Bloom begeleidt Stella naar het Shoppingrijk om haar te helpen een jurk uit te zoeken voor het prinsessenbal. De Trix, die zijn opgesloten in de Omega Dimensie, bevrijden de machtige Valtor. Ze vluchten gezamelijk naar Andros.

Valtor en de Trix installeren zich op Andros terwijl de Winx zich naar Solaria begeven voor het verjaardagsfeest van Stella. Cassandra en haar dochter Chimera spannen samen tegen Stella.

De Winx ontsnappen aan de koninklijke lijfwachten van Solaria. Ze brengen Stella weer veilig terug naar Alfea, maar ze is zó veranderd dat ze zich niet aan Brandon durft te vertonen. Om haar uiterlijk van vroeger terug te krijgen, gaan de Winx en de Specialisten op zoek naar de spiegel der waarheid.

Bloom, Flora, Techna, Musa en Layla reizen allemaal naar het Realm of Tides. Stella blijft achter bij Alfea om ervoor te zorgen dat de docenten er niet achter komen dat ze de campus zonder toestemming hebben verlaten.

De Winx Club gaat naar de bodem van de oceaan waar ze een legendarisch zeemonster tegenkomen en proberen Layla's zicht terug te krijgen.

De bende probeert aan het nablijven te ontsnappen en naar een feest op Erakylion te gaan. Ondertussen leren Layla en Stella de prinses van Bloom. Baltor heeft opnieuw niets goeds van plan met de heksen en zelfs prinses Diaspro. Mevrouw Faragonda vertelt ons enkele geheimen over het mysterieuze verleden van Blooms.

Het is Erakylion's millenium feest en prinses Diaspro heeft een paar trucjes in petto voor Bloom en prins Sky.

Kunnen Bloom en de Winx Club Skye redden van de kwaadaardige klauwen van Diaspro voordat het te laat is?

Baltor neemt de wolkentoren over en brengt de heksen onder zijn controle en dwingt hen om Alfea aan te vallen nadat hij Griffin gevangen heeft gezet. De feeën vechten tegen de heksen terwijl Baltor de strijd aangaat met Farragonda!

Terwijl de Winx Club op zoek gaat naar Faragonda, bevinden ze zich in Cloud Tower - oog in oog met Baltor!

De Winx Club gaat naar Flora's thuisplaneet om hulp te zoeken bij het verbreken van de betovering van mevrouw Faragonda. Flora's jongere zus, Miele, gaat mee. Flora verdient haar Enchantix nadat ze haar zus heeft gered van de vergiftigde tranen van de zwarte wilg en de trix (die wordt gestuurd om te voorkomen dat ze de tranen verzamelen) in de tranen van de zwarte wilg dumpt, waardoor ze in kleine meisjes veranderen.

Valtors verovering van de thuiswereld van Aisha (Layla) dreigt zowel de planeet Andros (Tides) als de Omega dimensie te vernietigen. De Winx Club moet de vernietiging en de ontsnapte gevangenen uit de Omega Dimension stoppen, en een van hen zal uiteindelijk een groot offer moeten brengen om dit te doen. Als vrijwilliger om het portaal zelf te sluiten, verdient Tecna haar Enchantix in het proces - maar is schijnbaar voor altijd verloren in het Omega-portaal.

Gekweld door het verlies van Tecna, gaan de vijf Winx Club de confrontatie aan met Valtor bij wolkentoren.

Bloom komt aan op Pyros, een eiland bewoond door draken, waar ze onmiddellijk wordt aangevallen en vastloopt. Ze ontmoet een draak die vriendelijk is en haar leert hoe ze een draak moet zijn. Ondertussen, terug op Redfountain, besteedt Timmy al zijn tijd aan het vinden van Techna in de Omega dimensie via zijn computers.

Bloom vervolgt haar verkenning van Pyros en ontmoet een tovenares genaamd Mya, die aanbiedt om Bloom te trainen en haar te helpen sterker te worden. Ondertussen arriveren de Winx Club en de specialisten bij benadering bij Techna's locatie in de Omega dimensie. Terug op Pyros moet Bloom alleen tegen de Trix vechten, maar door in zichzelf te geloven en weigeren toe te geven aan Valtor, verdient ze haar volwaardige Enchantix en gaat ze terug naar Alfea.

Sky en Bloom redden Tecna. Nadat ze van een richel zijn gevallen, vinden Tecna en Bloom de andere Winx-meisjes, die vastzitten door ijsslangen. Met hun hulp weten ze te ontsnappen met de Specialists. De Winx Club en de Specialisten keren terug naar Alfea, waar de meisjes hun hereniging vieren met een feestje.

Valtor kondigt zijn plan aan om een relikwie te stelen in verband met de vernietiging van Domino. Ophir, die geïnteresseerd is in Aisha (Layla) omdat zij zijn verloofde is, helpt de Winx bij het verdedigen van het museum.

Gravin Cassandra kondigt plannen aan om met Stella's vader te trouwen, wat Stella en de Winx Club ertoe aanzet de bruiloft te laten crashen. De jongens helpen hen met het fietsen zodat ze zich kunnen gedragen als een fietsbende, vanwege de strakke beveiliging. Uiteindelijk keert Stella de effecten van Cassandra's magie op haar vader om.

Terwijl de Winx Club weg is op een missie, verdedigen Pixies hun dorp tegen Icy, Stormy en Darcy die uiteindelijk winnen.

De Winx-club gaat verder met een plan om Valtor te verslaan door naar het gouden koninkrijk te gaan. Ophir wordt een verstekeling op hun missie. Ze worden aangevallen door pegagaurds en worden bewusteloos achtergelaten.

Om de water sterren te krijgen die Valtor kunnen verslaan, moeten Stella, Musa en Tecna hun weg vinden door een doolhof met obstakels die hun toewijding om de sterren te bezitten op de proef stellen.

Valtor daagt de drie schoolhoofden uit tot een duel. De Winx Club bepaalt het duel als een afleiding om de directeurs te bezetten terwijl de echte Valtor in Alfea breekt.

De Winx Club gaat op zoek naar de ontbrekende Cloudtower-crypten om contact op te nemen met de drie heksen die Domino hebben vernietigd. Ondertussen schenkt Valtor de Trix Disenchantix-vaardigheden die de Winx vernietigen met gecombineerd feeënstof.

Valtor laat een spreuk van de vier elementen, vuur, water, wind en aarde, los om Magix te veroveren. De Winx Club is vastbesloten om hem voor eens en voor altijd te stoppen, behalve Bloom denkt iedereen dat Valtor voorgoed verdwenen is.

Valtor overleeft de aanval en lokt de Winx Club in de val door hun vriendjes te ontvoeren. Bloom is vastbesloten om Sky te redden en Valtor voorgoed te stoppen.