Alors que Callen soupçonne Hetty de garder des secrets sur son passé et que Joelle fait surface dans sa quête pour capturer Katya, le NCIS doit traquer un informateur dont la vie est en danger. Aussi, Kensi et Deeks travaillent pour élargir leur famille.

Le NCIS prend l’affaire personnellement quand le père d’un officier de la LAPD, un vétéran américain âgé bien-aimé, est victime d’un crime haineux vicieux.

Alors que Callen continue de chasser Katya, Kilbride enrôle le NCIS pour aider à trouver un camion d’armes volées. La tâche devient plus difficile lorsque leur suspect, le fils d’un patron de la mafia qu’ils croyaient être le revendeur, est retrouvé mort.

Une mission du NCIS pour protéger un agent infiltré compromis ne se déroule pas comme prévu. Les agents sont interrogés individuellement pour savoir ce qui s’est réellement passé. Kilbride doit prendre une décision difficile.

Sam négocie et Rountree va sous couverture, quand un homme prend un bus rempli d’otages et menace de le faire exploser à moins que les crimes de guerre de sa fille ne soient effacés à titre posthume.

Le NCIS enquête sur le suicide apparent d’un officier du renseignement de la Navy après avoir pris du LSD. En outre, pendant que Kensi est absente, Deeks fait des plans pour refaire la cour arrière sans son avis.

L'équipe du NCIS se démène pour retrouver Kensi, lorsqu'elle est attaquée et kidnappée par un mystérieux groupe de milices tout en aidant un groupe de migrants à traverser la frontière.

L’équipe du NCIS aide une ambassadrice des États-Unis à rechercher sa fille disparue, Gia (Caitlin Carmichael), une influenceuse populaire dans les médias sociaux. En outre, l’agent Aliyah De León revient pour soutenir l’équipe avec le cas. (Partie 1)

Quand un scientifique civil travaillant avec les marines est tué, et sa technologie radar de pointe volée, l’équipe du NCIS doit se dépêcher de trouver la technologie manquante et le coupable. (Partie 2)

Lorsqu'un nouveau-né est retrouvé abandonné sur un navire de la marine, Kensi et Deeks recherchent la mère à bord avant qu'elle ne meure de complications. De plus, Nate (Peter Cambor) rencontre l'amiral Kilbride et découvre le projet de la CIA des années 70 et 80 impliquant des enfants.

L'équipe du NCIS enquête sur un avion non identifié qui vole dans l'espace aérien américain et s'écrase sur un porte-avion de la Marine. Aussi, Deeks et Kensi commencent à se préparer pour leur inspection de famille d'accueil.

Lorsque le partenaire de l’agent Lance Hamilton du ministère de la Justice est tué, Sam enfile son ancien personnage d’infiltration de « Switch » pour trouver le coupable. De plus, Kensi, Deeks, Roundtree et Kilbride travaillent pour attraper un ingénieur aérospatial qui a volé des schémas classifiés de la Marine.

Le NCIS enquête sur le vol d’un stockage artistique haut de gamme en se faisant passer pour des acheteurs potentiels sur le marché noir, pour trouver qui est derrière les objets volés.

Rountree et sa sœur cadette sont arrêtées par la police et traitées durement dans un cas évident de profilage racial. En outre, le NCIS enquête sur la mort d’un photographe de la Marine qui a été chargé de documenter la construction d’une nouvelle station d’armes.

Le NCIS enquête sur l’enlèvement du sergent-chef Boomer, un chien de travail militaire. De plus, Sam cherche à vendre son bateau pour pouvoir prendre soin de son père qui souffre d’Alzheimer.

L’équipe du NCIS aide l’officier du renseignement naval Akhil Ali (Ashwin Gore) à trouver un collègue qui a été porté disparu alors qu’il recrutait des biens étrangers comme sources potentielles de renseignements. Aussi, Callen et le psychologue Nate Getz traquent un homme que Callen croit avoir déjà vu pendant sa formation quand il était jeune.

Le NCIS enquête sur le meurtre d'une femme employée dans le programme de défense antimissile de la Marine et son lien avec la technologie des missiles volés de la Marine. En outre, un travailleur social strict stresse Deeks et Sam débat de la vente de son bateau.

L'équipe du NCIS travaille avec l'agent de la DEA Talia Del Campo (Mercedes Mason) pour trouver un lanceur d'alerte disparu prêt à témoigner contre les fabricants d'armes à feu qui vendent aux cartels de la drogue.

Le NCIS enquête après que deux hommes se soient fait exploser avec leurs propres explosifs alors qu’ils tentaient de pénétrer dans une base militaire. Aussi, Callen veut passer à la prochaine étape avec Anna, et Sam emménage avec son père, Raymond (Richard Gant).

L’équipe du NCIS doit trouver rapidement Callen après qu’il soit tombé dans le piège de Katya en utilisant le deepfake de Sam pour coordonner un deal d’armes.

L’équipe du NCIS chasse une équipe qui vole un casino de Los Angeles avec une puissance militaire. Aussi, Kensi et Deeks entendent des nouvelles passionnantes concernant l’adoption, et Callen fait un grand pas dans sa relation avec Anna.