Getrennt voneinander versucht das Team weiterhin unter großer Anspannung, ein großes Unheil abzuwehren, um die nationale Sicherheit zu wahren.

Gemeinsam mit Eliana ermitteln Callen und Sam undercover in Tel Aviv, um einem Drogenring auf die Schliche zu kommen.

Eine Navy-Offizierin, die über brisantes Wissen zu Geheimprojekten verfügt, wird entführt. Um sie zu retten, bittet der im Ruhestand stehende Admiral Kilbride die NCIS-Agenten um Hilfe.

Lt. Grant von der USS Allegiance wird tot aufgefunden mit Anzeichen einer Ebola-Infizierung.

Ein vermisstes Gemälde taucht nach zwei Jahren wieder auf. Der Wert des Kunstwerks beläuft sich auf ungefähr 40 Millionen Dollar und es wird vermutet, dass es auf dem Schwarzmarkt gehandelt wurde.

Das NCIS-Team fasst zwei britische Gangster, die in einen internationalen Waffenschmuggel involviert sind.

Die prunkvolle Party des Video-Game-Streamers Zane Von Bohlen wird von einer Schießerei jäh unterbrochen.

Der Personaltrainer Marco Ruiz dreht ein Video für seine Fans, während ein Mann die Kontrolle über sein Auto verliert.

Bei Eric Beale wird eingebrochen. Bei dem Versuch, dem Eindringling zu entkommen, demoliert er einen Wagen der Polizei und wird dafür kurzzeitig festgenommen.

Akhos Laos, ein ehemaliger „Black Ops“-Spezialagent, der ursprünglich von Hetty rekrutiert und ausgebildet wurde, kehrt zurück, um sich an ihr und ihrem Team für das Leben zu rächen, das sie ihm auferlegt hat.

Während das Team den Diebstahl eines Computervirus' untersucht, denken Callen und Sam über ihre berufliche Zukunft nach, Kensi und Deeks sprechen darüber, Kinder zu haben, und Eric und Nell machen sich Gedanken, welchen Einfluss Erics Untercover-Mission auf ihre Beziehung hat.

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Die CIA-Agentin Veronica Stephens, die das Team bereits von seiner Operation auf Kuba kennt, bittet das NCIS-Team um Unterstützung, nachdem der nigerianische Agrar-Ingenieur Dr. Joseph Olonga, den sie im Auftrag von Hetty in die Vereinigten Staaten bringen sollte, in Los Angeles verschwunden ist. Da die CIA selbst nicht in den USA tätig werden darf, benötigt Veronica die Hilfe des Teams.

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Eine gefährliche Droge, die immer mehr Opfer fordert, ist im Umlauf. Das NCIS-Team wird darauf aufmerksam und beginnt, nach der Quelle zu suchen. Der Verdacht, dass mit dem Erlös eine Terrororganisation finanziert wird, bestätigt sich schnell. Jetzt gilt es, die Drahtzieher schnellstmöglich zur Strecke zu bringen ...

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Ein früherer Navy-Angestellter, der zuletzt als Programmierer arbeitete, wurde bei einer Spoken-Word-Performance ermordet. Kensi and Deeks ermitteln an dem Veranstaltungsort, während Sam and Callen beim Arbeitgeber des Ermordeten ermitteln. Außerdem bittet Callen Nell, ihm zu helfen, seine Exfreundin Anna zu finden. Er glaubt, dass Anna in Barcelona in einen Mordfall verwickelt wurde.

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Hettys Ruhestand steht bevor und Callen soll eventuell ihre Position einnehmen. Das bedeutet für ihn weniger Einsätze, dafür aber mehr Verantwortung und somit auch ein größeres Gefahrenrisiko. Auch jetzt muss sich Callen mal wieder einer Bedrohung stellen. Eine verlorengeglaubte Bekannte kehrt nämlich zurück, um ihn vor einem alten Feind zu warnen, der erneut auf der Bildfläche erscheint ...

(Sat.1)

Fatima wird während eines geheimen Einsatzes auf der Sinai-Halbinsel zurückgelassen und daraufhin gefangen genommen. Sie gibt zunächst vor, eine Reporterin zu sein, doch Cobra, der Anführer ihrer Kidnapper, droht, sie vor laufenden Kameras zu töten, falls er nicht eine halbe Million Dollar Lösegeld erhält. Sam und Callen arbeiten mit einem Undercover-CIA-Agenten zusammen, um Fatima zu befreien.

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Das NCIS-Team soll das Verschwinden von Walter Anderson, eines Angestellten des Verteidigungsministeriums, untersuchen. Walter beschäftigte sich mit der Sichtung von Aliens. Zunächst sieht alles danach aus, als sei Walter selbst von Außerirdischen entführt worden, doch dann zeigt sich auf dem Überwachungsvideo eines Nachbarn, dass zur Zeit der Entführung ein verdächtiger Van vor seinem Haus hielt.

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Sam untersucht den Mord an einem iranischen Exilanten, der daran arbeitete, das Regime zu stürzen. Gleichzeitig versucht er, Agent Roundtree zu helfen, einem neuen Agenten, der einen unerwartet abenteuerlichen Tag hat, als er versehentlich eine Bombe zündet. Außerdem versucht Callen, seine Beziehung mit Anna zu genießen, und Nell trifft eine Entscheidung, die ihre Zukunft beim NCIS betrifft.

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Das NCIS-Team muss einem Auftrag des Justizministeriums nachgehen. Ein Safe House, in dem das FBI Zeugen unterbringt, die zum Beispiel gegen Mafia-Bosse aussagen wollen, und deshalb in Lebensgefahr schweben, ist in Flammen aufgegangen und die Behörden vermuten einen Fall von Brandstiftung. G. Callen und Sam untersuchen den Tatort, um die Ursachen des Brands zu klären.

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Das Team hilft einer ehemaligen Kollegin bei der Suche nach ihrem vermissten Ex-Partner. Callen gesteht Sam, dass er sich mit Anna zur Ruhe setzen will.

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Sam, Callen und Rountree reisen nach Afghanistan, um einen brisanten Fall zu klären: Zwei SEALs behaupten, ihr Chef habe unbewaffnete Gefangene ermordet.

(13th Street)