Bloom, una joven terrestre, vive en la Tierra, en un pueblo llamado Gardenia con sus padres: Mike y Vanessa. Tiene una mascota: Kiko, su fiel conejo y compañero de aventuras. Un día de vacaciones, ella fue al parque con su bicicleta nueva con Kiko. Deja la bicicleta estacionada, se sienta bajo un árbol y se dispone a comer una manzana. Aparece Kiko muy asustado y Bloom lo sigue para ver qué ocurre. Se asomó y vio a una chica con alas en su espalda, con un gran cetro de plata y luchando contra unos monstruos. Cuando el hada casi estaba derrotada, Bloom la ayuda y todos los monstruos quieren atacarla. Sin saber lo que hacía, Bloom extendió su mano y salió un campo de energía la cual le permitió que no le hicieran daño. El jefe de la banda de monstruos (Knut, un ogro) se dio cuenta de que Bloom no era una chica normal, y decidió atacarla por segunda vez.

Bloom deja la Tierra para ir con Stella a Alfea. En la escuela Bloom se hace pasar por la princesa "Varanda de Calixto" para poder entrar. La directora Faragonda les da la bienvenida, Bloom y Stella van a su cuarto y allí conocen a sus compañeras Flora del Musa y Tecna, las cinco van a la ciudad a festejar su llegada a Alfea pero Knut, el ogro que había atacado a Bloom y Stella en Gardenia, las ve en la ciudad e informa a tres misteriosas brujas de Torre de Nubes: las Trix (Icy, Darcy y Stormy). Mientras tanto, Bloom llama a su casa para hablar con sus padres pero en ese momento ve a Knut y lo sigue. Cuando él está hablando con Icy, Darcy y Stormy, Bloom los está espiando,

Alfea y la escuela vecina de especialistas Fuente Roja organizan como todos los años un baile intercambio de regalos pero mientras las Winx ayudan a Bloom a encontrar un vestido para el baile, en Torre de Nubes la directora Griffin le ordena a las brujas arruinar ese baile y que oirá las propuestas de todas. Las Trix (Icy, Darcy y Stormy) le dan su propuesta a la directora y ella le dice que es la mejor que ha escuchado y que espera que no las decepcione. Las Trix aparecen en Alfea pero Bloom escuchó todo este plan y alerta a sus amigas Winx. Ellas desembrujan los regalos mientras que Bloom le dice a Stella que las Trix planean robar su anillo. Ella lo esconde y lo cambia de lugar. Bloom ve que las Trix sacan del joyero de Stella su anillo de Solaria, ella trata de recuperarlo enfrentándose a ellas. Cuando estaba a punto de ser vencida Bloom se transforma por primera vez en hada pero aun así no logra detener a las Trix.

Las Winx participan en una excursión que consiste en una prueba: tienen que atravesar el pantano de Barro Negro sin usar magia. Los especialistas transportaban el duende rastreador de Knut a la cárcel de Magix. Las Trix al enterarse de esto van a rescatar al duende rastreador para que no confiese y hable acerca de ellas. Cuando la nave volaba encima del pantano las Trix liberan al duende y la nave cae justo donde las Winx estaban. Ellas les dicen que los ayudarán a buscar al duende. Cuando lo encuentran está tratando de atacar a otras hadas, sin embargo al tratar de capturarlo no lo logran y las demás hadas se burlan de ellos. Mientras tanto las Trix encuentran al duende y lo hacen desaparecer para siempre, cuando las Winx llegan al lugar donde ellas habían estado ni ellas ni los especialistas entienden que fue lo que pasó.

Stella es invitada a ir a una cita a ciegas con el príncipe Sky en un restaurante llamado “La laguna negra”, las Winx la ayudan a elegir su ropa y joyas, Stella le dice a Bloom que guarde su anillo y se lo entrega. Ella se va a su cita, y a la mañana siguiente Stella aparece muy rabiosa e ignorante. Cuando Bloom intenta hablar con Stella, ella le exige a Bloom que le devuelva su anillo. Desaparece y las Winx, dudosas, preguntan a Sky y les enseña la nota que Stella les mostró. Él les dice que nunca escribió esa carta y que esa ni siquiera es su letra. En eso llega Brandon y él dice que tampoco tiene ni idea. Las Winx buscan en Magix y, con ayuda de un misterioso hombre, encuentran la tal Laguna Negra. La Stella que atacó a Bloom en Alfea es en realidad Darcy, y aparecen las otras Trix.

Bloom despierta cierta curiosidad acerca del Dragón (creador del Universo). Las Trix tratan de robar el llamado "Fuego del Dragón" del anillo de Stella pero fracasan. Las Winx llegan a Torre de Nubes por la noche y recuperan el anillo de Stella. Al buscar la salida, descubren el Archivo de la escuela. Cuando Bloom toca un libro la directora Griffin se entera de la presencia de las hadas y les juega unas bromas de pésimo gusto. Las Winx superan el peligro y después entran a una pequeña sala desordenada, ahí las ataca otro monstruo. Stella exagera al derrotarlo y provoca un incendio en la habitación. Rodeadas por el fuego, una misteriosa y amable voz le susurra a Bloom: “ven, Bloom, yo te llevaré a un lugar seguro”. Ella sigue la voz y todas logran salvarse. Cuando regresan a Alfea la directora Faragonda y Griselda las estaban esperando. Como castigo por infiltrarse en Torre de Nubes, las Winx pierden sus poderes temporalmente.

Tras los acontecimientos en Torre de Nubes, han castigado a las Winx con la pérdida temporal de sus poderes. Griselda les ordena limpiar toda la escuela y hasta se pierden el concierto de Magix. Las Winx deciden invitar a los especialistas a una fiesta mientras no hay nadie. Aprovechando la ausencia de todos en Alfea, las Trix se infiltran en la escuela y usan sus "Reliquias Aspiradoras" para detectar el Fuego del Dragón. Sueltan un monstruo para entretener a las Winx. Las Winx tratan de detener al monstruo a pesar de no tener poderes, y logran vencerlo con la ayuda de los especialistas. Las Trix entran en la oficina de la directora Faragonda, al igual que las Winx y los especialistas. Faragonda felicita a las Winx, agradece a los especialistas y regaña a las Trix. Y las Winx recuperan sus poderes.

La misteriosa voz que le habló a Bloom en Torre de Nubes vuelve a aparecer. Una extraña mujer contacta a Bloom mediante sus sueños. Ese día, había en la ciudad de Magix una gran celebración conocida como "la Fiesta de la Rosa". Tanto Bloom y Riven caen en una trampa de las Trix, que quieren separar la amistad entre las Winx y los especialistas.

Bloom tiene otro mensaje, en sus sueños, de la misteriosa mujer, que se presenta como "Daphne". Bloom investiga sobre la ninfa Daphne pero no encuentra lo que buscaba. Stella y Musa se pelean y Musa se marcha a Magix. Ella se reúne con sus amigas Winx y los especialistas para enfrentar a las Trix y a Riven. El poseedor del Fuego del Dragón se revela.

Bloom realiza un examen en el simulador y las Trix envían réplicas de sí mismas para confirmar una hipótesis sobre Bloom. Lucha contra ellas, y lo confirman: Bloom posee el Fuego del Dragón.

Flora cuenta con la ayuda de las Ninfas del Agua en la búsqueda de un Gladiolo especial. Las Ninfas del Agua piden a las Winx que destruyan un monstruo que se las aterroriza, y las Winx triunfan.

Stella entra en un concurso de belleza, al igual que Lucy de Torre de Nubes, con la ayuda de las Trix para falsificar el concurso pero al final descubre que fue traicionada por ellas. Stella logra ganar y empiezan las vacaciones de invierno en Magix. Pero Stella no logra aprobar el examen del simulador y le dan una nueva oportunidad.

Bloom vuelve a la Tierra durante las vacaciones. Allí Bloom descubre que puede ver las almas de las personas. Un mal acuerdo de negocios en la florería de su madre provoca que un hombre incendie la tienda. Al estar entre el fuego, Bloom, tiene una visión donde es rescatada de un incendio cuando era un bebé y descubre que es adoptada.

Bloom vuelve a la Tierra durante las vacaciones. Allí Bloom descubre que puede ver las almas de las personas. Un mal acuerdo de negocios en la florería de su madre provoca que un hombre incendie la tienda. Al estar entre el fuego, Bloom, tiene una visión donde es rescatada de un incendio cuando era un bebé y descubre que es adoptada.

Las Winx tienen que hacer un examen del profesor WizGiz. Faragonda le cuenta a Bloom la historia sobre la ninfa Daphne y, mediante una visión, Daphne le entrega a Bloom una brillante corona de cristal. Muy curiosa, Bloom reflexiona sobre estos últimos datos y accidentalmente encuentra las respuestas del examen de WizGiz. Tras muchos intentos de resistirse a la tentación de leer las respuestas, las Winx sacan la mayor puntuación en el examen.

En otro intento de apoderarse del Fuego del Dragón, las Trix envían un monstruo para que las Winx tengan pesadillas y se debiliten, que se hace más grande cada vez. Pero fracasan gracias a Faragonda que ayuda a destruir el monstruo y logra que las Trix sean expulsadas de Torre de Nubes por Grifin, la directora del centro.

Dudando mucho de Brandon, Bloom, con ayuda de sus amigas, se infiltra en Fuente Roja durante una gran exhibición. Tras una batalla con la princesa Diaspro, Bloom descubre que Brandon es el verdadero príncipe Sky de Eraklyon y se entristece, tomando una dolorosa decisión.

Bloom escapa de Alfea y vuelve a la Tierra después de descubrir la verdad de Sky, triste y angustiada. Las Trix se aprovechan de la situación y viajan a Gardenia, atacando a sus padres. En el momento que Bloom se debilita, las Trix le explican que las brujas ancestrales (antecesoras de las Trix) destruyeron Domino para robar el Fuego del Dragón con ayuda de Mandrágora, pero Daphne (la hermana de Bloom) la salvó enviándola a la Tierra. Tras desmayar a Bloom, las Trix arrancan el Fuego del Dragón del interior de Bloom y desaparecen. Luego aparece Stella y las dos vuelven a Alfea.

Bloom vuelve con Stella a Alfea tras los acontecimientos en la Tierra. Muy deprimida y triste, le explica a Faragonda lo sucedido y este es el inicio de una terrible crisis. Las Trix, más fuertes que nunca por el Fuego del Dragón, atacan Torre de Nubes y convocan el Ejército de la Oscuridad. Un gran ataque se abalanzó contra Fuente Roja y Alfea pero fue en vano.

Para derrotar la suprema magia que poseen las Trix, las Winx deben ir al abandonado planeta Domino para encontrar un modo de recuperar el Fuego del Dragón y enfrentar a sus enemigas. Knut, el ogro de las Trix, huye de Torre de Nubes y se une a Alfea. Fuente Roja es destruida por las Trix y Bloom desaparece en un abismo.

Para derrotar la suprema magia que poseen las Trix, las Winx deben ir al abandonado planeta Domino para encontrar un modo de recuperar el Fuego del Dragón y enfrentar a sus enemigas. Knut, el ogro de las Trix, huye de Torre de Nubes y se une a Alfea. Fuente Roja es destruida por las Trix y Bloom desaparece en un abismo.

El Ejército de la Oscuridad lanza un nuevo ataque contra Alfea, que ahora se ha aliado con Fuente Roja. Aprovechando la ocupación del Ejército, Bloom, Stella, Brandon, Sky y Knut (ahora del lado del bien) como guía asaltan Torre de Nubes con la esperanza de encontrar, en algún lugar del castillo, el Fuego del Dragón. Riven se les une en la misión y su amistad queda restablecida.

El personal (profesorado y alumnos) de Torre de Nubes escapan hacia Alfea. Bloom y Sky parten en moto aérea para distraer a las Trix, pero la moto es destruida y el dúo se detiene en el Bosque Tenebroso.

El personal (profesorado y alumnos) de Torre de Nubes escapan hacia Alfea. Bloom y Sky parten en moto aérea para distraer a las Trix, pero la moto es destruida y el dúo se detiene en el Bosque Tenebroso.

Mientras el Ejército de la Oscuridad lanza su ataque final contra Alfea, Bloom y las otras Winx se enfrentan a las Trix. Musa, Flora, Stella y Tecna derrotan a Darcy y Stormy mientras que Bloom desata todo su poder y derrota a Icy. Magix está a salvo. Las Trix son enviadas al Monasterio Rocaluz y la paz vuelve a Magix. Esa noche, en Alfea, hubo una enorme fiesta en honor a las Winx, y el episodio y la temporada finaliza con el noviazgo entre Bloom y Sky.