De gevreesde feniks Darkar wil van de elven de plaats van hun dorp weten om zo de geliefde codex in handen te krijgen. Fee Layla probeert de elven te helpen en belandt uiteindelijk volledig uitgeput op de Alfea school bij de Winx die net een nieuw schooljaar begonnen zijn.

Layla is buwesteloos in de slaapkamer van de Winx Club en Lord Darkar gaat naar de Light Haven - de bootcamp van de Do-Gooder waar Icy, Stormy en Darcy worden vastgehouden. Hij breekt ze uit om zijn kwaadaardige leger te worden. Hij geeft ze ook een belangrijke upgrade van hun krachten.

Stella en Brandon worden gescheiden van hun vrienden en bevinden zich in het ondergrondse koninkrijk Neerland.

Bloom en de anderen vallen Lord Darkars bolwerk aan en zijn vastbesloten om de elfen te bevrijden. Maar ze worden tegengewerkt door de Trix-heksen.

Bloom en de anderen reizen naar Neerland, waar Brandon is opgesloten en wordt gedwongen te trouwen met prinses Amentia.

Bloom en Stella brengen de elfen naar Alfea. Ze worden herenigd met de andere Winx, maar nu is er een nieuwe bedreiging.

Sky en de Specialisten nodigen de elfen uit op een openingsfeest bij de Red Fountain-school. Daar ontmoet Flora de knappe dichter Helia.

Er is een nieuwe professor op school. Professor Avalon is knap en kan vliegen met glanzende vleugels.

Op de Red Fountain-school voor Specialisten bezoeken Bloom en Tecna Sky en Timmy, net als de Trix-heksen aanvallen!

De elfen maken plezier, maar ze worden getroffen door een kwade toverspreuk die ervoor zorgt dat ze heimwee krijgen naar het elfendorp.

Een jongen genaamd "Jared" is verliefd op Musa en wil met haar uitgaan. Later betovert Darcy Jared om de magische kamer te jinxen, en de Winx Club moet hun krachten bundelen om het monster te verslaan.

Wanneer Bloom besluit terug te gaan naar de aarde, besluiten Layla, Musa en Stella zich bij haar aan te sluiten. Als sommige gangsters Musa betrappen met magie, is het aan de Pixies om ze te redden!

Prins Sky keert samen met Bloom, Flora en Brandon terug naar het koninkrijk Eraklyon. De kwaadaardige Yoshinoya heeft Sky's voormalige verloofde ontvoerd.

Musa en de andere Winx voeren een zang- en dansshow op tijdens het Red Fountain-toernooi, maar Musa's strenge vader kan het niet goedkeuren.

De Winx meiden worden uitgenodigd op een feest bij Mitzi. De voortekenen zijn al niet best maar het feest is nog vreselijker. Niemand doet gezellig en doordat alle gasten op het feest verkleed zijn is niemand zichzelf. Zijn de geesten dan ook wel echte geesten of zijn deze ook verkleed?

Bloom en de rest van de Winx gaan naar de wolken toren om meer te weten te komen over de duistere magie van de heksen. Mirta en Zing gaan mee om te helpen. Daar worden ze aangevallen door Icy, Darcy en Stormy, die proberen nog een stuk van de codex te stelen!

De Winx proberen de Wolkentorenschool te beschermen tegen de kwaadaardige Trix, maar ze worden gescheiden.

Professor Avalon stuurt Bloom op een magische reis om meer over haar krachten te ontdekken, maar ze ontmoet een mysterieus schaduwvirus.

De Winx, de Specialisten en de elfen reizen naar de Wilde landen. Als ze in de problemen komen, ontdekken Bloom en de anderen dat magie hier niet werkt.

Lord Darkar stuurt de Trix naar de Wilde landen om Bloom te vangen, die daar op vakantie is met de elfen en de Specialist.

Bloom en haar vrienden zitten gevangen in het bos met de Trix op hun hielen. Timmy komt met een plan om de Trix in de val te lokken.

Twee feeën brengen de zieke Pixies terug naar de Boom des Levens om beter te worden.

Het lukt Lord Darkar om Bloom te ontvoeren. De elfen, Specialisten en resterende feeën gaan op een reddingsoperatie.

Om Bloom te redden van Lord Darkar, bestormen de feeën, elven en Specialisten zijn ondergrondse burcht.

Lord Darkar gebruikt duivelse spreuken om Bloom in zijn macht te houden. Met haar kracht kan hij de mystieke Relix ontgrendelen en heersen over alle magische dimensies.