ภายใต้การปกป้องจากการโจมตีของเอเลี่ยนชั่วคราว ความสำคัญอันดับแรกของเจนเวย์คือการค้นหายานอีคิวน็อกซ์ หยุดการเรียกค่าไถ่ และช่วยเซเวนออฟไนน์กลับมา

เจนเวย์มอบหมายหน้าที่ให้ลูกเรือและเปิดประตูต้อนรับผู้มาเยือน หมายมั่นที่จะได้แลกเปลี่ยนวัฒนธรรมและได้มิตรภาพดีๆ จากด่านหน้าของอวกาศ

เมื่อยานของเธอติดอยู่กับพายุไอออน บีอีแลนนาบาดเจ็บ และเข้าสู่ภาวะโคม่า ระหว่างนั้นเธอเห็นนิมิตรว่าชาวคลิงกอนฆ่าเธอและลูกเรือของเธอ

ลูกเรือค้นพบที่ทิ้งขยะอวกาศใกล้กับเส้นทาง ต่อมาโวยาจเจอร์ที่ต้องการอุปกรณ์ต่างๆ ได้พบกับพ่อค้าผู้กระตือรือร้น

หลังกลับมาจากภารกิจ เดลต้า ฟลายเยอร์ลงจอด และทูวอคถูกลักลอบโจมตีโดยเอเลี่ยนที่ซ่อนตัวจากเผ่าอันตรายที่ชื่อว่า บาเนต

ยานโวยาจเจอร์ถูกดึงเข้าไปในขอบอวกาศย่อย เดินทางด้วยความเร็ว 200 ปีแสง จนกระทั่งถูกเผ่าทูเรย์ที่อ้างเป็นเจ้าของเขาวงกตดันออกมา

ยานโวยาจเจอร์พบกับแกรวิทัน อีลิปส์ ปรากฏการณ์อันตรายที่เกิดจากอวกาศย่อยและพบได้ยาก

เมื่อเซเวนออฟไนน์อัปเกรดเวิ้งชาร์จบอร์กของเธอขึ้นมาเพื่อดูดซับข้อมูลมหาศาล นำไปสู่ข้อกล่าวหาการสมรู้ร่วมคิดที่จะขึ้นมาบนยานโวยาจเจอร์

กลับมาที่โลก ร้อยโทบาร์เคลย์ใช้โฮโลแกรมเพื่อวางแผนเปิดการสื่อสารกับโวยาจเจอร์

ลูกเรือของโวยาจเจอร์เข้าร่วมในห้องสามมิติใหม่ล่าสุดของปารีส ซึ่งเป็นเมืองชายฝั่งของไอริชที่แสนสวยงาม ที่ซึ่งเจนเวย์และเจ้าของผับได้ใกล้ชิดกัน

ยานโวยาจเจอร์ติดอยู่ในวงโคจรเหนือดาวเคราะห์ประหลาดซึ่งเวลาผ่านไปเร็วกว่ากาแล็กซีรอบๆ หลายพันเท่า

มีเผ่าพันธุ์หนึ่งชื่นชมการร้องเพลงของหมอ และหมอคิดจะลาออกจากคณะกรรมการ เพื่ออยู่กับแฟนคลับมากมายของเขา

สมาชิกที่ออกไปทำภารกิจเริ่มฝันเกี่ยวกับเผ่าพันธุ์ที่พวกเขาไม่เคยพบมาก่อน เผ่าพันธุ์ที่ติดอยู่กับการต่อสู้โหดร้ายในดาวที่ไม่รู้จัก

เมื่อเซเวนออฟไนน์และทูวอคถูกลักพาตัวขณะที่ออกไปทำภารกิจ เซเวนถูกบังคับให้ต่อสู้ในการประลองที่อาจหมายถึงชีวิต

เด็กๆ ชาวบอร์กกลุ่มหนึ่งลักพาตัวชาโคเทย์ คิม นีลิกซ์ และปารีส

การกลับมาที่เมืองโฮโลกราฟิก แฟร์ ฮาเวน เป็นอันตรายสำหรับปาริส และ คิม เมื่อตัวละครในโปรแกรมเห็นสมาชิกลูกเรือของยานโวยาจเจอร์เป็นโปรแกรมที่ถูกดัดแปลง

ลูกเรือคนหนึ่ง ลินเซย์ บัลลาร์ด ที่เสียชีวิตในภารกิจ และได้รับพิธีศพในอวกาศเมื่อสามปีก่อน ปรากฏตัวอีกครั้ง

เซเวนออฟไนน์ควรจะยินดีเมื่อรู้ตำแหน่งของพ่อแม่ของ อิชเช็บแต่เธอกลับสงสัยเมื่อได้ยินเรื่องราวเหตุการณ์การประสานร่างเดิมของเขา

การประเมินประสิทธิภาพทั่วยานของเซเวนออฟไนน์ เธอให้ความสนใจไปที่กลุ่มลูกเรือสามคนที่ "แปลกแยก" ที่หลุดรอดสายตาไป

โจรฉลาดสามคนอ้างตัวเองว่าเป็น เจนเวย์ ชาโคเทย์ และทูวอคเพื่อทำการค้าทั่วทั้งควอแดรนท์ สร้างชื่อเสียให้กับยานโวยาจเจอร์

เมื่อคิมและบีอีแลนนานำยานเดลต้าฟลายเยอร์ออกไปค้นหาดิลิเธียม พวกเขาตกลงในดาวพรีวาร์ป ที่ซึ่งบีอีแลนนาพบกับนักกวีที่นั่น

เคซกลับมาที่โวยาจเจอร์ แก่ตัว โกรธ และมีพลังมากกว่าที่เคย เธอลอบเข้ามาในยาน และเดินทางย้อนเวลาเพื่อเปลี่ยนแปลงประวัติศาสตร์ของเธอ

โปรเจคสำรวจเส้นทางใช้งานพัลซาร์และแผงไมดัส ทำให้ยานโวยาจเจอร์ได้รับและตอบข้อมูลได้ทุกๆ 32 วัน

นีลิกซ์รู้สึกเป็นกังวลขึ้นมาเมื่อยานโวยาจเจอร์ปิดตัวลง ก่อนเข้าสู่เนบูลาขนาดใหญ่

เจนเวย์เห็นโอกาสที่จะขัดขวางพวกบอร์ก เมื่อเซเวนออฟไนน์อยู่ในโลกเสมือนที่ซึ่งร่างจะเป็นอิสระเป็นเวลาสั้นๆ