezina kći iza sebe ima brojne veze.

Pred Brennan i Boothom je istraga o smrti desetogodišnje djevojčice. U laboratoriju otkriju kako joj je lice bilo prekriveno teškom šminkom, a pokušaj DNK analize njezine vlasi propadne jer joj je kosa izbijeljena. Angelinina kompjuterska konstrukcija žrtvinog lica ukaže da je riječ o Brianne Swanson, koja je imala ulogu malene kraljice ljepote u svečenoj povorci, a nestala je prije šest mjeseci. Briannina majka istražiteljima povjeri kako sumnja na bivšeg supruga, koji je jednom komentirao kako bi radije da mu kći bude mrtva nego slična majci. U međuvremenu Angela pristane izaći s Hodginsom i ugodno se iznenadi ishodom toga spoja. Epizoda 8. - The Woman in the Sand Brennan i Booth stižu u pustinju nedaleko Las Vegasa istražiti mrtvo tijelo saveznog tužioca Masona Robertsa, nestalog 2001. godine. Trenutak prije no što odu s mjesta zločina, nedaleko Masonovog tijela pronađu i truplo nedavno preminule ženske osobe, koja je ubijena na sličan način kao i Mason. Riječ je o dvadeset šestogodišnjoj Billie Morgan, čiji je nestanak prije dva tjedna prijavio njezin suprug Don. Brennan zbog njegove slomljene ruke odmah posumnja da je Don zatukao suprugu, no on im pojasni da mu je ruku slomio kamatar, kojem je ostao dužan. Daljnja istraga vodi ih u ilegalni svijet ultimate fighta.

Brennan i Booth stižu u pustinju nedaleko Las Vegasa istražiti mrtvo tijelo saveznog tužioca Masona Robertsa, nestalog 2001. godine. Trenutak prije no što odu s mjesta zločina, nedaleko Masonovog tijela pronađu i truplo nedavno preminule ženske osobe, koja je ubijena na sličan način kao i Mason. Riječ je o dvadeset šestogodišnjoj Billie Morgan, čiji je nestanak prije dva tjedna prijavio njezin suprug Don. Brennan zbog njegove slomljene ruke odmah posumnja da je Don zatukao suprugu, no on im pojasni da mu je ruku slomio kamatar, kojem je ostao dužan. Daljnja istraga vodi ih u ilegalni svijet ultimate fighta.

Brennan se probudi u svom autu, na stražnjem sjedalu s Hodginsom, kojem je slomljena noga. Isprva nema pojma što se događa, a kad pokuša otvoriti prozor, u auto uđe samo prljavština. Ubrzo shvati kako su oni posljednje žrtve zloglasnog serijskog ubojice koji zakapa svoje žrtve i zatim za njih traži otkupninu. Osim što im je preostalo kisika za svega deset sati, Hodginsova ozljeda noge se naglo pogorša pa je Brennan prisiljena izvesti poseban zahvat kako bi mu spasila život. Uspiju poslati poruku Boothu, ali je tim ne uspije dešifrirati u narednih dvanaest sati. No Booth ne odustaje, uvjeren kako su njegovi kolege pronašli način da prežive pod zemljom...

Brennan i Booth istražuju smrt studenta filmske umjetnosti Grahama, koji je snimao dokumentarac temeljen na legendi o bezglavoj vještici Maggie. Legenda kaže kako će njezin duh ubiti svakog tko je bude tražio po lokalnim šumama. Booth i Brennan stižu do mjesta na kojem leži njezino tijelo, po njihovoj procjeni između osamnaest i dvadeset pet godina starosti. U laboratoriju ne prestaje razgovor o vještici pa Brennan nastoji zadržati glas razuma. Grahamovi kolege tvrde da ih je cijelo vrijeme u šumi netko slijedio, no čini se kako je za studentovu smrt odgovoran njegov brat Will, koji je upravo na spoju s Brennan...

Brennan i Booth na krovu hotela nalaze izmučeno, upucano i zapaljeno tijelo bivšeg agenta FBI-a. Zaključuju kako je njegovo ubojstvo vjerojatno upozorenje te da će takvih ubojstava biti još. Dokazi istrage otkrivaju staru urotu u kojoj je 60-ih godina prošlog stoljeća sudjelovala nekolicina korumpiranih agenata FBI-a, pa Brennana uplaši slutnja kako je možda i sam njegov otac bio odgovoran za ta brutalna ubojstva. Situacija se još više zakomplicira kad Brennan i Booth ostanu iznenađeni naredbom upravitelja FBI-a kako trebaju odbaciti ovaj slučaj. Epizoda 12. - The Man in the Cell U zatvorskoj ćeliji izgorio je zatvorenik te su Brennan i Booth pozvani da istraže što se točno dogodilo. Nakon što im upravitelj zatvora kaže kako je požar zapravo izbio u ćeliji Howarda Eppsa, serijskog ubojice kojeg je sam Brennan zatvorio, kolege odlučuju osigurati Brennana od mogućih posljedica tako da nigdje ne smije ići sam. No, nakon nekoliko ključnih dokaza i pronalazaka još bezglavih leševa, Booth savjetuje Brennanu da bi trebao otići kući odspavati. Brennan odlazi u svoj stan, no ne zna kako je Howard Epps pobjegao iz zatvora te da mu je on postao nova meta.

U zatvorskoj ćeliji izgorio je zatvorenik te su Brennan i Booth pozvani da istraže što se točno dogodilo. Nakon što im upravitelj zatvora kaže kako je požar zapravo izbio u ćeliji Howarda Eppsa, serijskog ubojice kojeg je sam Brennan zatvorio, kolege odlučuju osigurati Brennana od mogućih posljedica tako da nigdje ne smije ići sam. No, nakon nekoliko ključnih dokaza i pronalazaka još bezglavih leševa, Booth savjetuje Brennanu da bi trebao otići kući odspavati. Brennan odlazi u svoj stan, no ne zna kako je Howard Epps pobjegao iz zatvora te da mu je on postao nova meta.

Brennan je prisiljena raditi s novim partnerom - FBI-evim istražiteljem Sullivanom nakon što je Booth ispalio metak u klaunovu glavu na vrhu kamiona sa sladoledom. Prije ponovnog vraćanja na posao Booth mora proći psihijatrijsko liječenje. Iako nije oduševljena novim partnerom, Brennan ne preostaje drugo no prionuti slučaju studentice Judy, nestale na proljetnim praznicima. Na žalost, sve upućuje na to da je Judy pojeo krokodil. Ugodno iznenađena partnerovom svestranošću, Brennan prihvati njegov poziv na večeru. Epizoda 14. - The Man in the Mansion Brennan i njezin tim dobivaju poseban zahtjev - da istraže smrt bogatog Terryja Bancrofta, koji je izboden u svojoj ogromnoj kući. Istraga rezultira svjedočenjem cijelog tima na sudu i vodi do zaključka da je Hodgins na neki način povezan s ubojstvom. Brennan ima 24 sata za pronalazak novog dokaza, koji će optužiti Frasiera i osloboditi Hodginsa. Brennan naposljetku pristane otići na košarkašku utakmicu sa Sullyjem, što vodi do njihove prve zajednički provedene noći.

Brennan i njezin tim dobivaju poseban zahtjev - da istraže smrt bogatog Terryja Bancrofta, koji je izboden u svojoj ogromnoj kući. Istraga rezultira svjedočenjem cijelog tima na sudu i vodi do zaključka da je Hodgins na neki način povezan s ubojstvom. Brennan ima 24 sata za pronalazak novog dokaza, koji će optužiti Frasiera i osloboditi Hodginsa. Brennan naposljetku pristane otići na košarkašku utakmicu sa Sullyjem.

Dok Brennan i Sully uživaju jedno u drugome, nju nazove izdavač da dogovore termin za potpisivanje njezine najnovije knjige. No promociju romana prekine Booth koji je odvuče u marinu - najnovije mjesto zločina. Tamo ih zatekne gotovo identičan slučaj onom iz Brennaninog romana. U laboratoriju se istražitelji pitaju hoće li se dogoditi i druga dva ubojstva iz knjige. Epizoda 16. - The Boneless Bride in the River Brennan i Sully na godišnjem su odmoru, no stalno ih prekida Booth, koji treba njezinu pomoć u rješavanju slučaja žene čije je tijelo bez kostiju pronađeno u rijeci. Brennan se zapita je li riječ o kineskom običaju Minghunu po kojem umrli mladić mora biti pokopan s kostima mlade žene, ali izgleda da do sada nitko nije ubio djevojku kako bi se dočepao njezinih kostiju. Sully ponudi Brennan da se otisne s njim na jednogodišnje krstarenje, ali ona se ne može odlučiti na taj potez. Nakon što se Brennan pozdravi sa Sullyjem, Booth je odvede na doručak kako bi je razvedrio.

Brennan i Sully na godišnjem su odmoru, no stalno ih prekida Booth, koji treba njezinu pomoć u rješavanju slučaja žene čije je tijelo bez kostiju pronađeno u rijeci. Brennan se zapita je li riječ o kineskom običaju Minghunu po kojem umrli mladić mora biti pokopan s kostima mlade žene, ali izgleda da do sada nitko nije ubio djevojku kako bi se dočepao njezinih kostiju. Sully ponudi Brennan da se otisne s njim na jednogodišnje krstarenje, ali ona se ne može odlučiti na taj potez. Nakon što se Brennan pozdravi sa Sullyjem, Booth je odvede na doručak kako bi je razvedrio.

Svećenik vodi Brennan i Zacka na staro groblje, gdje ih očekuje zastrašujući prizor - puknuće vodovodne cijevi uzrokovalo je plutanje ljudskih ostataka. Brennan ih sada mora identificirati kako bi mogli biti ponovno pokopani. Uskoro naiđe na ostatke pokopane prije najviše tri godine, a svećenik tvrdi kako na tom groblju već pedeset godina nitko nije sahranjen, što istražitelje vodi do istrage ubojstva. Booth i Brennan neprestano se prepiru pa su prisiljeni posjetiti terapeuta. Epizoda 18. - The Killer in the Concrete Pred Boothom i Brennan istraga je ubojstva. Booth je uvjeren da krivca treba tražiti u članu kriminalne obitelji, Hughu Kennedyju, ali otkriće da je on spaljen u svom automobilu zakomplicira situaciju. No mafijaš, koji ipak nije ubijen, uskoro otme Bootha. Brennan sada prima pomoć s neočekivane strane - od svog omraženog oca.

Pred Boothom i Brennan istraga je ubojstva. Booth je uvjeren da krivca treba tražiti u članu kriminalne obitelji, Hughu Kennedyju, ali otkriće da je on spaljen u svom automobilu zakomplicira situaciju. No mafijaš, koji ipak nije ubijen, uskoro otme Bootha.

Pronađeni su ostaci tijela koje je doslovno palo s neba, a i čini se da je ondje bilo dulje vrijeme. Brennan i Booth tijekom dugotrajne i zamršene istrage naiđu na brojne teorije o izvanzemaljcima i vladinom zataškavanju da bi naposljetku otkrili kako je riječ o astronautu Howardu. Nakon naporne istrage Hodgins izvede Angelu na romantičnu večeru i zaprosi je, no ona ga odbije uz objašnjenje kako još nije vrijeme za to. Epizoda 20. Brennan i Booth stižu na mjesto zločina - kamenu kućicu u šumovitom predjelu, gdje se nalaze kosti koje se sjaje i mogle bi biti radioaktivne. U laboratoriju je otkriveno više ubodnih rana, a zaključak je da se kosti sjaje od bakterije, često prisutne u sushiju. Saznaje se da je žrtva Carly Victor, glavna kuharica mega popularnog novog restorana. Njezin suprug kaže da ju je zadnji put vidio s prijateljicom Abby, ali nije prijavio njihov nestanak. Dolazi do obrata u Hodginsovoj i Angelinoj vezi – vjenčanje je u planu već sljedećeg tjedna.

Brennan i Booth stižu na mjesto zločina - kamenu kućicu u šumovitom predjelu, gdje se nalaze kosti koje se sjaje i mogle bi biti radioaktivne. U laboratoriju je otkriveno više ubodnih rana, a zaključak je da se kosti sjaje od bakterije, često prisutne u sushiju. Saznaje se da je žrtva Carly Victor, glavna kuharica mega popularnog novog restorana. Njezin suprug kaže da ju je zadnji put vidio s prijateljicom Abby, ali nije prijavio njihov nestanak. Dolazi do obrata u Hodginsovoj i Angelinoj vezi - vjenčanje je u planu već sljedećeg tjedna. Epizoda 21. Nađen je raspadnut kostur mlade djevojke koja je bolovala od rijetke bolesti starenja. Angela rekonstrukcijom lica i uvidom u evidenciju nestalih osoba identificira žrtvu kao Chelseaju Cole. Bootha i Brennan istraga dovede do bivše žrtvine skrbnice, Chelseane majke, ali su zbog slabih dokaza prisiljeni potražiti dodatne razloge tko bi i zašto ubio tako mladu djevojku. U međuvremenu, Hodgins i Angela dogovaraju zadnje detalje skorašnjeg vjenčanja, a Brennan posjeti otac, Max Keenan, te joj predaje zaručnički prsten njezine majke i videokasetu s porukom.

Nađen je raspadnut kostur mlade djevojke koja je bolovala od rijetke bolesti starenja. Angela rekonstrukcijom lica i uvidom u evidenciju nestalih osoba identificira žrtvu kao Chelseaju Cole. Bootha i Brennan istraga dovede do bivše žrtvine skrbnice, Chelseane majke, ali su zbog slabih dokaza prisiljeni potražiti dodatne razloge tko bi i zašto ubio tako mladu djevojku. U međuvremenu, Hodgins i Angela dogovaraju zadnje detalje skorašnjeg vjenčanja, a Brennan posjeti otac, Max Keenan, te joj predaje zaručnički prsten njezine majke i videokasetu s porukom.