ยานโวยาจเจอร์ค้นพบทางออกในการต่อสู้กับผู้บุกรุกน่านอวกาศของบอร์ก ทั้งหมดที่เจนเวย์ขอคือการผ่านอาณาเขตอย่างปลอดภัยและเธอจะยอมแบ่งปันความรู้ให้

ร่างบอร์กที่ยานโวยาจเจอร์ช่วยจากคอลเลคทีฟ เซเวนออฟไนน์ แสดงปฏิกิริยาต่อต้านในขณะที่สำนึกความเป็นมนุษย์ของเธอพยายามสร้างตัวเองขึ้นมาใหม่

เมื่อวันหยุดของคลิงกอนที่เรียกว่าวันแห่งเกียรติมาถึง บีอีแลนนาตัดสินใจยอมรับต้นกำเนิดที่สืบทอดจากคลิงกอน และเข้าร่วมในพิธีกรรมทดสอบต่างๆ

ยานของผู้บังคับบัญชาชาโคเทย์หลงเข้าไปในแนวยิงของศัตรูและตกลงบนดาวเคราะห์ท่ามกลางสงคราม

ยานโวยาจเจอร์ได้รับสัญญาณขอความช่วยเหลือจากยานที่ได้รับความเสียหาย เมื่อรู้ว่าผู้รอดชีวิตคือโฮโลแกรม หมอจึงร่วมเดินทางไปกับบีอีแลนนาขึ้นยาน

เจนเวย์พยายามขอทางผ่านภูมิภาคอวกาศที่เป็นของเผ่าพันธ์เอเลี่ยนที่อันตรายและไม่ชอบคนแปลกหน้า

โรคประหลาดส่งผลกระทบต่อลูกเรือในยานโวยาจเจอร์ หมอและเซเวนออฟไนน์เปิดโปงทีมนักวิจัยเอเลี่ยนที่ทำการทดลองทางการแพทย์

ยานโวยาจเจอร์พบยานข้ามเวลาเครนิมที่ทำลายสิ่งมีชีวิตทุกสายพันธุ์จนสูญพันธ์โดยการเปลี่ยนเส้นเวลาปัจจุบัน

หนึ่งปีหลังจากพบกับยานข้ามเวลาเครนิม ยานโวยาจเจอร์ที่เสียหายพร้อมลูกเรือสเกเลตันนำกองบินรบระหว่างดวงดาวเพื่อต่อต้านเครนิม

ขณะที่เจนเวย์ใช้งานโปรแกรมห้องสามมิติดาวินซีของเธอ ยานโวยาจเจอร์ถูกนักขนส่งปล้น พวกมันขโมยทุกอย่างไปจากเครื่องประมวลผลคอมพิวเตอร์หลัก

นีลิกซ์พบกับประสบการณ์สั่นคลอนศรัทธา หลังจากที่เขาเสียชีวิตไปเกือบ 19 ชั่วโมง เขากลับฟื้นคืนชีพด้วยเทคโนโลยีบอร์กของเซเวนออฟไนน์

ลูกเรือของยานโวยาจเจอร์ถูกโจมตีด้วยฝันร้ายจากเอเลี่ยนสายพันธุ์ที่อยู่ในโลกความฝันเท่านั้น เหล่าลูกเรือติดกับอยู่ในความฝันร่วมกัน

ใช้เครือข่ายสื่อสารของเอเลี่ยน ยานโวยาจเจอร์ส่งหมอไปยังยานของสหพันธรัฐ ยานยูเอสเอส โพรมีธีอุส แต่สุดท้ายก็พบว่ายานถูกโรมิวลันยึดไปแล้ว

โวยาจเจอร์เริ่มได้ข่าวจากบ้าน ทั้งข่าวดีและข่าวร้าย พวกเขายังพบกับพวกไฮโรเจนที่วิถีชีวิตมีแต่การไล่ล่า และตอนนี้มันกำลังจับตามองยานโวยาจเจอร์อยู่

เมื่อช่วยเหลือไฮโรเจนที่บาดเจ็บ เจนเวย์พบว่าเหยื่อของเขา สมาชิกของชนเผ่า 8472 อยู่ในยานโวยาจเจอร์

เซเวนออฟไนน์อ้างว่าถูกนักค้าอาวุธรายหนึ่งโจมตี ผู้ที่เพิ่งขายเทคโนโลยีใหม่ให้กับยานโวยาจเจอร์

หลังจากยานโวยาจเจอร์ถูกพวกไฮโรเจนจับตัว ยานเปลี่ยนกลายเป็นห้องสามมิติขนาดใหญ่ เพื่อให้ไฮโรเจนได้ล่าสมาชิกของลูกเรือ

เจนเวย์และลูกเรือต้องเอายานโวยาจเจอร์กลับมาจากพวกไฮโรเจน

ทอม ปารีสที่เริ่มเบื่อหน่ายจากภารกิจในแต่ละวัน พบมิตรภาพใหม่เมื่อได้พบกับเอเลี่ยนที่พร้อมจะแบ่งปันการขับเคลื่อนยานโวยาจเจอร์ด้วยวิธีใหม่

เซนเซอร์ของยานโวยาจเจอร์ตรวจพบอนุภาคที่ทางทฤษฎีแล้วสามารถทำลายอวกาศย่อยและทำให้การเดินทางวาร์ปไม่สามารถทำได้

เอเลี่ยนสาวขอหลบภัยบนยานโวยาจเจอร์ เธอระบุว่าเธอเคยขึ้นยานมาแล้วเมื่อไม่นานนี้ และเธอกับชาโคเทย์รักกัน

เมื่อพบโมดูลสำรองของหมอ โปรแกรมของเขาจึงเปิดออนไลน์ขึ้นมาเป็นครั้งแรกหลังจากในรอบ 700 ปี

ด้วยความสิ้นหวังที่จะเติมแหล่งพลังงาน ยานโวยาจเจอร์ค้นหาสัญญาณดิวเทอเรียมได้บนดาวเคราะห์ประเภทวาย หรือเรียกอีกอย่างหนึ่ง "ดาวเคราะห์ประเภทปีศาจ"

การพบกับเนบิวลาที่อันตรายซึ่งไม่สามารถหลีกพ้นได้ส่งผลให้ลูกเรือทั้งหมดต้องเข้าห้องสเตซิส ทุกคนยกเว้นหมอและเซเวนออฟไนน์ที่ไม่ได้รับผลกระทบ

ล่ามเอเลี่ยนผู้มีชื่อว่า อาทูริส สามารถถอดรหัสข้อความของสตาร์ฟลีทที่ได้รับมาจากยานโวยาจเจอร์เมื่อห้าเดือนก่อนได้สำเร็จ