Шест месеца след събитията от последния сезон, Буут, Бренън, дъщеря им Кристин и новороденото им дете привидно се наслаждават на живот мечта, далеч от света на убийствата. Но след като Буут мистериозно изчезва, Бренън е принудена да се включи в криминалистичния анализ на останките.

След нови разкрития относно изчезването на Буут и физическото му състояние, екипът открива, че агент Милър крие важна информация от ФБР и института „Джеферсън“, която може да е жизненоважна за намирането на изчезналия агент.

По време на първия официален работен ден на Буут и Бренън на предишните им позиции, съответно във ФБР и института "Джеферсън", са намерени останки при подозрителни обстоятелства в рибна ферма. Става ясно, че от жертвите са взети вътрешни органи.

След като останките на агентката на недвижими имоти Джъстин Рос са открити в гората и очевидно са били унищожени от кръстоски между койоти и вълци, Бренън търси помощта на брилянтната си колега криминална антроположка д-р Бет Майер по случая.

В института "Джеферсън" е Хелоуин, когато екипът изненадващо е посетен от новоназначения агент на ФБР Аби Милс и от Ишабод Крейн, които идват чак от Слийпи Холоу за обезглавено тяло, разследвано вече от д-р Бренън и екипа ѝ.

Двама хигиенисти откриват трупа на сенатор, нарязан в камион за почистване на улиците. Случаят отвежда Бренън и Буут в Капитолия, където се срещат със сенаторката и представителка на мнозинството Хейли Уинтърс, както и с началника на кабинета на жертвата Ерик Моралес.

Екипът разследва важно убийство на политически журналист, открит мъртъв скоро след публикуването на статия, разобличаваща корупцията в Агенцията за национална сигурност на САЩ. Поради естеството на разследването, Ходжинс е обзет от параноя и скоро екипът разбира, че е наблюдаван.

Бренън и Буут се включват под прикритие в състезание по стрелба в стил Дивия Запад в хода на разследване на убийство, докато Анджела и Ходжинс обсъждат бъдещето на семейството си, а Кам се сближава с фотографа Себастиян Кол.

Разследването на убийство на полицейски служител разтърсва екипите както на ФБР, така и на института "Джеферсън". Психологическият анализатор Лесли Грийн работи заедно с Буут по разследването и дава своите професионални оценки на преполагаемия убиец на полицая.

Заради парализата си Ходжинс провежда осемседмична рехабилитация и е принуден да работи в инвалидна количка. Междувременно, Бренън и Буут разследват смъртта на обществена защитничка, чиито бивши клиенти имат мотиви да я убият.

Екипът разследва случай с открит при автомобилна катастрофа труп на основател на организация за правата на мъжете, жертви на домашно насилие.

Екипът на института "Джеферсън" разследва разлагащия се труп на социален работник, открит в парк, но доказателствата сочат, че убиецът е живял с трупа месеци преди да го изхвърли.

Екипът на института "Джеферсън" разследва убийството на осъден престъпник, изчезнал от защитеното жилище, в което е пребивавал след освобождаването си, а заподозреният по случая има връзка с Буут.

Екипът работи по случай на открит труп на частен детектив, намерен замразен в лед, след като е бил изхвърлен в река Потомак. Жертвата, мъж с много врагове, се е занимавал с оправяне на проблемите на клиентите си.

Екипът разследва смъртта на ръководителя на мъжка акапелна певческа група, чието тяло е открито в университетската лаборатория. Наскоро жертвата е бил изгонил Иън Янсен, един от най-добрите певци на групата, което кара Буут и Обри да разпитат него и останалите членове на групата.

Пиян колежанин открива трупа на агент от Тайните служби точно преди визитата на президента в региона. Буут с изненада разбира, че колегите му от Тайните служби имат резерви към включването му в случая.

Телевизионен екип следва Бренън, Буут и екипа на "Джеферсън" по време на разследване на "типичен" случай – труп, заровен в сметище преди повече от десет години. Камерата успява да улови невиждани моменти от работата на екипа, докато Буут и Обри демонстрират уникалните си професионални умения.

Екипът работи по случай със захвърленото обезглавено тяло на популярен професионален хокеист в реката. Докато Буут и Обри разпитват треньора на жертвата, дълбоките познания за хокея на Буут изиграват важна роля за разрешаването на случая.

След като останките на известния изследовател милионер Хенри Чарлс са открити в Антарктика, случаят е поверен на Бренън и Буут, за да разберат дали смъртта му е в следствие на убийство.

Екипът работи по случай с труп, открит в завод за рециклиране на стъкло с поставен в челюстта му диамант. Френският инспектор Русо се свързва с екипа с обвинение срещу маркиз дю Шосан.

Екипът се захваща с разследване на сериен убиец от миналото, опитвайки се да открият "Кукловода", който живее с труповете на жертвите си преди да ги изхвърли.