Callen和Sam与海军上尉Harmon Rabb，Jr.合作，逮捕美国海军“效忠号”上的间谍。此外，Hetty与海军陆战队中校Sarah“Mac”Mackenzie合作，消除了中东的导弹袭击，Kensi和Deeks被困在伊拉克的中央情报局移动部队中，同时受到ISIS的袭击。

面对全球范围内的多起案件，NCIS团队分道扬镳，Callen和Sam在特拉维夫与摩萨德特工Eliana Sapir合作，Kensi在洛杉矶与司法部特工Lance Hamilton合作。

Callen和Sam在一次寻找失踪海军情报官员的行动中为退役海军上将Kilbride提供保护。

当Callen和Sam在“效忠号”航空母舰上时，该舰因可能接触埃博拉病毒而被隔离。此外，Kensi和Deeks调查了一名士官的谋杀案，该士官最近离开了美国海军“效忠号”，并与埃博拉病毒暴露有关。

NCIS团队正在搜寻一幅价值4000万美元的被盗画作，此前网上聊天显示，这幅艺术品正在黑市上出售，以资助恐怖活动。

在一名强大的军火商绑架了瑞奇的女儿，试图获得一个危险的武器系统后，NCIS团队不情愿地与两名来自英国的前罪犯里基·多尔西和弗兰基·博尔顿结盟。

NCIS团队将海底无人机原型的盗窃与视频游戏流媒体精心策划的派对联系起来。此外，Callen和Sam再次与保险经纪人Katherine Casillas相遇，后者为玩家的财产和游行提供保险。

一名海军中尉从车祸现场失踪后，NCIS团队对犯罪现场进行了处理，发现他的笔记本电脑以及最近访问的退役海豹突击队机密信息不见了。

Akhos Laos是一名前黑人特工，最初由Hetty Lange招募和训练，在第250集，她回来为Hetty介绍他的生活复仇

在团队调查电脑病毒失窃案时，Callen和Sam考虑了他们在该机构的未来，Kensi和Deeks讨论了生孩子的问题，Eric和Nell分析了Eric的卧底任务对他们关系的影响。此外，该团队还追踪到了一个狡猾的高档银行家Mara

当一名农业工程师Hetty要求她带到美国时，中央情报局官员Veronica Stephens向团队寻求帮助

在黑市阿片类药物使用导致的死亡人数增加后，NCIS团队将街头毒品与资助恐怖活动联系起来

NCIS小组调查了一名海军作战工程师在口语诗歌活动中被谋杀的事件。此外，凯伦请求内尔协助他在全球范围内寻找安娜的下落。

Anna Kolcheck回来警告Callen，他正处于危险之中，他现在必须与宿敌合作，阻止一个地下贩毒集团。

当法蒂玛在执行任务时被捕并被勒索赎金时，凯伦和山姆招募了一名深度卧底的中央情报局特工卡德里来帮助她回来。

当一名联邦调查局特工在试图追踪卧底特工的位置时被杀，NCIS必须在他调查的罪犯之前找到失踪的特工

当NCIS调查一名正在调查最近不明飞行物目击事件的国防部官员的失踪时，安娜对自己的未来做出了大胆的决定。

在Sam调查一名试图推翻现政权的伊朗流亡人士被谋杀的同时，他还必须设法拯救特工Roundtree，一名新特工，他在上任的第一天意外触发了一枚炸弹，这是一次出乎意料的冒险。此外，内尔决定了她在NCIS的未来。

该小组协助司法部调查一名纵火犯，该纵火犯的目标是保护寻求庇护的政治活动家的联邦调查局安全屋；孙处理内尔离队的善后事宜。

该团队帮助一名前NCIS技术运营商寻找她失踪的前伴侣，他们担心她可能与多年前未能打倒的持枪歹徒合作；Deeks在他的酒吧受到负面评价时大发雷霆。

Sam、Callen和Rountree前往阿富汗，海军陆战队中校Sarah“Mac”MacKenzie在两名海豹突击队员声称他们的首领谋杀了一名手无寸铁的囚犯后，要求NCIS帮助处理一个敏感案件。