Bloom, une adolescente sans histoire de 16 ans, découvre qu'elle a des pouvoirs magiques... Comment va-t-elle réussir à convaincre ses parents de la laisser aller à l'université d'Alféa ?

Après son admission à Alféa, Bloom se retrouve dans la même chambre que quatre autres apprenties fées: Stella, Flora, Musa et Tecna. Les jeunes filles se baptisent les "Winx".

L'entraînement des futures fées dans le mystérieux marais de la Tortue Noire est interrompu par un atterrissage d'urgence des Spécialistes...

Stella reçoit une invitation du Prince Sky. Ce rendez-vous n'est en fait qu'un piège des trois sorcières pour la kidnapper...

Défiant à nouveau les trois sorcières, les Winx réussissent à s'échapper mais elles tombent accidentellement dans une crypte...

Faragonda, la directrice d'Alféa, punit les fées d'être allées à la Tour Nuage en leur faisant nettoyer l'école sans pouvoirs...

Pour briser l'amitié entre les Spécialistes et les fées, les sorcières élaborent un plan diabolique: elles s'arrangent pour que Bloom soit responsable de l'accident de Riven.

Musa, qui vient de se disputer avec Stella, est attaquée par les sorcières. Bloom va à son secours et sauve son amie en dégageant une énergie similaire à la force du dragon...

Pendant la période des examens, Darcy aide Bloom à s'entraîner. Malgré les difficultés, Bloom parvient à gagner tous les combats !

Pour l'épreuve de potion, Flora va chercher une fleur rare dans le marais de la Tortue Noire. Les Winx s'aventurent ensemble dans le marécage, et doivent déjouer toutes sortes de pièges.

Tout le monde est toujours très occupé à préparer les examens sauf Stella, qui préfère braver les sorcières à "Miss Magix", un concours de beauté.

Bloom retourne à Gardénia pour rendre visite à ses parents. Ils lui révèlent alors le grand secret de son passé. Bouleversée par cette nouvelle, elle met tout en oeuvre pour éclaircir ses origines.

Bloom, Tecna, Timmy et Brandon rejoignent la "Crypte" pour connaître les origines de Bloom. A leur grand étonnement, ils apprennent que Bloom serait une sorcière !

Bloom bouscule le professeur Wizgiz, qui fait tomber accidentellement une enveloppe cachetée: le QCM pour le test du lendemain ! Les Winx vont-elles résister à la tentation ?

Pour obtenir la force du Dragon, les Trix jettent un sort: un monstre prend possession des pouvoirs des Winx, devenant ainsi très puissant. Comment les Winx vont-elles le vaincre sans leurs pouvoirs ?

Bloom découvre par hasard les secrets que cache Brandon: il ne serait pas un simple écuyer et il aurait une fiancée, la princesse Diaspro.

Les Trix attaquent Bloom pour lui prendre ses pouvoirs. Elles se révèlent alors être les vieilles sorcières qui ont détruit le monde de Domino. Bloom serait-elle la dernière fée du pays des fées ?

Les Trix prennent possession de la Tour Nuage et y emprisonnent tous ceux qui ne les ont pas soutenus dans leurs plans démoniaque pour conquérir Magix. Que peuvent faire les Winx pour sauver Magix ?

Faragonda accepte finalement de laisser Bloom et ses amies explorer le monde détruit de Domino à la recherche de la force du feu du dragon qui pourrait sauver Magix... Mais gare à la féroce Icy !

Les Winx atteignent les ruines de l'ancien palais royal de Domino. Bloom y trouve une couronne et ses souvenirs lui reviennent. Mais il faut contrer les attaques de la sorcière Icy !

Les fées d'Alféa avec Riven, les Spécialistes de Fontaines Rouge et leurs professeurs se préparent à un combat de revanche ! Par groupes, ils essayent d'entrer dans la Tour Nuage.

Toutes les fées s'unissent à la Tour Nuage pour vaincre les 3 sorcières. Cependant, au moment où Bloom est sur le point de récupérer la force du feu du dragon comme une flamme incandescente, Icy l'en empêche.

Le siège des sorcières détruit Alféa et toute résistance est vaine. Les sorcières sont sur le point de conquérir la totalité de Magix... Bloom guidée par la voix de Daphné pourra-t-elle sauver Magix ?

Les sorcières souffrent de leurs différentes défaites. Icy met Bloom au défi: une bataille décidera qui est la meilleure gardienne de la force du feu du Dragon.

Contre toute attente, la bataille finale révèle la victoire de Bloom. La directrice décrète alors que toutes les fées et sorcières ont réussi leur année sans passer les évaluations finales !