Voyager proplouvá vesmírným prázdnem, do kterého jedna rasa odhazuje svůj radioaktivní odpad a tím zabíjí místní obyvatele.

Při nehodě transportéru se z nanosond Sedmé, Doktorova mobilního emitoru a DNA jednoho člena posádky vytvoří borgský voják 29. století.

B'Elanna si spouští nebezpečné programy, u kterých má vypnuté bezpečnostní protokoly. Poprvé použijí Deltaplán.

Rasa 8472 si vytvoří duplikát velitelství Hvězdné flotily, aby se mohli lépe připravit na invazi na Zemi. Poprvé ve Voyageru se tu objeví zahradník Boothby. Chakotay políbí 8472 (i když dočasně v lidské podobě).

Patnáct let po ztroskotání a zničení Voyageru na ledové planetě se Kim s Chakotayem pokoušejí poslat zprávu zpět časem, aby opravili chybu z minulosti.

Sedmá se začne chovat, jako by v sobě měla několik odlišných bytostí. Původcem je borgská technologie, kterou se Voyager pokusí deaktivovat. Sedmá nazve Naomi "podjednotkou poručíka Wildmanové".

B'Elanna je napadena parazitem a jediný, kdo jí může pomoci, je holografický doktor, jehož program je založený na válečném zločinci, který své poznatky získával krutými pokusy.

Paris se pokusí na vlastní pěst zachránit vodní planetu, které hrozí destabilizace kvůli těžebním aktivitám jejího obyvatelstva. Za porušení Hlavní směrnice je poslán na 30 dní do cely a degradován.

Voyager prolétává prostorem rasy, jejíž vládcové nenávidí telepaty a trvají na prohlídce lodi.

Doktor objeví, že část jeho paměti byla vymazána, a rozhodne se zjistit proč.

Do simulátoru se dostanou fotonické bytosti, které považují Parisův program "Dobrodružství kapitána Protona" za skutečný, kdežto posádku Voyageru za iluzi. V simulátoru se rozpoutá válka a musí zasáhnou Arachnie.

Tom, Tuvok a Doktor havarují na planetě, kde čas plyne několikanásobně rychleji. K jídlu mají obrovské pavouky.

Bytost živící se kolem prolétajícími loďmi se pokouší nalákat Voyager na falešnou červí díru k Zemi. Jediné, na koho jeho trik nepůsobí, jsou Sedmá s Naomi.

Voyager prozkoumává borgskou kouli v naději že získá transwarpovou technologii, která by jim pomohla urychlit cestu domů. Sedmou kontaktuje borgská královna a nabídne jí, že nechá Voyager uniknout, pokud se Sedmá opět přidá ke kolektivu. Sedmá zůstane u Borgů.

K velkému překvapení Sedmé vezme Janewayová s Tuvokem a Tomem Deltaplán a jdou ji zachránit. Janeway prohlásí o borgské královně, že je irelevantní.

Harry se zamiluje do Tal, jejíž rasa žije na obrovské lodi, vedle níž Voyager vypadá jako hračka. Harry se nakazí a na velké lodi jsou lidé, kteří se od ní chtějí oddělit, což jejich tradice nedovolují.

Dvojníci posádky Voyageru, kteří vznikli na planetě Démon, zapomněli, že jsou kopie, a sami se vydali na cestu k Zemi. B'Elanna s Tomem se vezmou. Tedy vlastně jejich kopie.

Voyager je uvězněn v oblasti chaotického vesmíru a Chakotay začne mít halucinace, které jsou ve skutečnosti zprávami od cizí rasy.

Voyager je zachráněn před nepřátelskými nájezdy Kroužkem expertů. Cena je však vysoká: Sedmá má odejít z Voyageru a stát se členem kroužku. Neelix navrhne Janewayové, ať bere kofein pomocí hypospreje.

B'Elanna s Neelixem se přenesou na poškozenou malonskou loď, aby zabránili jejímu vybuchnutí, které by zničilo i Voyager. Na palubě lodi je však i Moloch.

Doktor se snaží Sedmou zasvětit do všech aspektů lidského chování a vybízí ji k prvnímu rande. Harry je opět zklamán, že není mezi favority. Romantická večeře skončí vykloubeným ramenem a zamilovaným Doktorem.

Během posledních hodin roku 2000 musí předek kapitána Janewayové, Shannon O'Donnellová, přesvědčit vlastníka posledního pozemku, který brání výstavbě Brány tisíciletí, aby stavbu umožnil.

Kapitán Braxton opakovaně vysílá Sedmou zpátky časem, aby objevila narušitele časového kontinua, který se skrývá na Voyageru v roce 2371.

Myslící bomba ovládne Doktora a chce, aby ji Voyager dopravil k planetě, která je jejím cílem. Dříve zde byla vojenská základna. Nyní už však její obyvatelé nejsou ve válce s tvůrci bomby.

Voyager objeví další loď Federace, U.S.S. Equinox, která byla stejně jako Voyager přenesena do Delta kvadrantu Ochráncem.