Nakon što otkriju kamion Ford 1936. koji pluta u svemiru, posada počinje istraživati i pronalazi komore sa zamrznutim otetim Zemljanima, među ostalima i Ameliju Earhart i njezina navigatora.

Kad za vrijeme uzbune aktiviraju doktora, on na brodu nalazi samo B'Elannu Torres i ozlijeđenu kapetanicu. Uskoro se pojavi poručnik Barclay i kaže mu da je sve to holosimulacija i da mora uništiti warp jezgru Voyagera kako bi prekinuo program...

Kes ulazi u životnu fazu elogium, jedino vrijeme u životu kad može imati djecu.

Harry Kim ustaje jedno jutro i shvaća da je opet u San Franciscu sa svojom djevojkom Libby. Da bi se vratio u zbilju, traži pomoć sumnjiva tipa koji se zove Tom Paris i nema pojma tko je Harry.

Prsten prostorne distorzije mijenja unutrašnjost Voyagera. Posada ne može više doći do vitalnih dijelova broda, a kapetanica je ozlijeđena u kontaktu s anomalijom...

Neelix i Paris zarobljeni su na planetu poznatom kao Pakleni planet. Ondje postaju nevoljki roditelji tuđinskog djeteta koje je na rubu smrti.

Posada pada u katatonično stanje, nakon što se likovi iz holodeka pojave u stvarnosti, pošteđeni su samo doktor i kes, utrka za spas posade od sigurne smrti je u njihovim rukama.

Chakotay na planetu otkriva kulturološki simbol kojim su se njegovi preci koristili da izliječe zemlju. Nakon toga on pokušava stupiti u kontakt s bićima koja je njegovo pleme zvalo Duhovi neba.

Kad se Kes upoznaje s potomcima Ocampa koji su svoj svijet napustili prije 300 godina, njezine mentalne sposobnosti rastu do točke kad ih više ne može kontrolirati i u tom procesu zamalo ubije Tuvoka.

Voyager nailazi na trag federacijske sonde, Kazon-Nistrum napadaju i kradu tehnologiju za teleportaciju. Chakotay to protumači kao osobni napad i tada je uhvaćen.

Tuvok i B'Elanna su uhvaćeni i bačeni u zatvor nakon misije na kojoj su pokušali obnoviti zalihe za rad Voyagera. Kapetanicu Janeway udare tako da pada u nesvijest, a spašava je čovjek koji misli da mu je ona kći.

Nakon što je našla i popravila robota koji je plutao svemirom, B'Elannu otimaju i prisiljavaju da napravi novi prototip ili će Voyager biti uništen.

Kako bi prekinula napade Kazona, kapetanica Janeway je prisiljena ući u savez s moćnom kazonskom sektom. Ali pregovori propadaju i ona se okreće Trabima, rasi koja je nekada Kazone držala kao robove.

Tom Paris evoluira u viši organizam nakon što je doživio warp 10 u eksperimentalnom šatlu.

Da bi pomogao Lonu Suderu, psihopatu koji je ubio člana posade, Tuvok se priprema za spajanje mozgova. Ubrzo nakon toga postaje nasilan, a i počinje gubiti kontrolu.

Voyager sreće kardasijski brod Dreadnought koji dolazi uništiti planet s milijunima stanovnika. B'Elanna će učiniti sve da ga razoruža.

Samoubojstvu sklon Q prijeti da će uništiti Q-kontinuum nakon što traži azil na Voyageru.

Doktor prima vidijskog pacijenta koji umire od faga i njegovu svijest prebaci u brodski kompjutor. Tako stvori hologramski lik u koji se zaljubi.

Nakon mnogo tjedana neobična ponašanja Tom Paris napušta Voyager i pridružuje se talaksijskom konvoju.

Nesreća u oblaku plazme duplicira Voyager. Nakon što brod napadnu Vidiiansi, brod je teško oštećen, a Harry Kim nestaje u svemiru kroz otvor u trupu broda.

Kad Tuvok padne brodom na mjesec, otkriva troje male djece koja vjeruju da će umrijeti.

Posada Voyagera stiže na planet koji je nedavno ušao u ledeno doba. Ondje otkrivaju i nekoliko komora za stazu u kojoj su osobe misaono povezane s umjetnim okolišem.

Zbog nesreće na transporteru Tuvok i Neelix se spajaju u jedno biće koje sebe naziva Tuvix.

Kapetanica Janeway i Chakotay zaraženi su neizlječivim virusom i ostavljeni na planetu koji ih štiti od posljedica bolesti. Dok Janeway traži lijek, stvara dublju vezu sa svojim prvim časnikom. Tuvok se na Voyageru suočava sa stanjem koje je sve bliže pobuni.

Voyager prima poziv upomoć od Seske koja tvrdi da joj Maj Culluh želi oduzeti dijete za koje kaže da je Chakotayevo. Chakotay je skeptičan, ali ne želi napustiti dijete koje je možda njegovo.