La Voyager insegue una stranissima scia di... ruggine nello spazio e ne raggiunge la fonte, che tra l'altro emette anche una sostanza che sembra essere in tutto e per tutto benzina! Lo strano oggetto viene visualizzato sullo schermo e, al momento di ingrandirlo per vedere bene di cosa si tratta, l'equipaggio di plancia resta a bocca aperta: alla deriva nello spazio c'è un... camioncino! Un Ford del 1936, come specifica Paris, appassionato di veicoli antichi. Il camioncino è completo di residui di letame, motore funzionante e una radio... Le sorprese non sembrano affatto finite, quando, girando la sintonia della radiolina gli uomini della Voyager registrano un segnale che si rivela un antico S.O.S. che proviene da un pianeta poco lontano da lì...

Il comandante Chakotay ha avuto il permesso dal capitano Janeway di prendere una navetta, per allontanarsi dalla Voyager temporaneamente. Deve infatti eseguire un rituale che necessita di assoluta solitudine, per commemorare il giorno in cui suo padre è morto. Non sa, però, che quella regione di spazio è sorvegliata dai Kazon Ogla, che non accettano intrusi. Il giovane Kaar viene mandato a distruggere la navetta, in quella che sarà la sua prima missione, quella in cui dovrà dimostrare il suo valore per meritarsi il nome di Ogla! Purtroppo l'abilità di Chakotay mette fine in breve tempo alla battaglia ingaggiata dal ragazzo danneggiando irreparabilmente i motori della navetta avversaria e, prima che questa esploda, il comandante della Voyager teletrasporta in salvo il ragazzo. Kaar però non è per niente grato del gesto, e anzi, chiede a Chakotay di ucciderlo prima che i suoi possano riprenderlo...

Sulla Voyager scatta l'allarme rosso, e immediatamente viene attivato il dottore olografico, che chiede al computer quale sia la ragione dell'emergenza; il computer gli risponde che il capitano e l'intero equipaggio non sono presenti a bordo. Inoltre la nave è in condizioni precarie: è attiva solo l'energia d'emergenza, non ci sono scudi, le comunicazioni non sono operative e vi sono delle falle in diversi ponti. Sembra che Janeway abbia dovuto far abbandonare la nave, o almeno questo è quello che risulta dal frammento, piuttosto disturbato, della registrazione che il capitano ha lasciato negli archivi...

Mentre Neelix e Kes bisticciano ancora una volta per la gelosia di lui, sulla plancia viene registrata una nuvola di minuscole forme di vita che sembrano sospese nello spazio come in una bolla. Janeway decide di investigare e fa avvicinare la nave, riducendo la velocità. Kes, nel frattempo, è andata a curare le piante di insalata che servono a Neelix per cucinare, e, senza neanche rendersene conto, comincia a mangiucchiare gli insetti parassiti che aveva con cura eliminato dalle foglie. La sua fame continua ad aumentare in maniera spropositata, suscitando anche la preoccupazione di Neelix, che trova disgustosi i cibi di Kes.

Kim si sta risvegliando da un sogno agitato... e scopre di essere sulla Terra. In casa sua, con la sua ragazza a fianco, pronto per andare ad un appuntamento. Non si tratta di una simulazione sul ponte ologrammi, né di una ricostruzione di qualche alieno curioso: Kim si trova sulla Terra al posto del suo amico Danny. E' stato quest'ultimo a imbarcarsi sulla Voyager e ad essere dato per disperso. Il funerale commemorativo è passato da soli due mesi, eppure Kim non riesce ancora a credere ai suoi occhi. San Francisco è la città che si ricordava, niente sembra fuori posto, tranne lui stesso e alcune delle persone che dicono di conoscerlo, ma che lui non ricorda affatto, come il gestore di uno dei bar vicino casa, che vuole da lui il modellino della nave che ha progettato, per esporlo con orgoglio nella sua vetrina!

Kes viene invitata ad una festa a sorpresa per il suo compleanno... L'equipaggio si è riunito infatti sul ponte ologrammi, nella ricostruzione del bar francese caro a Paris, intorno al tavolo da biliardo. Tra i festeggianti c'è anche il dottore olografico, che per l'occasione ha vestito i panni del barista. Manca solo Kim, di turno in plancia con Tuvok. Mentre alla festa tutti si stanno divertendo, i due ufficiali registrano un'anomalia spaziale proprio di fronte a loro e, quando Tuvok ne fa rapporto a Janeway, una strana eco si fa strada nel sistema di comunicazione, un'eco che continua a ripetizione, interrompendosi poi spontaneamente. Il fenomeno spaziale sembra essere la causa del guasto e presenta un pericolo per l'intera nave. Infatti lo spazio sta letteralmente cambiando forma ed è meglio allontanarsi da lì in fretta...

Kes sta affrontando con Paris una simulazione sul ponte ologrammi. La giovane Ocampa vuole infatti imparare a manovrare una navetta e il timoniere della Voyager le ha preparato uno scenario abbastanza complicato. Neelix nota i due che escono dal ponte ologrammi e ha un moto di stizza, dettato ancora una volta dalla sua inguaribile gelosia. Nel frattempo Janeway riceve il rapporto di Chakotay su un pianeta di classe M che potrebbe salvare le loro riserve di cibo, drasticamente ridotte visto che da settimane non vengono rinnovate. Il pianeta, però, oltre a trovarsi piuttosto lontano dalla loro rotta, ha anche alcune particolarità: è coperto di nubi molto cariche elettromagneticamente, e i sensori non riescono a distinguere se gli aminoacidi presenti appartengano a flora o fauna. Gli esperti della cartografia stellare lo hanno già soprannominato 'Pianeta Inferno', ma forse è l'unica speranza di sopravvivenza per l'equipaggio!

Janeway è richiesta dappertutto sulla nave: Paris le chiede di poter dare un'occhiata con lei ad un'anomalia spaziale; Neelix vuole parlarle degli abitanti del settore di spazio che stanno per attraversare; in sala macchine è richiesta la sua presenza per un esperimento critico che forse permetterà al dottore olografico di muoversi liberamente per la nave, con l'esclusione soltanto di alcuni settori... Purtroppo appena il dottore viene trasferito in sala macchine la sua dimensione diminuisce fino a farlo apparire di pochi centimetri di altezza. Janeway non può però aspettare che Kim e B'Elanna facciano le necessarie modifiche per rimediare al problema, perché viene chiamata da Tuvok per un'urgente supervisione delle procedure di sicurezza. Prima che il capitano possa allontanarsi, però, il dottore la richiama e le ordina tassativamente di... prendersi un po' di riposo, nel romanzo che ha programmato sul ponte ologrammi! Ben presto, però, l'immaginazione dell'equipaggio prende vita e persone lontane anni luce appaiono sulla Voyager...

Durante la ricognizione su un pianeta dove potrebbero esserci depositi di minerale utili alla Voyager, la squadra di ricognizione scopre un segno che Chakotay ha visto decine di anni prima. Il segno è una benedizione alla terra, un chamusi di guarigione lasciato dopo averla violata con un fuoco... almeno così il padre di Chakotay gli aveva detto durante una delle ricognizioni nella giungla terrestre, quando il giovane seguiva malvolentieri gli insegnamenti della propria tribù, decidendo alla fine di lasciarla per seguire la strada delle stelle. Un segno che in seguito alla morte del padre, Chakotay porta con sé, inciso su una delle sue pietre meditative. Il segno è proprio lo stesso e, una volta tornato a bordo, Chakotay spiega l'identità a Janeway, che acconsente ad indagare sull'origine della strana coincidenza.

Dieci mesi dopo l'incontro con il Guardiano, Tuvok è impegnato a sondare la mente di Kes, che da tempo ha dato segni di essere molto sensibile. Kes infatti vorrebbe imparare a controllare e a 'sintonizzare' meglio le sue capacità. Le lezioni di Tuvok, però, la fanno arrivare tardi ai suoi appuntamenti in infermeria e il dottore non ne è molto contento. Questa volta, però, non c'è tempo di discutere del ritardo: la pietra in cui il Guardiano si è trasformato morendo emette strane vibrazioni e suoni molto acuti. Analizzando la pietra, il dottore scopre dei segni vitali, che però vanno e vengono e non sembrano interni alla pietra stessa o ai residui organici in essa contenuti: i segni vitali sono la risonanza di segnali provenienti dall'esterno, forse dall'altro essere simile al Guardiano che vaga nel Quadrante Delta!

La Voyager riceve uno strano segnale, che sembra provenire da una boa spaziale che trasmette su una frequenza Federale. La prospettiva che qualcuno dal Quadrante Alfa sia riuscito a trovarli è attraente, ma Janeway vuole comunque vedere di persona la boa prima di crederci e ordina di dirigere la nave sulle sue coordinate. Purtroppo la boa si trova all'interno di una nebulosa... dalla quale sbuca una nave Kazon che senza indugi attacca la Voyager, creando un buco negli scudi, attraverso il quale una piccola capsula riesce ad entrare nella stiva di carico della nave. La squadra d'assalto Kazon ha abbordato la Voyager, ma viene fermata dalla sicurezza. Purtroppo però l'abbordaggio nella stiva di carico era solo un diversivo perché un paio di Kazon riuscissero a rubare un modulo di teletrasporto e se ne andassero indisturbati. I codici delle frequenze federali, il modo di attaccare la Voyager, il luogo dove prelevare il modulo di teletrasporto... tutto è stato comunicato ai Kazon da Seska, che adesso sta riprendendo il suo reale aspetto cardassiano e sta collaborando con i suoi nuovi alleati!

Una squadra di uomini della Voyager si trova sul pianeta dei Mokra per raccogliere del plasma per riattivare i motori, ma viene brutalmente fermata dalle forze dell'ordine locali, soldati corazzati che stordiscono Janeway e catturano B'Elanna e Tuvok. Neelix riesce a portare il plasma sulla nave nonostante l'agitazione e con Chakotay prende contatto con il leader del pianeta per chiedere che fine abbiano fatto gli altri membri della squadra. Nel frattempo B'Elanna e Tuvok vengono rinchiusi in una cella e Janeway viene aiutata da un vecchio abitante del pianeta che sembra soffrire di un qualche tipo di illusione psicologica, perché la chiama Rokana e crede che le sue siano storie immaginarie...

A bordo della Voyager viene teletrasportato un androide che viaggiava nello spazio, completamente alla deriva. B'Elanna e Kim si mettono subito al lavoro per cercare di riparare la fonte energetica che lo mantiene attivo, anche se a livelli minimi. Riescono a modificare la matrice energetica del misterioso androide per farla funzionare con l'energia della nave, ma se i due non riusciranno a riparare il modulo energetico l'essere artificiale potrebbe perdere del tutto la capacità di funzionare. Il fatto che l'androide sembri assolutamente incapace di comunicare o anche di capire dove si trovi non impedisce a B'Elanna di tentare di tutto... persino chiedere un parere medico al dottore olografico. Nel momento in cui, finalmente, B'Elanna riesce a rimettere in circolo l'energia, l'androide si identifica come 'unità automatica numero 3947', ringrazia il capo ingegnere della Voyager e racconta di essere sopravvissuto ad un incidente avvenuto a bordo di una navetta lanciata dalla nave appoggio su cui opera... una nave che appartiene ad una civiltà completamente formata da androidi!

Dopo aver subito un pesantissimo attacco da parte dei Kazon, la Voyager riesce a sfuggire a stento. Un membro dell'equipaggio muore a causa di gravissime ferite interne e la vita di bordo viene sconvolta ancora una volta dall'evento. L'attacco è solo l'ultimo di una lunga serie, e vi sono stati altri due morti tra l'equipaggio. I danni alla nave sono così profondi che riavere la velocità a curvatura sarà un miracolo... forse non è più il caso di seguire i principi di comportamento della Flotta Stellare, ma è ora di comportarsi come i Maquis, cercando le possibilità di sopravvivenza senza andare troppo per il sottile. Forse è ora di formare un'alleanza, senza dare a una fazione Kazon la tecnologia federale, ma promettendo loro protezione in caso di attacchi di altre fazioni. Questo va contro tutti i principi in cui Janeway crede, ma probabilmente laggiù, a settantamila anni luce dalla Federazione, il capitano della Voyager dovrebbe pensare più al suo equipaggio che ai principi...

Tom Paris sta sperimentando l'implementazione della velocità transcurvatura su una delle navette della Voyager, ma qualcosa va storto: la gondola non regge lo stress strutturale, il campo si rompe poco dopo aver superato il limite e... la simulazione nel ponte ologrammi si interrompe. Kim e B'Elanna annunciano a Tom la sua morte e il povero pilota si guarda intorno sconsolato... un altro fallimento! Purtroppo il progetto di sperimentare la transcurvatura sta procedendo a rilento, nonostante la scoperta, in un campo di asteroidi che la Voyager ha appena passato, di un nuovo tipo di cristallo di dilitio che rimane stabile a frequenze di curvatura ben più alte di quelle consuete. Il fatto è che oltrepassare il limite della transcurvatura significherebbe viaggiare a velocità infinita, occupando simultaneamente tutti i punti dell'universo, e questa è un'impossibilità fisica. Purtroppo anche riuscire a raggiungere il limite sembra impossibile, visto che tutte le volte la gondola della navetta viene spezzata dall'intenso campo...

Mentre Tuvok è in mensa a mangiare tranquillo, Neelix gli si avvicina per tentare di tirarlo un po' su. Agli occhi del Talaxiano, infatti, Tuvok è sempre troppo serio, e dovrebbe distrarsi un po' dal lavoro. Perché non approfittare della festività del Kal Rekk? Tuvok fa notare che la giornata di festa è prevista fra due settimane, e allora Neelix tenta con un'altra occasione gioiosa di Vulcano: il Rumarie. Tuvok però è veloce nel notare che la festa non si tiene da oltre un millennio e che comunque non parteciperebbe ad una celebrazione che prevede che i Vulcaniani, vestiti succintamente e ricoperti di grasso Rillano, si rincorrano per acchiapparsi! Una chiamata dalla sala macchine interrompe la conversazione: Tuvok deve prendere i primi rilievi in uno dei condotti di plasma dove è stato trovato il corpo di un uomo dell'equipaggio, corpo che si sarebbe di certo carbonizzato se il circuito avesse funzionato a dovere. La cosa peggiore è che l'autopsia conferma che l'uomo è stato messo nel condotto dopo la morte, causata da un pesante colpo alla nuca... questo significa che c'è un assassino a bordo!

Scegliere il nome per un bambino che deve nascere è sempre difficile e nell'infermeria della Voyager ci stanno pensando in tre: il dottore, Kes e la guardiamarina incinta il cui figlio nascerà fra breve. La scelta del nome non riguarda solo il bambino, ma anche il dottore stesso, che sembra non decidersi mai. Nel frattempo vengono trovati dei frammenti metallici alla deriva, che appartengono ad una nave che ha subito un pesante attacco ed è stata distrutta da una particolare arma Cardassiana. Subito Janeway pensa che la perfida Seska possa esserne la causa, ma Torres la corregge: è sua la colpa di ciò che è successo. La nave è stata distrutta da un missile-sonda pesantemente armato e capace di aggirare qualunque tipo di difesa, capace di distruggere piccole lune e lanciato dai Cardassiani contro i Maquis. Mentre ancora erano nel Quadrante Alfa, Chakotay e Torres erano riusciti a riprogrammarlo per farlo esplodere in uno degli Avamposti Cardassiani vicini alle Badlands, ma evidentemente il missile-sonda era stato catturato dal Custode proprio come Voyager e trasportato nel Quadrante Delta... dove adesso sta portando distruzione e morte.

La Voyager, nella sua rotta verso il Quadrante Alfa, incrocia il percorso di una cometa molto particolare, che non ha le caratteristiche di alcun astro conosciuto, eppure l'apparenza è proprio quella di un asteroide vagante nello spazio. Per studiare il fenomeno, Janeway dà ordine di teletrasportare a bordo un frammento di nucleo all'interno di un campo di sicurezza. Torres si porta subito nella sala teletrasporto e aziona personalmente i comandi... con sua grande sorpresa si materializza a bordo qualcuno che ha tutto l'aspetto di un normale essere umano, con indosso un'uniforme della Flotta e che ha la capacità di attraversare come niente il campo di forza. Con un largo sorriso sulle labbra lo strano essere si presenta a Torres: 'Salve, il mio nome è Q!'

La Voyager riceve una chiamata di soccorso da una piccola nave Vidiana con a bordo una donna che non risponde alle richieste di Janeway. Forse è troppo malata per rispondere e, visto che non ci sono altre navi nelle vicinanze e quindi non dovrebbe trattarsi di una trappola, Janeway decide di offrire assistenza alla donna e la fa teletrasportare direttamente in infermeria. Qui il dottore scopre che un impianto di biocircuiti molto complesso inserito nel lobo parietale ha immagazzinati i dati cerebrali della donna, ma il circuito stesso è collegato a tessuti ormai morti o talmente danneggiati dalla fagia da essere totalmente inerti. Non potendo rigenerare i nervi e i tessuti cerebrali, il dottore decide di immagazzinare i dati del biocircuito nel buffer della matrice olografica presente in infermeria in modo da creare un corpo olografico dove immagazzinare i dati stessi. In questo modo potrà essere possibile comunicare con la donna e trovare una soluzione.

Samantha, la guardiamarina incinta di Voyager, sta per avere il bambino che aspettava... e l'intero equipaggio si trasforma in un padre apprensivo. In plancia tutti, a cominciare da Chakotay, sono nervosi e in attesa. Dopo sette lunghe ore ancora non ci sono notizie, ma gli ufficiali superiori devono smettere di pensare al'imminente nascita: i sensori a lungo raggio registrano due navi Vidiane sulla rotta, e il sistema solare vicino ha due pianeti abitati completamente da Vidiani. La Voyager sta entrando nel territorio dei terribili ladri di organi! Per evitare l'incontro, la nave federale entra in un campo di plasma che dovrebbe bloccare i sensori Vidiani. Nello stesso momento, in infermeria, una complicazione nel parto induce il dottore ad usare il teletrasporto... e in pochi secondi la bambina Ketariana-Umana nasce! I guai non sono però finiti, visto che l'ingresso nel campo di plasma ha causato uno sbilanciamento nei motori, e in sala macchine esplodono due condotti di plasma. L'infermeria si comincia a riempire di feriti, mentre l'energia ausiliare riesce appena a mantenere attivi gli apparecchi...

Durante una ricognizione, una delle navette della Voyager è precipitata su una luna disabitata. Il Guardiamarina Bennets, che accompagnava Tuvok, è morto nell'incidente e il vulcaniano si trova d'improvviso faccia a faccia con Tressa, una bambina che gli racconta di essere precipitata sulla luna proprio come lui. Insieme a Tressa ci sono altri due bambini, unici sopravvissuti dell'equipaggio della nave su cui viaggiavano e che adesso sono soli e indifesi. Nel frattempo, il Capitano Janeway sta per effettuare un primo contatto con il leader del pianeta attorno a cui orbita la luna.

La Voyager si è avvicinata ad un pianeta con una ricca rete di satelliti di comunicazione, che però non funziona affatto. Neelix si stupisce, visto che quel pianeta, qualche tempo prima, era un punto di riferimento importantissimo in quell'area di spazio. 'Qualche tempo prima' probabilmente significa diciannove anni, poiché quello è il momento in cui il pianeta è stato colpito da uno sciame di eruzioni solari molto forti che hanno interrotto ogni comunicazione e cambiato il clima stesso, provocando un'ecatombe degli abitanti. Nonostante i sensori non rilevino forme di vita, però, dal pianeta sta giungendo un segnale...

Neelix e Tuvok si trovano su un pianeta a cercare nuove piante per il giardino botanico, selezionando un'incredibile varietà di orchidee aliene. Nonostante Tuvok coltivi orchidee nel suo tempo libero, non riesce a far trasparire emozioni sull'incredibile varietà del pianeta, e Neelix se ne dispiace. Nel frattempo, sulla Voyager, Kim sta rimettendo in funzione il teletrasporto, che aveva avuto alcuni piccoli guasti di poco conto. Al momento di teletrasportare Tuvok e Neelix dalla superficie, però, Kim si accorge che i guasti non sono finiti... A bordo, infatti, si materializza soltanto una persona, né Tuvok, né Neelix, bensì un miscuglio di entrambi!

Sul prato verde di uno splendido pianeta, sono stati posti due contenitori per la stasi. Al loro interno, il capitano e il primo ufficiale della Voyager stanno apparentemente dormendo. D'un tratto vengono risvegliati dal dottore di bordo: dopo diciassette giorni di stasi non è ancora riuscito a trovare una cura per il virus che ha attaccato Janeway e Chakotay. L'unico trattamento sembra... la permanenza sul pianeta, che fa da schermo naturale contro il propagarsi del virus. Il dottore non ha altre opzioni, tranne quella di suggerire al Capitano di contattare i Vidiani: con la loro avanzata tecnologia medica potrebbero forse aiutarli. Il guaio è che i terribili alieni potrebbero invece approfittare dell'opportunità per raccogliere qualche organo di cui hanno bisogno sfruttando i corpi in salute dell'equipaggio. Janeway allora decide di dare il comando della nave a Tuvok, con l'ordine di non contattare i Vidiani e di riprendere la rotta verso la Terra!

Una nuova orchidea è nata sulla Voyager, grazie agli sforzi del signor Suder, che dopo la fusione mentale con Tuvok ha scoperto l'amore per la botanica nel suo stato di confinamento forzato. Suder vorrebbe adattare le tecniche genetiche usate per la coltivazione delle nuove orchidee per aumentare la produttività delle serre che forniscono il cibo all'equipaggio. Tuvok gli promette di parlarne a Janeway. Mentre il capo della sicurezza sta controllando il prigioniero, la Voyager incontra una boa che sta spedendo un messaggio: la registrazione di una disperata richiesta d'aiuto di Seska. La donna ha dato alla luce il bambino, ma quando il Maj del gruppo Kazon a cui era legata ha scoperto che non era suo, ha cercato di portarglielo via!