Voyager przybywa na pomoc walczącym gatunkom, gdy Kapitan Janeway zastanawia się nad decyzjami, które podjęła podczas ich pobytu w kwadrancie Delta i ich wynikach.

Wypadek transportera łączy niektóre nanoprobówki Borg z Siedmiu Of Nine z holo-emiter Doktora z 29-go wieku, by stworzyć super-Borg z XXI wieku.

Aby odzyskać sondę utkwioną w niebezpiecznej atmosferze, Tom Paris projektuje nowy typ wahadłowca o nazwie "Delta Flyer". Torres zaczyna przejawiać nierozważne zachowanie, angażując się w niebezpieczne programy z holodekami.

Załoga Voyagera odkrywa symulację Kwatery Głównej Gwiezdnej Floty, prowadzonej przez Gatunek 8472, wykorzystywaną do ćwiczenia ataku na Kwadrant Alfa. Przy pomocy zwykłych dawek leków, gatunki 8472 mogą zmieniać kształt w ludzką formę.

Podczas gdy Voyager wyszukuje załogę rozbitego Delta Flyer przewożącego Tuvok, Paris i chorąży Wildman, Neelixa musi zachować okupację Naomi. Kiedy zostanie odkryte, że Samantha jest ciężko ranny, musi zdecydować, ile powinien powiedzieć swojej córce.

Voyager korzysta z nowej technologii kwantowego przeplotu, aby dotrzeć do domu, ale błąd w obliczeniach powoduje, że statek rozbił się na lodowej planecie. Piętnaście lat później, jedyni ocaleni, Chakotay i Kim, kradną ulotkę Delta, próbując wysłać wiadomość w czasie i zapobiec katastrofie, jednak Geordi LaForge (z The Next Generation, ale teraz kapitan), który dowodzi Galaxy-class USS Challenger, jest zdeterminowany, aby zatrzymać je za wszelką cenę.-

Po spotkaniu się z technologią Borg znaną jako Vinculum, która łączy umysły dronów, Seven of Nine zaczyna pokazywać osobowości ludzi, które asymilowała jako członek kolektywu. Wkrótce stają się tak silne, że mogą przytłoczyć własną osobowość Seven.

Kiedy obcy przywiązuje się do układu nerwowego B'Elanny, Doktor korzysta z holograficznej rekreacji kardasjańskiego doktora Crella Mossetta. Odmawia leczenia, kiedy załoga Bajoran informuje ją, że ten lekarz był odpowiedzialny za sadystyczne zbrodnie wojenne podczas okupacji.

Kiedy Voyager napotka planetę w całości z wody, odkrywa, że pole siłowe zachowujące swoją integralność rozkłada się. Tom Paris bezpośrednio kwestionuje rozkazy, by ratować planetę, co powoduje, że zostaje zdegradowany do Ensign i umieszczony w brygu przez trzydzieści dni.

Podczas podróży przez przestrzeń Devore, kapitan Janeway musi ukryć wszystkich telepatów na pokładzie w zastoju transportera, ponieważ telepatia jest nielegalna zgodnie z prawem Dewora. Po tym, jak Voyager jest wielokrotnie przeszukiwany, prowadzący dochodzenie prosi o azyl i chce go usunąć.

Doktor odkrywa, że jego krótkoterminowa pamięć została zmieniona po usunięciu niektórych wydarzeń, dlatego rozpoczyna dochodzenie w sprawie kogo lub co może być odpowiedzialne. Kiedy zastawia pułapkę, a sprawca zostaje złapany, jest zszokowany tym, kim jest i dlaczego to robi.

Kiedy Tuvok, Paris i Doktor zostają wciągnięci na planetę dzięki intensywnej grawitacji i zderzeniu, czekają, aż zostaną uratowani. Z ich punktu widzenia minęło wiele tygodni bez kontaktu z Voyagerem, podczas gdy na pokładzie minęło zaledwie kilka godzin, gdy planowali próbę ratunku.

Odkrycie tunelu prowadzącego bezpośrednio na Ziemię cieszy ekipę nie do wiary, ale Siedem z Dziesięciu nie jest przekonany, że to jest rzeczywiste. Aby pomóc jej w jej podjęciu, rekrutuje Naomi Wildman, Doktora i kosmicznego pilota o imieniu Qatai, aby powstrzymać statek przed wejściem.

Data Gwiezdna: 52619.2 - Po pokonaniu statku Borg, Kapitan Janeway postanawia rzucić atak na inną uszkodzoną Sferę, aby wykraść cewkę trans-warp. Jednakże, kiedy załoga przygotowuje się do ich napadu, Królowa Borg jest potajemnie świadoma całego planu.

Bez pomocy medycznej Kim angażuje się w romans z członkiem gatunku Varo. Problemy pojawiają się, gdy po incydencie stają się biochemicznie współzależne.

Po zawiązaniu węzła przez Paris i Torres statek wraz z załogą zaczyna rozpadać się na poziomie molekularnym.

Po zawiązaniu węzła przez Paris i Torres statek wraz z załogą zaczyna rozpadać się na poziomie molekularnym.

Voyager wpada w zasadzkę w wyścigu znanym jako Hazari bez możliwości ucieczki. Wkrótce przybywa obcy "Think Tank" z odpowiedzią na problem statku, a wszyscy proszą w zamian o Seven of Nine.

Po napotkaniu uszkodzonego frachtowca Malon, ekipa remontowa z Voyagera próbuje powstrzymać wyciek toksycznej substancji chemicznej, który zagraża pobliskiej zamieszkałej planecie. Przed rozpoczęciem misji dwóch członków załogi statku ostrzega ich o "Aniele Zepsucia", który sieje spustoszenie na pokładzie statku.

Doktor próbuje wprowadzić Siedem Dziewięciu do pojęcia randek. Po katastrofalnej pierwszej randce Doktor osobiście prowadzi ją, ale wkrótce uświadamia sobie, że się w niej zakochuje.

Kapitan Janeway opowiada historię swojego dalekiego przodka Shannona O'Donnella podczas budowy Bramy Tysiąclecia na Ziemi podczas sylwestra w 1999 roku. Musi przekonać ostatniego właściciela lokalnego księgarni Henry'ego Janewaya, by zatwierdził plan.

Kiedy Voyager zostaje zniszczony, kapitan Braxton z 29-wiecznej teorii względności relacjonuje Siedem z dziewięciu, by cofnąć się w czasie i odkryć, kto zasadził "doczesny disruptor". Jednak musi to zrobić bez odkrycia przez przeszłość Janeway.

Po tym, jak Kim wysyła kosmiczny pocisk na pokładzie Voyagera, łączy się z systemami Doktora i prosi, aby pozwolono mu ukończyć misję masowej zagłady.

Voyager napotyka kolejny statek Federacji, Równonoc, dowodzony przez Kapitana Ransoma, który również został uprowadzony przez Strażnika. Jednak Doktor ujawnia straszną tajemnicę, a kapitan Ransom kradnie technologię Voyagera wraz z Seven of Nine i Doctor jako zakładnikami.