Die Voyager wird von den Kazon übernommen und die Crew auf einen Planeten in einem frühen Entwicklungsstadium zurückgelassen. Da nur Tom Paris und Lon Suder der Gefangennahme entgangen sind, liegt es an ihnen und dem MHN, einen Plan zur Rückeroberung des Schiffes zu schmieden. (Sternzeit: 50023,4)

Nachdem Tuvok durch eine verdrängte Erinnerung krank geworden zu sein scheint, muss er sich mit Captain Janeway verschmelzen, um zu überleben. Die Verschmelzung bringt sie zurück in die Zeit, als Tuvok ein junger wissenschaftlicher Offizier an Bord der U.S.S. Excelsior unter dem Kommando von Kapitän Hikaru Sulu war. (Sternzeit: 50126,4)

Paris und Kim werden in ein akritisches Gefängnis gebracht, nachdem sie eines terroristischen Bombenanschlags beschuldigt wurden. (Sternzeit: 50156,2)

Die Voyager trifft auf eine Region im Weltraum, die einer mysteriösen außerirdischen Rasse gehört, für die zu umfliegen es 15 Monate dauern würde. Beim Überschreiten der Grenzen hängt sich ein Schwarm von Schiffen an der Hülle der Voyager - eine Handlung, die die Schiffsstromversorgung erschöpft und die Voyager zu zerstören droht. (Sternzeit: 50252,3)

Die Voyager findet zwei Ferengi, die sich als Götter in einer Bronzezeitkultur ausgeben. Es stellt sich heraus, dass sie durch das Barzan-Wurmloch angekommen waren, welches zurück zum Alpha-Quadranten führt. Das Delta-Quadranten-Ende ist jedoch sehr instabil und bewegt sich ständig. (Sternzeit: 50074,3)

Nach der Begegnung der Voyager mit einer telepathischen Spezies hat B'Elanna mit intensiven Träumen zu kämpfen, die das Leben einer Frau und ihres Geliebten in einer Zeit großer politischer und sozialer Umbrüche darstellen. (Sternzeit: 50203,1)

Captain Janeway muss sich einem strengen Ritual unterziehen, um Kes Leben zu retten, als sie bewusstlos ist. (Sternzeit: 50063,2)

Sowohl die Voyager als auch ein Föderationsschiff aus dem 29. Jahrhundert, die Aeon, werden in das späte 20. Jahrhundert zurück auf die Erde gezogen. Das Zeitschiff Aeon stürzt in Arizona in den 1960er Jahren ab, während die Voyager 1996 im Orbit um die Erde erscheint.

Bei dem Versuch, Paris und Tuvok zu retten, werden Torres und Chakotay von einer Gruppe Waffenschmuggler gefangen genommen, die glauben, sie seien von der Regierung. (Sternzeit: 50312,5)

Ein verletzter Außerirdischer namens Tieran überträgt sein Bewusstsein in Kes, Momente bevor er stirbt. Er erlangt die Kontrolle über sie und nutzt ihre Fähigkeiten, um ein Shuttle zu stehlen, in seine Heimatwelt zurückzukehren und einen politischen Coup zu versuchen. (Sternzeit: 50348,1)

Die Voyager trifft auf mehrere Supernova in einer kleinen Region. Es stellt sich heraus, dass es sich um die Nachwirkungen eines Bürgerkriegs im Q-Continuum handelt. Q erscheint und glaubt, dass die Lösung des Problems darin besteht, dass er ein Kind hervorbringt. Seine Auserwählte zu diesem Zweck ist Captain Janeway. Die Dinge werden noch komplizierter, als eine eifersüchtige weibliche Q erscheint, die behauptet, Q sei ihr Freund. (Sternzeit: 50384,2)

Nach der Rückkehr von einer Erstkontaktmission müssen Janeway, Neelix und der Doktor die Voyager von einem Befall mit Mikroorganismen, die eine alarmierende Größe erreichen, befreien.

Die Voyager trifft auf eine Raumregion namens Nekrit Ausdehnung. Da Neelix ab diesem Punkt kein Wissen über den Weltraum hat, versucht er, sich für die Crew nützlich zu machen, indem er versucht, eine Karte von einem alten Freund namens Wixiban zu erhalten. Der missbraucht Neelix aber als Kurier für illegale Substanzen.

Fähnrich Kim bittet Tuvok, ihm vulkanische emotionale Steuerungstechniken beizubringen, als er sich in eine Holodeck-Figur namens Marayna verliebt. Kim wird schnell eifersüchtig, als Marayna versucht Tuvok zu verführen. (Sternzeit: 50460,3)

Captain Janeway stirbt wiederholt, nachdem sie und Chakotay auf einen Planeten gestürzt in eine Zeitschleife sind. Bald erscheint ihr verstorbener Vater und sagt ihr, dass sie tot ist, ihre Situation akzeptieren und weitergehen muss. (Sternzeit: 50518,6)

Fähnrich Vorik drückt seinen Wunsch aus, sich während seines Pon-Farr mit B'Elanna zu paaren. Nachdem sie sich deshalb gestritten haben, zeigt Torres selbst Anzeichen des Pon-Farr. (Sternzeit: 50537,2)

Während einer Aussenmission entdeckt Chakotay eine Signatur der Föderation, die von einem außerirdischen Planeten kommt. Nachdem er gelandet ist und angegriffen wird, erfährt er, dass nicht alles so friedlich ist wie es zunächst scheint. Seine Retter waren hinsichtlich ihrer wahren Herkunft nicht ganz ehrlich. (Sternzeit: 50614,2)

Als der Doktor versucht, seine Persönlichkeit durch Einbeziehung der psychologischen Profile berühmter und historischer Menschen zu verbessern, wird er von ihren Schattenseiten überwältigt und zeigt Anzeichen einer gespaltenen, bösartigen Persönlichkeit. Kes bittet darum, die Voyager zu verlassen, als sie auf eine Rasse mit weitreichenden Kenntnissen der Raumregion stoßen, die sie gerade erkunden. (Sternzeit: 50693,2)

Neelix und Tuvok befinden sich auf einer Aussenmission, um einen Planeten zu evakuieren, der mit Asteroiden beschossen wird. Neelix stößt dabei an seine Grenzen, Tuvoks Haltung ihm gegenüber zu ertragen.

Kes reist vom Moment ihres Todes an rückwärts durch die Zeit. Mit jedem Sprung nähert sie sich einer Lösung, sie wird jedoch auch immer jünger und jünger. (Sternzeit: 50973)

Der Arzt beschließt, eine holografische Familie zu gründen, um sich zu erweitern. Als B'Elanna von unrealistischen Perfektionismus dieser Familie angewidert wird, ändert sie das Programm, um zufällige, interessante und verheerende Ereignisse hinzuzufügen. (Sternzeit: 50863,2)

Ein außerirdischer Paläontologe entdeckt eine gemeinsame Verbindung zwischen seinen Leuten und den Menschen. Er glaubt, dass dies beweist, dass sich sein Volk (die Voth) vor Millionen von Jahren auf der Erde entwickelt hat und in den Delta-Quadranten ausgewandert ist. Seine Regierung ist aber nicht bereit, seiner Interpretation der Beweise zu glauben.

Besatzungsmitglieder werden nach und nach durch Personen eines unbekannten Volkes ersetzt. (Sternzeit: 50912,4)

B'Elanna Torres entdeckt ein Holodeck-Programm, bei dem Chakotay und der Maquis gegen Janeway rebellieren. (Sternzeit: 50953,4)

Die Voyager erreicht den Borg-Raum, nur um eine Bedrohung zu entdecken, die stärker ist als die Borg selbst. (Sternzeit: 50984,3)