Nakon povratka iz Guatemale, antropologinja dr. Brennan pozvana je da pogleda kosti koje su namjerno skrivene u jezeru. Vrlo brzo otkriva da kosti pripadaju crnoj tenisačici, a nakon rekonstrukcije lubanje, agent Booth prepoznaje žrtvu - senatorovu ljubavnicu koja je nestala prije 2 godine... Dr. Brennan i FBI agent Booth postaju partneri koji će zajedničkim snagama riješiti svoj prvi slučaj.

Dr. Brennan i FBI agent Booth istražuju misterioznu smrt studenta elitne škole. Nestor Olivios bio je sin venezuelske veleposlanice, a pronađen je obješen o drvo. Iako sve ukazuje na samoubojstvo, mladićevi roditelji u to ne vjeruju, a pomna istraga istražitelje vodi do dva studenta koji bi mogli biti upetljani u slučaj. Zadnja poruka koju su roditelji primili od sina bio je e-mail iz Nova Scotie, gdje je bio na odmoru s prijateljem. Postavlja se pitanje kako je Nestor mogao tada poslati poruku kada je bio mrtav već dva tjedna.

Kad veterinar i lugar u washingtonskoj šumi pronađu ljudsku ruku u tijelu mrkog medvjeda, dr. Brennan putuje u maleni gradić istražiti neobičan slučaj. Nakon detaljnog proučavanja kostiju, ona zaključi kako je ruka i prije no što je završila u medvjeđoj utrobi odvojena od ljudskog tijela. No, Zack po nađenoj ruci nalazi ljudske ugrize što istražitelje dovede do zapanjujućeg otkrića – ne radi se samo o ubojstvu, već i o kanibalizmu. Iako pronalazak ljudskih leševa kojima nedostaju pojedini organi prvotno upućuje na lugara Shermana, ispadne kako je njegov jedini prijestup krivolov.

Brennan i Booth ponovno udruže snage kako bi otkrili krivca za seksualno zlostavljanje i ubojstvo dječaka, čije je tijelo pronađeno nedaleko trgovačkog centra, u predgrađu. Prvi osumnjičeni je već poznati seksualni prijestupnik Alber Hayes, ali ga istražitelji uskoro pronađu mrtvog u njegovom stanu. Pokaže se kako je on bio mrtav već prije dječakove smrti. Slijedi ispitivanje dječakove majke i ljudi koji su ga okruživali. Brennan i Zack, pak, u laboratoriju zaključe kako je dječak ubijen teškim, tupim predmetom, a u ustima mu pronađu neobičnu kemikaliju.

Brennan nevoljko popusti Angelinom nagovaranju da izađu u afroamerički hip-hop klub, ni ne sluteći kako će ih iznenadna tučnjava koja se tamo dogodi navesti na istragu misterioznog ubojstva. Kad Brennan udari ogromnog sudionika tučnjave i ovaj sruši zid, dogodi se nešto posve neočekivano i metež pada u drugi plan. Naime, u zidu se nalazi mumija i vrećica s drogom, koja se poput snijega rasipa po gostima. Žrtva je identificirana kao Roy Taylor i slovio je za jednog od najboljih washingtonskih hip-hoperskih DJ-ja. Istraga započne ispitivanjem vlasnika kluba, Randalla Halla, koji im otkrije kako je najveći neprijatelj pokojnog DJ-ja bio njegov glazbeni rival Rulz. Iako Boothu i Brennan ubrzo postane jasno kako on sigurno nije krivac, Rulz, na sveopće iznenađenje, želi biti osuđen, jer bi u tom slučaju porasla prodaja njegovih glazbenih uradaka. Istraga ih ponovno vodi do kontroverznog Halla...

Odvjetnik čiji je klijent osuđen na smrtnu kaznu traži pomoć za dokazivanje njegove nevinosti prije smaknuća. Booth i Brennan pristaju pružiti mu pomoć.

Brennan posjeti stari prijatelj i profesor s fakulteta. Kako su nekada bili ljubavnici, ona odluči s njim otići na večeru što iznenadi sve prisutne. U tom trenutku dolazi Booth s novim slučajem - ostaci mlade žene nađeni su u zamrzivaču.

Angela nagovara Brennana da zajednički pođu na božićnu zabavu, ali je on potpuno nezainteresiran. Tek kasnije ona sazna kako su njegovi roditelji nestali neposredno prije božićnih blagdana, što je na njemu ostavilo neizbrisiv trag i uništilo božićni duh. Booth ih obavijesti da je otkriveno sklonište za bombu na federalnom posjedu i u njemu leš pa proslava pada u drugi plan. Istražiteljica Brennan odmah posumnja na samoubojstvo, a ubrzo počne i detaljna istraga na neidentificiranom tijelu: Brennan u pokojnikovom džepu pronađe dvije karte u jednom smjeru za Pariz, kao i metak u lubanji. Kad Zack uzme uzorak koštane srži, oglasi se alarm i vrata laboratorija se automatski zaključaju. Naime, Hodgins je prekršio jedno od osnovnih pravila pri autopsiji, zbog čega je cijeli istražiteljski tim prisiljen ostati u karanteni tijekom blagdana…

Dok Brennan, Goodman i Zack istražuju ostatke kostura iz Željeznog doba, Booth im donosi fotografije losangeleskog aerodroma na kojem su pronađeni ostaci neidentificiranog trupla. Brennan prekine forenzički rad na dobro očuvanom kosturu i putuje s Boothom u Los Angeles, gdje ih čeka komplicirana istraga. Naime, Brennan odmah zaključi kako će im istragu otežavati činjenica da je žrtva prošla niz plastičnih operacija na licu i grudima, a transformirala je čak i lubanju i tako potpuno promijenila svoj identitet. Riječ je o prostitutki čiji su silikoni u grudima prijavljeni kao ukradeni prije šest mjeseci, što istražitelje za početak vodi do plastičnog kirurga Kostova…

Carl Decker glavni je svjedok u istrazi protiv američke kompanije za koju tvrdi da svjesno šalje oštećeno oružje u Irak. Dok čeka svjedočenje, on ne sluti da mu je ubijena supruga Polina, a osmogodišnji sin Donovan otet. Booth i Brennan pitaju se osvećuje li se tužena američka tvrtka Carlu ili je posrijedi nešto sasvim drugo. Situaciju dodatno zakomplicira i pronalazak odgrizenog ljudskog uha u Polininim ustima, kao i izjava njezine sestre Marie, koja Carla smatra odgovornim za ubojstvo. Ubrzo izlazi na vidjelo da su Polina i Carl imali ozbiljnih bračnih problema. Kad sazna za nestanak sina, Carl odbije svjedočiti. U međuvremenu, Booth dobije paket s Donovanovim prstom pa istražitelji nakon forenzičke analize zaključe kako je dječak vjerojatno zatočen u napuštenoj benzinskoj postaji.

Booth i Brennan kreću u potragu za novim odgovorima kako bi riješili smrt obožavatelja stripova, pronađenog obučenog u super heroja. Prije dva mjeseca majka i očuh prijavili su nestanak tinejdžera, koji je sada i identificiran kao Warren Granger. Dok pretražuju njegov dom, istražitelji shvate kako je Warren napisao strip i osmislio vlastitog super junaka. Sljedeća im je postaja prodavaonica stripova, gdje ispituju voditelja poslovnice i upoznaju djevojku Abigail, za koju vjeruju kako je žrtvi bila više od prijateljice. Booth zaključi da su se tinejdžeri toliko uživjeli u svoje stripove da su pomiješali stvarnost i maštu. Kad stignu u kuglanu, u kojoj je Waren radio, i tamo upoznaju njezinog poslovođu Teda, najprije saznaju da je Waren bolovao od leukemije, a kasnije i cijelu, zapanjujuću istinu.

Booth i Brennan odlaze asistirati policajcima, koji su zaustavili automobil osumnjičenog Josea Vargasa u vašingtonskom predgrađu. Zadatak im je proučiti raspadnuto tijelo pronađeno u Joseovom prtljažniku. Nakon što Brennan upita gdje je tijelo bilo pokopano, započne pucnjava tijekom koje zaklon potraže svi osim Vargasa, koji nestane u noći. Uzorak rijetke biljke na žrtvinom tijelu vodi ih u gradski vrt, gdje pronađu još jedno zakopano tijelo. Dakle, riječ je o dvostrukom ubojstvu, a Vargas je odlučio ukloniti tijela pošto će javni vrt biti raskopan sljedeći tjedan. Istraga vodi Bootha i Brennan do jedne ulične bande i do samog vrha državne organizacije - senatora SAD-a.

Brennan i Zack započnu istragu o padu aviona ministarstva vanjskih poslova, koji je prevozio kineske diplomate. Nedaleko mjesta nesreće pronađu ostatke kostiju osobe koja nije putovala srušenim avionom. Iako Nacionalni odbor za sigurnost letenja utvrđuje kako je riječ o nesretnom slučaju, Brennan i Zack započnu detaljnu istragu koja uključuje i misteriozni skelet, za koji Jesse Kane misli kako bi mogao biti njegov otac, nestao prije pet godina. Otkriva se kako je žrtva najvjerojatnije bila smrznuta, raskomadana i pohranjena u šumu, a po starosti se zaista poklapa s Kaneovim ocem…

Brennan dogovara spoj na slijepo preko interneta, a Goodman je obavijesti o vrlo važnom zadatku koji je očekuje. Naime, pronađeno je mecima izrešetano tijelo, za koje istražitelji vjeruju kako pripada mafijaškom šefu, nestalom prije šest godina. Nedugo nakon toga, Booth informira tim o pronalasku još jednog tijela u napuštenom skladištu. Kasnije iste večeri, dok hoda prema restoranu u kojem je dogovorila spoj, Brennan za dlaku izbjegne mecima nepoznatog počinitelja. Booth je sada stavi pod svoj nadzor kako bi je zaštitio od daljnjih napada, ali kad krene uzeti piće iz frižidera, očekuje ga neugodno iznenađenje - vrata hladnjaka eksplodiraju, a on završi u bolnici.

Brennan, Booth i Zack spuštaju se niz ventilacijski otvor do tunela ispod vašingtonskih ulica, gdje su pronađeni ostaci tijela mlade žene. Primijetivši kako se među prisutnima nalazi i čovjek kojem tu nikako nije mjesto, Brennan ga pokuša uhvatiti, ali ovaj spretno umakne. Identifikacija leša u laboratoriju otkriva da se radi o autorici dokumentarnih filmova Marni Hunter, čiji je nestanak njen zaručnik prijavio prije desetak dana. Hunterova je radila na filmu o tunelima pod gradom i ljudima koji u njima žive, sukobivši se u procesu sa socijalnom radnicom Helen Bronson.

Brennanin rad u laboratoriju prekine hitan telefonski poziv - Angela je obavještava o nestanku svog dečka Kirka prije pet dana u pustinji. Osim toga, na trijemu lokalnog šerifa pronađen je ljudski kostur pa Brennan ne preostaje drugo no spremiti kofere i krenuti u pustinjsko područje Santa Fea, gdje joj se ubrzo pridruži i Booth. Identifikacija leša pokaže kako je riječ o muškarcu između trideset i trideset pet godina, a DNK analiza potvrdi njihove sumnje - riječ je o Kirku. Daljnja istraga vodi ih do šokantnih otkrića…

U mrtvačnici FBI-a forenzičari analiziraju tijelo Teda Macyja, žrtve utapanja nesretnim slučajem. Booth dovodi Brennan kako bi posebno istražila neobičnu kost Macyjevog prsta. Uz pomoć radioaktivnog ugljika u laboratoriju Brennan uspije odrediti starost prsta - ona iznosi tristo godina. Booth obznani kako je tijelo pronađeno na otoku koji legenda naziva domom zakopanog Blackbeardovog blaga te zajedno s Brennan kreće na misteriozno mjesto…

Brennan stiže u New Orleans pomoći u identifikaciji tijela, žrtava razornog uragana Katrina, ni ne sluteći da će postati glavna osumnjičena za ubojstvo. Po završetku napornog radnog dana u mrtvačnici, kad ostanu sami, dr. Leger pozove Brennan na spoj i ona mu odgovori da će razmisliti. Nakon toga nađe se u hotelskoj kupaonici kako leži na podu u lokvi vlastite krvi. Nema pojma što joj se dogodilo, a glavom joj prolaze zbunjujuće slike… Nakon pregleda u bolnici Brennan ispituje istražitelj Harding i ona mu govori kako je posljednja stvar koje se sjeća Legerov poziv na spoj u utorak navečer, a sada je četvrtak, što znači da se ne sjeća cijelog jednog dana.

Brennan, Booth i Angela stižu u washingtonsku bolnicu istražiti slučaj mlade Amy, oboljele od mezotelioma, karcinoma pluća iznimno rijetkog za njezinu dob. Najčešći uzročnik teške bolesti je azbest, ali istraga pokaže kako Amy nikad nije bila u dodiru s njim. Kad saznaju da je djevojka prošle godine slomila nogu te joj je ugrađen koštani transplantat, istražitelji dobivaju novu smjernicu u neobičnoj istrazi. Naime, na pomolu je razotkrivanje velike prijevare tvrtke koja prodaje transplantante. Iako je kompanija tvrdila kako je riječ o kosti dvadesetpetogodišnje donorice, biopsija pokaže kako je osoba koja je donirala kost bila u šezdesetima, a bolovala je od karcinoma. Povrh svega, čini se kako Amy nije njihova jedina žrtva. Počinje potraga za nepoznatim donorom i razotkrivanje strašne prijevare.

Na grobu vojnika poginulog u Iraku pronađeno je pougljenjeno truplo. Brennan i Booth dolaze na mjesto događaja i sreću Zacka. Pošto se pronalazak tijela poklopio s prvom godišnjicom smrti Charlieja Kenta, lokalne košarkaške zvijezde i volontera Nacionalne garde, koji je na putu za NBA ligu poslan u Irak, istražitelji pomisle kako je riječ o svojevrsnom protestu protiv rata. Identifikacija tijela pokaže da je riječ o Devonu Marshallu, bivšem članu Nacionalne garde i Kentovom suborcu iz Iraka. Slijedi opsežna istraga, a Bootha pri rješavanju misterioznog slučaja more i bolne uspomene iz prošlosti.

Dok napuštaju laboratorij, Booth i Brennan sretnu Davida Simmonsa, Brennaninu najnoviju simpatiju, no to je ne spriječi da se iznenada vrati u ured po ostavljene stvari. Tada primijeti digitalnu rekonstrukciju tijela Jane Doe na kojoj radi Angela. Brennan zahtijeva da se kostur i svi artefakti povezani sa slučajem dopreme u njezin ured. Među pristiglim stvarima ubrzo prepozna remen s kopčom u obliku dupina, identičan onome kakav je za života imala njezina majka. Kada otkrije da se pred njom zapravo nalaze ostaci njezine majke, koja je nestala prije petnaest godina, Brennan je prisiljena suočiti se s bolnom istinom o svojim roditeljima, koje, izgleda, uopće nije poznavala.