סידורוב מענה את דיקס ואת סם. הסוכנים מגלים שהפצצות ממוקמות על ספינה. ג'אנוויאר מצליח להימלט. סם עוזב את בית החולים כדי לעזור להציל את מישל.

כשמטוס מתרסק, מתברר שהיו בו סגן אדמירל לשעבר ועיתונאי שנוי במחלוקת. הצוות חוקר את המקרה ומגלה שהעיתונאי כתב על פשעי מלחמה ולמעשה המטוס הופל.

מנהל חברת "ביוטק" נהרג מפיצוץ מכוניתו. מתברר שהוא עבד על חיסון נגד ריצין. הסוכנות חוקרת את המקרה והעקבות מובילים לארגון טרור בין לאומי ששמו "אומני".

וסילי חוטף את מי שלכאורה הוא אביו של קלן במטרה להחליף אותו תמורת קלן. קלן יוצא במרדף אחריו והצוות מסייע לו.

חברתו של מומחה לבניית מטוסים ללא טייס, חייל צי לשעבר, נחטפת בעת ריצה. לאחר חקירה, מתברר שהיא נחטפה כדי שהממשלה הסינית תקבל את הטכנולוגיה לבניית המטוסים בתמורה לשחרורה.

לאחר שצוות משולב של הסי-איי-איי, האף-בי-איי והאן-סי-איי-אס פושטים על בניין ונופלים במלכודת, עולים חשדות שיש חפרפרת באחד הארגונים. הסוכנים מנסים לאתר מי הדליף את המידע.

לאחר שמאבטח מסילת רכבת נרצח על הפסים, הצוות חוקר את המקרה ומגלה שהרוצח רוצה לפוצץ את הרכבת כשעליה חומרים מסוכנים.

הסוכנות מנסה למצוא טכנולוגיה לאיתור נשק גרעיני שנגנבה ממשרד האנרגיה לפני שתיפול לידיים עויינות.

קצין מודיעין נמצא מת בבריכה במרכז גמילה. הצוות חוקר את המקרה ומגלה שקבוצה של קיצונים ימניים מעורבת בכך.

קצין נרצח בבחריין וההחסן הנייד שלו, שהכיל תרחישים להשתלטות על הנשק הגרעיני של פקיסטן, נגנב. הצוות יוצא לחפש את ההחסן הנייד האבוד. בינתיים, היחסים בין דיקס וקנזי מתחממים.

הצוות מחפש סוחר בני אדם, בכיר לשעבר ברומניה הקומוניסטית, שברח לארה"ב.

בתו של סנטור שנאבק בצבא השחרור הסיני מותקפת. הצוות נחלץ להגנתה ומנסה למצוא את התוקפים.

הסוכנות מגלה כי כספים עוברים מלוס אנג'לס לתאי טרור באפגניסטן. הם חוקרים את העניין וחושפים תא טרור בלוס אנג'לס.

לאחר שהתגלו שתי גופות בסמטה, הצוות חוקר את המקרה. הם מגלים שהאנשים שמתו עבדו בדי-7, החברה שאת פשעי המלחמה שביצעה חקרו סגן האדמירל והעיתונאי כשמטוסם התרסק.

לאחר שדיפלומט מגינאה המשוונית נרצח והרוצח מזכיר את שמו של טוהן, שכיר חרב לשעבר שעבד עם הטי, סם וקלן נוסעים למקסיקו לאתר אותו. קנזי חושדת שסבסטינו הוא "הרוח הלבנה" ומתעמתת איתו.

הצוות חוקר פיצוץ בשוק הדגים ומתלווה אליו סוכנת שעבדה כסמוייה בשוק. הם מגלים שקיים תא רדום שעומד לבצע פיגוע.

חברו ההאקר של אריק מותקף. הסוכנות בודקת את המקרה ומגלה שהצ'צ'נים גנבו את תוכנת אפס הימים שלו כדי להשתלט על מערכת ניווט לוויינים רוסית.

הצוות נוסע לאפגניסטן כדי למצוא את קנזי. דיקס חוקר איש דת בזמן שסם וקלן יוצאים לשטח ועוקבים אחרי שליח טליבאן.

לאחר שנחת לשעבר בורח מסוכני אל-קאעידה, הצוות מחפש אותו ואת הכסף שגנב מעיראק לפני שיגיע לידיהם.

הצוות מחלץ סוכן חשאי שנעדר זמן רב. הם חושדים שהוא עבר לצד השני ונעזרים בו כדי למצוא 500 ק"ג של סמים שהוברחו למדינה.

בתה של מכרה של סם נחטפת, והצוות יוצא לחלצה ומגלה שהיא משמשת כקלף מיקוח עבור כנופיית טרור שגנבה מזל"ט.

לאחר פיצוץ של מכונית תופת באירוע צדקה של חיל הנחתים שבו נהרגו 3 אנשים, הצוות חוקר את המקרה ומגלה שיש פצצות נוספות.

פרק סיום העונה. לאחר שהתגלתה גופתו של רס"ן ששירת בצוללת גרעינית, הצוות חוקר את המקרה.