Duggan nemzetvédelmi miniszterhelyettes váratlanul megjelenik az irodában, hogy leváltsa Hetty-t és Granger-t. A csapat tagjai, bár nem biztosak benne, hogy állásuk megmarad, folytatják a nyomozást az ellopott radioaktív anyag után...

Callen, Sam, Kensi és Deeks Szíriában elkapják Asakeem-et, de helikopterüket lelövik, és Kensi megsebesül. Nell és Eric próbálják követni a nyomaikat és segíteni nekik, míg Duggan pszichológiai hadviselést folytat: fenyegeti Grangert és gúnyolódik Hettyvel.

Hetty még mindig őrizetben van és próbálják őt szóra bírni. Miután ez nem sikerül nekik, személyesen a miniszterelnök látogatja meg, akivel, mint kiderül régi ismerősök. A nő szabadon távozhat. Kensi még mindig kómában fekszik és egyelőre nem látják az esélyét annak, hogy a közeljövőben felébred.

Mérgezés történik egy partin. A nyomozás során újra felbukkan Zhang Kiu neve. A halottnak hitt férfi némi segítséggel jól tudta működtetni a fekete piaci mozgást. Hetty meglátogatja Kensi ügynököt a kórházban.

Nell-t egy boltvezető randevúra hívja, miután egy gyilkosság során a tulajdonos is gyanúba keveredik. A gyilkosokat megtalálják. Martin anyja túl aggódja magát. Sam Brown-t vallatja, aki egy nő miatt vallja magát téglának.

Egy volt titkos hírszerző 8 év után kénytelen hollétét felfedni, hogy egy ember életét megmentse, ezzel lavinát indítva el. A lányát elrabolják, de őszinteségével segítséget kap így mindketten megmenekülnek. A lány és az apa egymásra találnak.

Egy halászhálóba fennakadt cápa gyomrában NBH-s ügynök holttestét találják. Kiderül, hogy egy drogkartell vezetője az elkövető. Callen beépülni kényszerül egy elmegyógyintézetbe. Kensi ügynök rehabilitációja megkezdődik, ám a lány kétségbe van esve.

Duggan nemzetvédelmi miniszterhelyettes váratlanul megjelenik az irodában, hogy leváltsa Hetty-t és Granger-t. A csapat tagjai, bár nem biztosak benne, hogy állásuk megmarad, folytatják a nyomozást az ellopott radioaktív anyag után.

Callen ügynök apja megint feltűnik a színen, egy bizonyos Catalina miatt. A nőt egy kávézóban megmérgezik, azért, amiért évekkel ezelőtt eltűnt mindenki szeme elől. Callen apja új esélyt kap arra, hogy megmagyarázhassa tettét, miért hagyta gyermekeit magára.

Nellnek az az ötlete támad, hogy most ő hallgatja ki Carl-t a börtönbe. A kihallgatás eredményesnek bizonyul, amikor Natalie neve elhangzik. A lányt gyorsan megtalálják, ugyanis Callen házánál lőtt agyon két álrendőrt. Kensi egyre erősebb és már a lőgyarkolatai is pontosabbak.

Karácsony közeledtével mindenki vásárlási lázban ég. Nicol is épp az ajándékok beszerzését intézi, amikor megtámadják őt az utcán. A lány vétlen, de a barátja kezében fontos dokumentumok vannak.

Miután megölnek egy testőrt, Sam beépül a biztonsági szolgálathoz, hogy megtalálják az elkövetőket. Anna és Cullen a kapcsolatuk következő szintjére lépnek.

Hetty felmondási idejének lejáratával az ügynökséget különböző okok miatt, különböző ügynökségek veszik őrizetbe. Hetty és Kensi meglépnek a SWAT elől.

Hetty különleges tervet eszel ki, először elfogattatja a csapatát, majd amikor már biztonságba tudja őket, kiszöktetni a börtönből Carl-t. A terve jól sül el viszont Kensit elrabolja Sulliven, akit a rehabon ismert meg.

Dicks az idegösszeomlás szélén áll, amiért Kensit nem találják. Sabatino segítségét kérik, ám a végén mégis a kocsiban hagyják, ahonnan megszökik. Kensit épen és egészségesen, sikeresen megtalálják.

Callen ügynök apja újfent borsot tör az NCIS orra alá, méghozzá, egy félreértés miatt. Kensi és Dicks beépülnek a nyugdíjas otthonba, hogy információt szerezzenek egy régi műemlékről.

Sam évekkel ezelőtt beépült egy drogkartellhez, most pedig újra azt a feladatot kapja, hogy találja meg a királyt. Hetty megzavarja Sam és Anna romantikus estéjét, azzal, hogy el kell hozniuk egy elítéltet.

Nell és Eric két napos üdülésre mennek, a közeli erdőbe, hogy a két high-tech zsenit elkaphassák, akik valószínűleg bűnrészesek voltak egy titkos adatbázis feltörésében és az adatbázis tartalmának meglovasításában.

Callen és Hannah különleges, nemzetközi megbízást kapnak. Repülőre szállnak, diplomáciai papírok nélkül, hogy megakadályozzák egy titkos projekt rossz kezekbe kerülését.

Victor Larmont saját feleségét jelenti fel az NCIS egységénél, mert azt gyanítja, hogy titkosított iratokat oszt meg a Kubaiakkal. Időközbe Dicks megtanul táncolni.

Hetty és volt kollegái visszatérnek a vietnámi háborúból. A háború utáni kimenekítés során a társaság hatalmas vagyonra tett szert, ami most rossz kezekbe került. Az eltűnt aranyat vissza kell szerezniük, mielőtt rossz célokra használnák fel.

Az aranyakat megtalálták. A "fiatal" ügynökök sokat tanulhattak a veteránoktól. Owen tiszteletére a veteránok megfogadják, hogy a világot jobbá teszik, a férfi akaratát beteljesítik.

Sam mindenkit maga mögött hagyva indul felesége gyilkosának a megkeresésére. Társai azonban nem hagyják ezt annyiban, megkeresik és együtt kapják el a gyilkost. Sam egy időre otthagyja munkahelyét.